| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2700550 = | 143 (1.100) | 10 (0.090) | 9/242 | 9.8 | 7.7% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
| ? | NC_000913 | 2700601 = | 115 (1.030) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2700714‑2700550‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGA > NC_000913/2700601‑2700748 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG > 1:475042/1‑149ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG < 4:511814/149‑1ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATCTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTTCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTCCTAAGGAACGG > 8:397288/1‑149 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG > 6:517867/1‑149 AAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCTTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG < 3:334065/148‑1 AAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG < 1:514142/148‑1 ACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTT < 3:146740/149‑1 GGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGAATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTT > 6:97579/1‑149 AAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTT < 7:556396/149‑1 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTA < 2:475042/149‑1 AAGCTGGGCTTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTTGTAAGGAACGTGGGTTTTACTTTTTAA < 4:506289/149‑1 AAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 8:549508/149‑1 AAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA > 7:193556/1‑149 AAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 7:345821/149‑1 AAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 7:490294/149‑1 AAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 7:61029/149‑1 TGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACT < 4:518460/112‑1 TGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACT > 3:518460/1‑112 CCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTA > 3:193698/1‑83 CCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTA < 4:193698/83‑1 TTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAGCTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCG > 3:184508/1‑149 ATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGC < 4:184508/149‑1 TTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCT > 2:300875/1‑149 TTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGC < 1:327811/109‑1 TTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGC > 2:327811/1‑109 TAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGC > 2:404354/1‑147 AAACCCCCGAACTGGTTAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCG < 2:231162/144‑1 AAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCacat > 1:231162/1‑145 gtcAGGACCGGGGGGTTTACTTTTTACAGAGCACGGGATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCCTCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCC < 6:373210/126‑1 GTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTGAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTGTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCGCATCTGCCAGCGTTACATTCATATTTGCAACGACCAGCTTTTCC > 5:373210/1‑129 GGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCG > 8:448103/1‑147 GGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTT > 4:294513/1‑115 GGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTT < 3:294513/115‑1 TTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCC > 3:478872/1‑149 TACTTTTTAAATAGAACGGTCTTACTTTTAACTTTAAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTTCAGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGT < 5:372973/148‑1 ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGG > 6:476407/1‑149 ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTG < 1:353296/148‑1 CTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGG < 2:384363/148‑1 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTT > 3:140495/1‑149 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG > 7:68231/1‑149 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT < 3:238830/148‑1 AAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 8:243963/148‑1 AAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGA < 4:146740/149‑1 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2700714‑2700550‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGA > NC_000913/2700601‑2700748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |