| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3597688 = | 65 (1.910) | 6 (0.180) | 6/244 | 3.2 | 8.5% | intergenic (‑128/‑296) | livK/panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis |
| ? | NC_000913 | 3597710 = | 66 (2.010) | intergenic (‑150/‑274) | livK/panM | leucine transporter subunit/PanD autocleavage accelerator, panothenate synthesis | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCAAAAATCCCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTC > NC_000913/3597562‑3597851 | gTCAAAAATCCCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTAttt > 8:58937/1‑149 (MQ=255) aaaaaTACCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCGTGTATGATTAAGGGGTTAGCGAATTATTTTGTTATATTATAGATTAAAATCCGTAttttt > 3:56918/1‑148 (MQ=255) aaaaTCCCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTAttttt > 5:163506/1‑147 (MQ=255) aaTCCCCATTCTTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATTTGTTTACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTTATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGt < 4:22460/149‑1 (MQ=255) aaTCCCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGt > 4:97181/1‑149 (MQ=255) tGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGaa > 1:28159/1‑147 (MQ=255) tgttgtgttgCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCa < 2:69531/132‑1 (MQ=255) tgttgtgttgCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCa > 1:69531/1‑132 (MQ=255) tgttgCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGataata < 8:42623/148‑1 (MQ=255) ttgCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTc < 3:97181/149‑1 (MQ=255) gCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCt > 7:3360/1‑148 (MQ=255) gCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCt > 6:32845/1‑148 (MQ=255) tttttATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTa < 6:115836/149‑1 (MQ=255) tgtTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTgataga < 8:3360/149‑1 (MQ=255) ttAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTgatagat < 6:163506/148‑1 (MQ=255) ttAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTgatagat > 1:47168/1‑148 (MQ=255) aaTCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGGTAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACa > 2:152942/1‑147 (MQ=255) aaTCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGGTAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACa < 1:152942/147‑1 (MQ=255) gACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGaaaaaa < 7:58937/149‑1 (MQ=255) 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ttttATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGt < 5:32845/148‑1 (MQ=255) tataCTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTgataga < 7:5300/122‑1 (MQ=255) tataCTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTgataga > 8:5300/1‑122 (MQ=255) ataCTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGaa < 8:132343/93‑1 (MQ=255) ataCTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGaa > 7:132343/1‑93 (MQ=255) cACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTGGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATaaaa > 1:27705/1‑148 (MQ=255) cACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATaaaa > 8:119445/1‑148 (MQ=255) aCTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAAt > 2:51332/1‑148 (MQ=255) tGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTAtt < 8:142117/106‑1 (MQ=255) tGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTAtt > 7:142117/1‑106 (MQ=255) tttttGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACgg > 4:111141/1‑149 (MQ=255) tGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGcac < 2:55880/148‑1 (MQ=255) ccTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACaaa < 6:153494/149‑1 (MQ=255) cTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACgg < 3:131354/142‑1 (MQ=255) cTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACgg > 4:131354/1‑142 (MQ=255) aTTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGTGCGGaa > 7:39069/1‑149 (MQ=255) aTTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCg < 1:51332/146‑1 (MQ=255) aTTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGaa > 3:132562/1‑149 (MQ=255) aTTAAGGGGTTAGAGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTTCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCg < 4:56918/146‑1 (MQ=255) ttAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGaa < 7:119445/148‑1 (MQ=255) ggTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCa < 3:111141/149‑1 (MQ=255) cgaaGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCACTATTTTTAATTCGATTAAGAACAGATAATATTATGAATTTATAGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTAGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCTGAATAATTCACTATCa > 4:24692/4‑149 (MQ=255) gcAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGata > 4:93560/1‑60 (MQ=255) gcAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGata < 3:93560/60‑1 (MQ=255) aGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTAtt < 2:3460/74‑1 (MQ=255) aGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTAtt > 1:3460/1‑74 (MQ=255) ttttGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAgg < 2:27705/148‑1 (MQ=255) gtgATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAggg > 5:40107/1‑145 (MQ=255) gtgATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAggg < 6:40107/145‑1 (MQ=255) tgATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTa > 5:72648/1‑149 (MQ=255) ataataGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCa < 1:173118/129‑1 (MQ=255) ataataGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCa > 2:173118/1‑129 (MQ=255) taGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTgg < 7:71186/149‑1 (MQ=255) taGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGACTTTTTCAGCATAAAATAACg > 4:89924/1‑103 (MQ=255) aaaaTCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAtttt < 4:132562/148‑1 (MQ=255) aaaTCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttt > 6:110096/1‑148 (MQ=255) aaaTCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACAttttt > 1:76938/1‑148 (MQ=255) tgccTATTTATCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATACACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATTACTGCAAAAAGTGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCAtt < 3:24692/147‑1 (MQ=255) cccTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGc < 6:132661/69‑1 (MQ=255) cccTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGc > 5:132661/1‑69 (MQ=255) ccTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATtc > 3:76428/1‑148 (MQ=255) | GTCAAAAATCCCCATTCGTGATGTTGTGTTGCTTTGTTTTTATGTGTTAACAAATCAGACTGTTCTTTTTTTATACTGCACTGTTTTTGCCTGTCTGATTAAGGGGTTAGCGCAGTATTTTGTGATAATAGCGATTAAAATCCCTATTTTTCAGTCGATTAAGAACAGATAATATTCTGAATTTATTGATAGATAAACAGAAAAAAGTGCCTTTGTCAGCATAAAATAACGGCACAAAGGGCGGAATAATTCACTATCATTCAGGGGATTATGCTGGACATTTTTCATTC > NC_000913/3597562‑3597851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |