Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,175,151 | (A)6→5 | intergenic (‑125/‑237) | coaA ← / → thrU | pantothenate kinase/tRNA‑Thr |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,175,146 | 0 | A | . | 97.8% | 399.4 / 1.3 | 89 | intergenic (‑120/‑242) | coaA/thrU | pantothenate kinase/tRNA‑Thr |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base . (49/38); total (49/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 |
CGTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGTTTCTTC > NC_000913/4174997‑4175294 | cGTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATgaga > 2:1038478/1‑150 (MQ=255) tAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaatc > 2:155353/1‑148 (MQ=255) tAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaatc > 2:155457/1‑148 (MQ=255) tAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaatc < 2:227016/150‑3 (MQ=255) cGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATctct < 2:790198/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGcc < 3:293526/150‑1 (MQ=255) tGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCa < 2:142505/150‑1 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGa > 2:77530/1‑150 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGa > 3:344857/1‑150 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGa < 1:971042/150‑1 (MQ=255) ttttATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTATGCCAGGacg > 2:611811/1‑148 (MQ=255) cTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGt > 2:1290710/1‑150 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt < 1:1290710/150‑1 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt > 2:200460/1‑150 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt > 1:1035184/1‑150 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCCCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt > 1:560603/1‑150 (MQ=255) aTAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGa < 1:1004636/150‑1 (MQ=255) aaGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGaaa < 2:988487/150‑1 (MQ=255) aGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGaaaa < 2:157077/150‑1 (MQ=255) tGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCaa > 1:8490/1‑150 (MQ=255) tttCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAtg > 2:152875/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAtgt > 1:563125/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAAAAAAAAAAA‑AAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGa < 4:86958/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGAc < 4:138069/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGAc > 4:275946/1‑150 (MQ=255) ggCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACa < 2:793967/150‑1 (MQ=255) gCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAg > 1:1256059/1‑150 (MQ=255) cGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGa > 2:895971/1‑150 (MQ=255) tCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGatat < 1:798350/150‑1 (MQ=255) aTAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTc > 3:137694/1‑150 (MQ=255) aTAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTc > 1:891995/1‑150 (MQ=255) tAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTcc < 1:182739/150‑1 (MQ=255) gCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCAt < 1:239854/150‑1 (MQ=255) gcgccatggCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATc > 1:828528/8‑150 (MQ=255) ctctATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATc < 1:953752/150‑1 (MQ=255) aaatATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGCAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATc > 2:857298/4‑150 (MQ=255) tctATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCt < 2:253154/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑t < 1:1333925/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑t < 2:130219/150‑1 (MQ=255) tCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑Ta > 2:1001440/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑Taaa > 3:71523/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑Taaaa > 1:1161006/1‑150 (MQ=255) tttGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGt > 2:875249/1‑150 (MQ=255) cATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGCGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGc > 1:220914/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCa > 2:1041979/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGa < 3:66564/150‑1 (MQ=255) cacaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAt > 2:18440/1‑99 (MQ=255) cacaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAt < 1:18440/99‑1 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAtt > 2:1372647/1‑150 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAtt > 2:1168812/1‑150 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAtt > 1:737232/1‑150 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAtt > 2:1199006/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGGCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAttgt > 2:1195580/1‑150 (MQ=255) gTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAttgtt < 2:293121/150‑1 (MQ=255) gTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAttgtt < 4:515859/150‑1 (MQ=255) tCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAACTCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGa < 4:144838/150‑1 (MQ=255) tGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGc < 3:283164/150‑1 (MQ=255) ttGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGcac > 2:1065561/1‑150 (MQ=255) tGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGcaca > 2:617849/1‑150 (MQ=255) gAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGCTGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGACGCTATCGCTAAAAAGCACTGTCAAAGCTA‑TCAAATTGACTAAAAAGAATTATGGTTGAGCAGGAGCCCATTGTTGAGCACaa > 3:86424/1‑150 (MQ=255) gAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAACAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACaa > 1:1033985/1‑150 (MQ=255) aaTGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAat > 2:853365/1‑150 (MQ=255) aTGGGGTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAAGAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAAGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGCATTAGGGTCTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACActg > 2:349000/1‑150 (MQ=255) tGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAatga > 1:941813/1‑150 (MQ=255) tGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAACAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAatga < 1:1099569/150‑1 (MQ=255) gctAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGGCGGGGAGGACGAGTAAG‑AACAATCTTTGCCAGCACGCTATCGATGACGCGCGAAGAGACAGATAGTGCATCTGA‑TAAAAAGAATTACGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGt > 4:545672/3‑150 (MQ=255) gTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGAAAAAAAAA‑AAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGt < 2:570723/150‑1 (MQ=255) ttAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAtgt > 1:146335/1‑82 (MQ=255) ttAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAtgt < 2:146335/82‑1 (MQ=255) aaTGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TACAACGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGa > 3:203224/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGCAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGaa > 2:432034/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGaa > 3:301409/1‑150 (MQ=255) gggCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATCCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGaaaa > 2:907220/1‑150 (MQ=255) ggCAGGAGGGTACAAGCATAGTGCGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGaaaaa < 1:76023/150‑1 (MQ=255) aggaggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAgtg > 2:1372904/1‑150 (MQ=255) 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aggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGc < 2:368588/150‑1 (MQ=255) aggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGc < 1:418597/150‑1 (MQ=255) tAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAAt > 3:531662/1‑150 (MQ=255) acacCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCt < 4:585873/150‑1 (MQ=255) gggAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGtt < 1:155353/150‑1 (MQ=255) 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taataaG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGtt > 3:421777/1‑150 (MQ=255) ataaG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGTttc > 1:656385/1‑150 (MQ=255) aaaagaaTCTCCGCCAGGAAGCGATCGTCGAAAAGCAATGTGACAAATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGTttcttc < 2:60822/149‑1 (MQ=255) | CGTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGA‑TAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGTTTCTTC > NC_000913/4174997‑4175294 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |