| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,543,608 | Δ1 bp :: IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | coding (494‑499/549 nt) | fimA → | major type 1 subunit fimbrin (pilin) |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 93 (1.080) | 73/280 | 0.2 | 98.9% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4543608 = | 1 (0.010) | coding (494/549 nt) | fimA | major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 74 (0.860) | 63/280 | 0.3 | 98.6% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4543613 | 1 (0.010) | coding (499/549 nt) | fimA | major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTATTAGC > NC_000913/4543461‑4543756 | cGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGc < 6:256720/148‑1 (MQ=255)agccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggcc < 5:325384‑M2/2‑1 (MQ=255) cccggcattacgtgccgaagtatccaggtcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCa < 8:235685‑M2/5‑1 (MQ=255) aGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGCACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAc < 2:204411‑M2/149‑2 (MQ=255) gcAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAccca < 7:73324‑M2/149‑5 (MQ=255) gcAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCGGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAccca > 5:134555‑M2/1‑145 (MQ=255) cattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAAcccc < 5:19646‑M2/10‑1 (MQ=255) acaaACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACTCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGcc < 2:320829/138‑1 (MQ=255) cgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGt < 4:136117‑M2/14‑1 (MQ=255) aCGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgc < 4:179718‑M2/149‑12 (MQ=255) tatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGc > 1:333416‑M2/125‑149 (MQ=255) tgCAGATCCTGTACAGATCGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAAGCAATACCATTCCGTTCCTGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaag > 7:153777‑M2/1‑129 (MQ=255) tgCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGAAATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaa > 5:250748‑M2/1‑129 (MQ=255) tgCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGGGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGc < 6:215153/148‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCg > 4:8065‑M2/123‑148 (MQ=255) gCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagg < 3:100224‑M2/149‑22 (MQ=255) aGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggt > 4:303466‑M2/1‑126 (MQ=255) gATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggtt < 7:309981‑M2/149‑25 (MQ=255) aTCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttg > 8:242600‑M2/1‑124 (MQ=255) cTGGACTGATCGGGTGCTGCGCTGTCGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACAATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgat > 8:153101‑M2/1‑121 (MQ=255) cgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAcc < 8:224903‑M2/35‑1 (MQ=255) aaCGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagtgctaacttaagggttgaaccatctgaa > 7:260905‑M2/1‑113 (MQ=255) aaCGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctg < 6:2870‑M2/147‑35 (MQ=255) accaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAgg < 1:50208‑M2/42‑1 (MQ=255) accaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGtt < 1:210382‑M2/44‑1 (MQ=255) gggTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa > 4:62216‑M2/1‑110 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGtt > 5:224260‑M2/104‑147 (MQ=255) gTGCTGCGCTGACGCTGGATGGAGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGCTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGTGCCGCAAcccaaaaccgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 6:248871‑M2/1‑108 (MQ=255) gTGCAGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg > 1:85282‑M2/1‑108 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAAt < 4:210424‑M2/54‑1 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCggg > 5:40607‑M2/94‑106 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCggg < 6:40607‑M2/13‑1 (MQ=255) gATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc > 8:92166‑M2/1‑91 (MQ=255) aTGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcg > 8:73324‑M2/1‑90 (MQ=255) gTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtt > 1:144667‑M2/1‑87 (MQ=255) cGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAAGAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaaga > 1:132970‑M2/1‑84 (MQ=255) aTTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgat > 1:11452‑M2/1‑80 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGt < 8:271282‑M2/77‑1 (MQ=255) tgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGt > 2:25998‑M2/72‑148 (MQ=255) tgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTc < 3:8065‑M2/78‑1 (MQ=255) tgagagtaattcatcggcacgctaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGt > 2:10669‑M2/72‑148 (MQ=255) gTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcct > 5:28788‑M2/1‑75 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCAtt < 7:202454‑M2/81‑1 (MQ=255) cAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcg < 2:7657‑M2/149‑78 (MQ=255) 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accacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAAc > 4:202823‑M2/30‑148 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGAt < 1:115289‑M2/122‑1 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTAcc < 7:124585‑M2/62‑1 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTAcc > 8:124585‑M2/27‑88 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATaa < 3:277492‑M2/118‑1 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATaa > 4:277492‑M2/27‑144 (MQ=255) caaccattcagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCGGCTAATGCGGATGCGACCTTCACGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGAAGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGa < 1:265120‑M2/124‑1 (MQ=255) aGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgt > 7:321041‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccac > 8:81858‑M2/1‑29 (MQ=255) gcgTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaa < 5:119189‑M2/149‑124 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAgg < 8:338975‑M2/129‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGaaaa < 2:138674‑M2/127‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGaaaa > 1:138674‑M2/20‑146 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAgg > 7:197911‑M2/20‑148 (MQ=255) cagttagcgcttctgggCCGCAACCACGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCACGGTTCAGTAGCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGaa < 6:122414‑M2/131‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggCCGCACCCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGCTCAGGCATGCCCACACTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAgg > 2:166620‑M2/18‑146 (MQ=255) aagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAgg > 6:16855‑M2/18‑146 (MQ=255) aagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGaa < 3:167428‑M2/131‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGaa < 7:89986‑M2/131‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGaa > 3:115869‑M2/16‑146 (MQ=255) cttatgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTAttt < 6:8633‑M2/141‑1 (MQ=255) atgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTa > 2:369707‑M2/6‑149 (MQ=255) atgggCCGCAAACCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAATGTTCAGTATCAATAAGCTACCCATGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATACCGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCt < 3:200375‑M2/143‑1 (MQ=255) tgggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTAt > 8:194094‑M2/5‑149 (MQ=255) ggggCCGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagct < 5:34551‑M2/149‑140 (MQ=255) ccGCAAcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag > 1:190022‑M2/1‑6 (MQ=255) | CGGGTAGCGCAACAAACGTTGGTGTGCAGATCCTGGACAGAACGGGTGCTGCGCTGACGCTGGATGGTGCGACATTTAGTTCAGAAACAACCCTGAATAACGGAACCAATACCATTCCGTTCCAGGCGCGTTATTTTGCAACCGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGACCTTCAAGGTTCAGTATCAATAACCTACCCAGGTTCAGGGACGTCATTACGGGCAGGGATGCCCACCCTTGTGCGATAAAAATAACGATGAAAAGGAAGAGATTATTTCTATTAGC > NC_000913/4543461‑4543756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |