| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,985 | 0 | C | A | 25.4% | 109.9 / 11.2 | 63 | intergenic (+87/‑383) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/24); new base A (6/10); total (29/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACA > NC_000913/2560837‑2561128 | gATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTc < 3:27452/149‑1 (MQ=255) cAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGGTCAAAAGt > 7:347290/1‑149 (MQ=255) aGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTGGCCGTGAGTGGTTTCTCAAAAGtt > 3:331918/1‑149 (MQ=255) aaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 7:332855/149‑1 (MQ=255) gggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt < 1:218323/149‑1 (MQ=255) gggAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAAATTTGcct > 8:385595/1‑147 (MQ=255) gTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg > 7:562947/1‑149 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTCCAACATGAAATAACGGAATCAGGCGTGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 5:91707/148‑1 (MQ=255) cAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 7:392862/148‑1 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 4:358924/1‑149 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:158206/149‑1 (MQ=255) cGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 2:566412/149‑1 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATTTTGACTTTAAGGTGGGTCAAAAg > 7:334825/1‑149 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 6:540138/148‑1 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGACGTGTAGGGGGGGCaaaatt > 2:433705/1‑147 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAATTTTGCCGTGTAGGAGTGTCAAttgttg > 3:96097/1‑149 (MQ=255) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGTCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGcc < 1:146569/148‑1 (MQ=255) attattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAAAGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGAGGGGGCAATAGTTGACATTTAGGGGTGTGAAAAGATGACg > 3:57408/1‑149 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTgaagtg > 1:97757/1‑143 (MQ=255) taaGCCGTACAACATGAAATAAAGGCATCCGGCTCGCAATTTTCACGCATTTTCTTTTCCTTTATTCCATGAATTCAGGTGGGGAATTTGTTGGCGTTATTTTTGGGTCAAATCTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 6:269361/147‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAGTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt > 1:271304/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:86051/128‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:77981/128‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 2:86051/1‑128 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 2:77981/1‑128 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGTTCAACAGTTGCCGTTAAGGTTGGTCAAAAATTCCCGtgtat > 1:431630/1‑143 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGTTGGATAAAAAGATGAATTTAAGGATTGTCAAATTTTGACGTCaaacg > 8:70057/1‑146 (MQ=255) gCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 3:358924/149‑1 (MQ=255) acaacaTGAAATAACGGAATCAGTCTGGCAATGTTCCCGCCTTTTGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt < 5:527835/146‑1 (MQ=255) acaacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGGGGGGGTTCAAAAGTTGCCGAGAAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGGTAAGGTTGGTCa > 6:527835/1‑148 (MQ=255) caacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTAGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 1:71070/148‑1 (MQ=255) atcctGAAATTACGGCACCCGTAGGCCATTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGCATTCAGGTGGGCCAAAAGATGGCCTTTGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 8:452758/145‑1 (MQ=21) aacaTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGGGGTGCGGCAAAAGTGGCCGGTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTGaa > 5:84381/1‑137 (MQ=255) caTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGTGTCAAAAGTTGGCGTTAAGGTGGGTGAAATGt > 7:559028/1‑149 (MQ=39) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa > 5:362004/1‑110 (MQ=255) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 6:362004/110‑1 (MQ=255) gAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGGGGTGTCAAAATATGACGTTAAGGGGGGTGaaatgatgg > 1:564802/1‑143 (MQ=255) aaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCGTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGTTTGTGGTGGGTAATATGTTGCCTTTAAGGTGTGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGTGTGAATAGttt > 7:209068/1‑145 (MQ=255) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTTCAGTGAACGTGGGGGAAAATTTGCAGAGAAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTa > 7:234146/1‑149 (MQ=25) agCCATTTCTTTTCCTTAAATCCATGAATTCATTGTTCTCAAAATTAGCCCTTATGGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 8:100993/148‑1 (MQ=21) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTGAAAAGTTGCCGAGTAAGAATGCGAGTATTAATAATTCTAgg > 7:458496/1‑149 (MQ=37) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGT‑GGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGCAGTTAAGGTGGGGGAAAATTTGAAGAGAAAGAATTCTACTATTAATAATTCTAg > 8:562629/1‑146 (MQ=25) ttccTTAATTTAATGAATTCAGGGGGGTTAAAAGAAGGCTTTATGGGGGGGTAAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGa < 8:334825/146‑1 (MQ=25) tGCCTTAATTCAATGAATTCAGGTGGGTTCAAATTTGCCCTTATTGGTGGGTAAAAAGATGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGa < 4:436548/148‑1 (MQ=37) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGTGAAATTTTGAAGAGAAAGAATTCTTCTATTAAGAATACTAGGCGACGGGAGt > 7:481914/1‑149 (MQ=25) attgaaTGAATTCAGGTGGGTATTAATTAGGCGTTATTTGTGGCTAATTTGTTGCCTTTTAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 4:871/144‑1 (MQ=25) aTTCAATGAATTCTGCGTGGAAAAAATATGGCGTTACTGGGGGCTCAAAAGAGGCCGTTAATGTGCGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 6:6572/149‑1 (MQ=21) atcaatcaaTTCATGTCGGTCAAAAGACGCCCTTACTGGGGGGTAAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 1:433705/141‑1 (MQ=25) ccATGAATTCAGGGGGGTCAAATGCTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 7:385595/148‑1 (MQ=38) aTGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGTTGTGTAAAAATTTGCATTATAGGAGACTCAAATTTTGAAGTATAGGTGGCTCAAATTTTGACTAGTAAGAAGTCTAAAATTAACATTAATAGGCGACGGGAGtgttattgact > 8:99922/1‑141 (MQ=255) gctCAAAAGCAGCCCTTAGGGGTGGCTAAAACGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAACCTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 1:484966/147‑1 (MQ=37) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGTAGGTGGGTGAAAATTTGCCGTTAAGGTGGCGCAAAGGTTGCGGAGAAAGAAGTCTAAAATTAAGAATAGTAGGCGACTGGAGTTTTGTAGACTAACGGTCGGTCa > 2:339201/1‑146 (MQ=19) caaaGTAGCCCTTATTGTTGGTTATAAAGCTGCCGTTAAGTTGGGTCAAAATTTGCGTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagaga < 5:216942/148‑1 (MQ=255) tgTTACCGTTATTGGTGGGTCAAATCTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGTCGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc < 3:387562/148‑1 (MQ=38) tttATTGGTGGGTAAAACGTTGCAGTTATGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 8:481914/148‑1 (MQ=38) gTTAGTGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAACGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 1:529385/149‑1 (MQ=255) cttacgggtggGTAAAAACGTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 6:97155/143‑1 (MQ=38) tattggtggGTAAAAACTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTaga < 3:165775/144‑1 (MQ=255) agaggtggGTCAAAACATGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGt < 3:59874/145‑1 (MQ=255) gtggtgGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAGTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCATCCAGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagagat > 1:522310/1‑146 (MQ=255) tggtggGTCAAAAGTTCCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 7:562629/148‑1 (MQ=255) tggGACAATAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa < 8:562947/149‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa > 4:405091/1‑122 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa < 3:405091/122‑1 (MQ=255) | GATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACA > NC_000913/2560837‑2561128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |