New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 231901 | 88 (1.130) | coding (780/801 nt) | yafD | endo/exonuclease/phosphatase family protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCAGTTACTTCCTATTGGCGATCAGATAGCTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAGGTATGTCAGGTCTGCCACAGGGCAGACCAACGTTTGGCGCTGCGCAAAACGTGAGCGCGGTGGTGGCGTATGACTTATCTGCCCACATGCTGGATGTCGTGGCACAAGCTGCCGAAGCCCGGCAACTGAAAAATATCACCACCCGCCAGGGATATGCCGAAAGTCTGCCATTTGCCGATAACGCATTTGATATTGTTATCAGCCGTTATTCTGCCCATCACTGGCATGATGTTGGTGCAGCACTGCGAGAAGTGAATAGG > NC_000913/231628‑232183 | gCAGTTACTTCCTATTGGCGATCAGATAGCTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGat > 2:137947/1‑289 (MQ=255) aCTTCCTATTGGCGATCAGATAGCTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGataaataa < 1:601914/289‑1 (MQ=255) aCTTCCTATTGGCGATCAGATAGCTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGataaataa < 2:636805/289‑1 (MQ=255) cTTCCTATTGGCGATCGTATAGCTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGAGGGAGATGTCAATGCCTGGGGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGATAAATAAg < 2:705490/289‑1 (MQ=255) cTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCCGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCCAGCCTGATAAATAAGGTATGTCCGGTCTGCCCCAgg > 2:257837/1‑288 (MQ=255) cTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGataaataa < 1:86407/266‑1 (MQ=255) cTCACCACAGCGGCCCGGTCATTATGGCGGGAGATTTCAATGCCTGGAGCCGTAGAAGGATGAACGCGTTATATCGCTTTGCGCGGGAAATGTCGCTGCGCCAGGTGCGTTTTACCGATGATCAGCGCCGTCGGGCGTTTGGTCGCCCGCTCGATTTTGTTTTCTACCGTGGTCTGAACGTCAGTGAAGCTTCTGTACTGGTTACGCGCGCTTCCGATCACAATCCGCTACTCGTTGAATTCAGTCCCGGCAAGCCTGataaataa > 2:86407/1‑266 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |