| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,099,835 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (‑222/+20) | ugd ← / ← gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 111 (0.930) | 79/280 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2099842 | 0 (0.000) | intergenic (‑229/+20) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2099835 = | 0 (0.000) | 135 (1.140) | 95/278 | 0.1 | 100% | intergenic (‑222/+27) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AGCTACCGTGCTGCTGTTCTGCCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2099981‑2099835‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTC < NC_000913/3584195‑3584047 AGCTACCGTGCTGCTGTTCTGCCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGG > 6:184029/1‑149 TACCGTGCTGCTGTTCTGCCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAA > 3:467063/1‑149 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GCCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 7:22834/1‑149 CCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCTTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTG < 7:278171/147‑1 CCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 8:33655/1‑148 CCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 6:468153/148‑1 CTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGGGACTATTTTGGGGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTACTCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 3:411342/149‑1 TGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 2:186628/1‑149 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AGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGTATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 8:102103/1‑146 GCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 6:53786/149‑1 ACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 7:102103/149‑1 AGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGAGTATTTATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCATCTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 3:1211/149‑1 TGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACAAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 5:55271/1‑148 GACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 5:278934/1‑131 GACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 6:271767/131‑1 ACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 5:184029/149‑1 TATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 1:344833/1‑149 TATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 4:78892/136‑1 TTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 8:211893/1‑149 TGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 7:107155/148‑1 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TTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 4:75772/1‑149 AATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTG > 6:166058/1‑149 ATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 8:483223/59‑1 ATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 7:483223/1‑59 ATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 7:490243/1‑59 ATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 8:490243/59‑1 TCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC > 7:347062/1‑149 TCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC > 3:341403/1‑149 TCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAAGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC > 3:78088/1‑149 TGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT > 8:360526/1‑148 TGATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT > 2:107980/1‑148 ATTTAACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTAGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC < 6:338743/145‑1 AACCAACAATAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 3:451265/148‑1 TAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGCCTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC > 6:158679/1‑149 TAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC < 4:342855/149‑1 TAAAATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC > 6:59190/1‑149 AATTGAGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGC < 7:364962/149‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTC > 4:11522/1‑149 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT < 7:76931/148‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT < 1:128476/148‑1 AGCTACCGTGCTGCTGTTCTGCCTGCGAACCTGATCCAGGCACAGCGTGACTATTTTGGTGCGCATACTTATAAGCGTATTGATAAAGAAGGTGTGTTCCATACCGAATGGCTGGATTAATCTGATTTAACCAACAATAAAATTGAGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2099981‑2099835‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTC < NC_000913/3584195‑3584047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |