| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3154366 | 147 (0.800) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
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aTGATTCCGTTCGTCAAACTCCAGGAAAATCAGGTAATTACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTTCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTCATTTAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcat > 1:962781‑M2/1‑276 (MQ=255) gATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCCTCTTCCCCCGGCCTCACCCCGAAGTAACGTTTAAACTCCCGGCTAAATTTCGATGCCCTTTCCTAGcccccccgcaccg > 2:1781832/1‑271 (MQ=255) gATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTACATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcg < 1:28608‑M2/282‑9 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |