| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2531965 | 61 (0.770) | 4 (0.050) | 3/494 | NT | 4.9% | coding (503/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited |
| ? | NC_000913 | = 2532167 | 96 (1.270) | coding (705/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGTTT > NC_000913/2531683‑2532253 | gtcgtgtgtgGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACt < 2:20948/283‑1 (MQ=255) 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gCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGcc > 1:112576/1‑289 (MQ=255) cTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTACTTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCa > 2:597123/1‑289 (MQ=255) gTTGGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATc < 1:402482/289‑1 (MQ=255) 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cTTCATCCCTGGGATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgcgacg > 2:473553‑M2/1‑235 (MQ=255) tCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTa > 2:215776/1‑289 (MQ=255) cATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTaa < 1:597123/289‑1 (MQ=255) cATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTa > 1:273572/1‑288 (MQ=255) cccTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACAcg < 2:726757/272‑1 (MQ=255) cccTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACAcg > 1:726757/1‑272 (MQ=255) cccTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACaa > 1:415632/1‑289 (MQ=255) ggTATTGGGCAAACCGTNNCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTCCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTggg > 1:473553/1‑244 (MQ=255) ggTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCt > 1:255778/1‑288 (MQ=255) gTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTa > 1:205487/1‑288 (MQ=255) tGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGTTAACAATCTACCGGt > 1:289963/1‑289 (MQ=255) ggCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTa > 1:626599/1‑289 (MQ=255) ggCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTCTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATTTGGCGGTAACAAGTTACCGGTTa > 2:699459/1‑289 (MQ=255) aaaCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTAtt < 2:49172/288‑1 (MQ=255) aaCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTAtttt > 1:189635/1‑289 (MQ=255) aCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGTCACACCCGCGATGGTGCGGTACAAATCTACCGGTTATTTTg > 2:699714/1‑289 (MQ=255) cGTCGCGCCacaaacggcaacgggcatgatgaacagattaagcagcgggatcatcgtaaacaggctggttaaagcaccaaactgcatattggtgattttgcgtgtgcgcagggcggtgcgcatctctttaaacggcactttgtggttatcgaaggggtaatcgcaatactggatggctaacatccaggcgctaaacaggaaccacagtaccggcgcgacggtttgcccaatcccagggatgaag > 2:473553‑M1/1‑9 (MQ=255) cGTCGCGCCacaaacggcaacgggcatgatgaacagattaagcagcgggatcatcgtaaacaggctggttaaagcaccaaactgcatattggtgattttgcgtgtgcgcagggcggtgcgcatctctttaaacggcactttgtggttatcgaaggggtaatcgcaatactggatggctaacatccaggcgctaaacaggaaccacagtaccggcgcgacggtttgcccaataccagggatgaagtaaagaattagtaatacaattgcgcgcggcagataccaggcaaat > 1:207525‑M1/1‑9 (MQ=255) cGTCGCGCCacaaacggcaacgggcatgatgaacagattaagcagcgggatcatcgtaaacaggctggttaaagcaccaaactgcatattggtgattttgcgtgtgcgcagggcggtgcgcatctctttaaacggcactttgtggttatcgaaggggtaatcgcaatactggatggctaacatccaggcgctaaacaggaaccacagtaccggcgcgacggtttgcccaataccagggatgaagta > 2:174477‑M1/1‑9 (MQ=255) cGTCGCGCCacaaacggcaacgggcatgatgaacagattaagcagcgggatcatcgtaaacaggctggttaaagcaccaaactgcatattggtgattttgcgtgtgcgcagggcggtgcgcatctctttaaacggcactttgtggttatcgaaggggtaatcgcaatactggatggctaacatccaggcgctaaacaggaaccacagtaccggcgcgacggtttgcccaataccagggatgaagta < 1:174477‑M1/246‑238 (MQ=255) cGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGAGATAAACACGCGATGTGGCGGTAAAAATCTTCCGGTTAtttttga > 2:389400/1‑286 (MQ=255) cGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGttt < 1:336740/289‑1 (MQ=255) | ATCTGTTGTGGCCTCTGGCTGTCATCTCTGTGCTGTTAGTGTTTGGCTATTTCTTCTCCACGATTGCTAACTGGATTGCCGCTCCGTTTAACGGTTTATTGGCTGAACAACTGGAAGCACGATTGACTGGCGCTACACCGCCAGATACCGGGATTTTCGGTATCATGAAAGATGTGCCGCGAATCATGAAACGCGAATGGCAAAAATTTGCCTGGTATCTGCCGCGCGCAATTGTATTACTAATTCTTTACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGTTT > NC_000913/2531683‑2532253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |