| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 755708 | 12 (0.360) | 27 (0.880) | 24/240 | 0.4 | 74.8% | coding (149/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| ? | NC_000913 | 755784 = | 7 (0.230) | coding (225/348 nt) | sdhD | succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 | |||||
ACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCA > NC_000913/755638‑755918 | aCGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTAGATCGGCAt < 2:65267/149‑1 (MQ=255) atcatTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTAGATCGGCATGTGGCAGgt < 3:4080/149‑1 (MQ=255) tccgcattaggacgcaatggcgtacatgatttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGtt > 5:26189‑M2/135‑149 (MQ=255) tggcgtacatgatttcatcctcgttggcgctaccgctttcgtgctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAAc < 7:71502‑M2/32‑1 (MQ=255) acatgatttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTgg > 1:13957‑M2/112‑149 (MQ=255) tttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCa > 6:13813‑M2/106‑107 (MQ=255) tttcatcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCa < 5:13813‑M2/2‑1 (MQ=255) atcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGAc > 6:16668‑M2/102‑119 (MQ=255) atcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGAc < 5:16668‑M2/18‑1 (MQ=255) atcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTgc > 6:98500‑M2/102‑145 (MQ=255) atcctcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTgc < 5:98500‑M2/44‑1 (MQ=255) tcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtaggttttttcgctacctgtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGcc < 2:92914‑M2/47‑1 (MQ=255) tcgttcgcgctaccgctatcgtcctgacgatctacagaatttatatggtcgtttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGcc > 1:92914‑M2/98‑144 (MQ=255) ctaccgctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTg > 1:41530‑M2/89‑149 (MQ=255) tatggtCGGTTTTTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGa < 2:106213/144‑1 (MQ=255) ctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGAtt < 5:86947‑M2/67‑1 (MQ=255) ctatcgtcctgacgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGAtt < 2:41530‑M2/67‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTAGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTc > 5:127387/1‑149 (MQ=255) acgctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCa < 2:91026‑M2/76‑1 (MQ=255) gctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg > 1:51932‑M2/70‑149 (MQ=255) gctctacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtgg > 6:68127‑M2/70‑149 (MQ=255) tacatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACtggtg < 2:13957‑M2/82‑1 (MQ=255) acatcatttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGtt > 8:3733‑M2/65‑149 (MQ=255) tttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAtgctgc > 5:13242‑M2/59‑114 (MQ=255) tttatatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGAtgctgc < 6:13242‑M2/56‑1 (MQ=255) tatggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGAttt < 7:3733‑M2/95‑1 (MQ=255) atggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGAc > 3:49996‑M2/54‑75 (MQ=255) atggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGAc < 4:49996‑M2/22‑1 (MQ=255) tggtcggttttttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTAt < 6:26189‑M2/97‑1 (MQ=255) tttcgctaccagtggcgagctgacatatgaagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGtt < 2:51932‑M2/106‑1 (MQ=255) tGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTAGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGgt < 6:127387/149‑1 (MQ=255) tATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtg > 7:74409/1‑138 (MQ=255) tATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTtgtggtgtg < 8:74409/138‑1 (MQ=255) aagtctggatcggCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCa < 5:68127‑M2/135‑1 (MQ=255) | ACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGATCGGCATGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCA > NC_000913/755638‑755918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |