| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 46 (0.570) | 40/278 | 1.5 | 32.9% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 523081 | 94 (1.170) | intergenic (+251/‑180) | ybbP/rhsD | putative ABC transporter permease/Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTTCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAGTTGTTGTTGATTGAGAACAAATAAGTTTATGTGAAAAATATATAAATACATTAGCTGGTCTTGTGTGTCATTTTATTTTTTTTTGTTGCTAA > NC_000913/522933‑523223 | tttCTATTGCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCtg > 6:58355/1‑149 (MQ=255) accttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCtgtg > 6:154642‑M1/143‑149 (MQ=255) gCTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaa > 6:169152/1‑148 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 8:28409/1‑149 (MQ=255) cTGATATTAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 2:310284/1‑149 (MQ=255) cgttcgagctttataacgattggcttccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacggtaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTa > 2:73181‑M1/131‑149 (MQ=255) cgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTa > 7:274927‑M1/131‑149 (MQ=255) ttAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTa < 2:222503/148‑1 (MQ=255) ttAATCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTa < 8:39900/148‑1 (MQ=255) ttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGt > 8:279296‑M1/129‑149 (MQ=255) aTCTGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaa > 5:58355‑M2/1‑131 (MQ=255) tGAATCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTtaat > 2:208207/1‑149 (MQ=255) aaTCGGTGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTtaa < 7:333438/146‑1 (MQ=255) ataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATaaaa > 7:38709‑M1/119‑148 (MQ=255) tGGAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTaaaaa > 6:100114/1‑129 (MQ=255) ggAGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATAtt > 8:200193/1‑148 (MQ=255) aGTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaa < 8:21863/149‑1 (MQ=255) gTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGTATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaaa < 8:157588/149‑1 (MQ=255) gTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaaa < 4:138974/149‑1 (MQ=255) gTTTATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaaa < 8:74426/149‑1 (MQ=255) atggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGaaa > 7:130348‑M1/112‑149 (MQ=255) tttATTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAg > 5:95046/1‑149 (MQ=255) aTTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatc < 1:319409‑M2/148‑37 (MQ=255) aTTGATTTTAAATATAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGt < 1:90723/147‑1 (MQ=255) 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1:338526/1‑148 (MQ=255) tttAAATATAGCCCAACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGt > 3:87905/1‑148 (MQ=255) atatAGCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGtaataa > 3:277219/1‑148 (MQ=255) gCCCTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGtaataa < 7:47997/143‑1 (MQ=255) cccTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAATTATTGAAAGTTACCTGTATTAACAgttgt > 2:53712/1‑149 (MQ=255) ccTACAAAAATAACTCAGACTAATAAAATCATAAATCATATGCGTTGAATGGATATTATCCATATAGTGAATTTGTTGATGATGAATTCATCTGTGCTAAAAATGTTAGTTTAATAAAATATTGAAAGTGACCTGTAATAACAgttgtt < 4:101334/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |