| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 523077 = | 100 (1.230) | 48 (0.590) | 37/280 | 1.9 | 32.4% | intergenic (+247/‑184) | ybbP/rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTCTTGTGTGTCATTTTATTTTTTTTTGTTGCTAA > NC_000913/522929‑523223 | tATCTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCa > 3:101334/1‑149 (MQ=255)caaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaa > 2:88914‑M1/149‑149 (MQ=255) aaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaAt < 7:212035‑M1/2‑1 (MQ=255) tCTTTATATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCAt < 1:160247/148‑1 (MQ=255) aagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaAt < 7:322302‑M1/2‑1 (MQ=255) aagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATc < 5:154642‑M1/3‑1 (MQ=255) cTTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAACTCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCt < 6:274130/149‑1 (MQ=255) tttCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCtg > 6:58355/1‑149 (MQ=255) tCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGCTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCt < 7:226051/146‑1 (MQ=255) ttGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTa > 7:23533/1‑148 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 2:310284/1‑149 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 5:262156/1‑149 (MQ=255) ttAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTa < 2:222503/148‑1 (MQ=255) ttAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTa < 8:39900/148‑1 (MQ=255) aTCTGAATCTGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGtt < 5:9654/148‑1 (MQ=255) gagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTta > 6:219020‑M1/126‑149 (MQ=255) tGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTtaat > 2:208207/1‑149 (MQ=255) ataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATaaaa > 7:38709‑M1/119‑148 (MQ=255) 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tttATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaata < 8:28250‑M2/149‑35 (MQ=255) tttATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATATGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaagt > 4:289324/1‑147 (MQ=255) tttATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGGTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAg > 3:304361/1‑149 (MQ=255) aTTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatc < 1:319409‑M2/148‑37 (MQ=255) aTTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGt < 1:90723/147‑1 (MQ=255) 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ctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcgtgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAgtt > 7:173057‑M1/93‑149 (MQ=255) tgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAgttg < 5:247237‑M1/58‑1 (MQ=255) gCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGtaataa < 7:47997/143‑1 (MQ=255) cccTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagt < 3:288946‑M2/149‑55 (MQ=255) cccTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAATTATTGAAAGTTACCTGTATTAACAgttgt > 2:53712/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |