Predicted mutation | |||||||
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JC | NC_000913 | 3,968,508 | Δ12 bp | 10.9% | coding (593‑604/1104 nt) | wecA → | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3968520 = | 97 (1.250) | coding (605/1104 nt) | wecA | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGCCGCCATCCTGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAGGCGTTTGTGCT > NC_000913/3968243‑3968805 | gTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGACGCCATCCTGCCATACATCATGCTTACCCTTGGTa > 1:321942/1‑289 (MQ=255) 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tGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCa < 2:614757/289‑1 (MQ=255) tgcTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAGGCGTTtgt > 1:529574‑M2/4‑286 (MQ=255) tGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCaatggatatggtggcgattatgtaccgtcgcctgcgtaaaggcatgagcccattctctcctgaccgtcagcatattcaccatttgatcatgcgtgccgggtttacttcccgtcaggcgtttgtgctgattaccct > 1:633380‑M1/1‑154 (MQ=255) | GTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCGACGGGCAAACCAGCCTCGCAATCTGGTGCTTTGCGATGATCGCCGCCATCCTGCCATACATCATGCTTAACCTTGGTATCCTGGGTCGCCGCTACAAAGTCTTTATGGGTGATGCGGGCAGTACGCTGATTGGTTTTACCGTTATCTGGATCCTGCTCGAAACGACCCAGGGCAAAACCCATCCCATCAGCCCGGTTACCGCTTTGTGGATAATCGCCATTCCGCTAATGGATATGGTGGCGATTATGTACCGTCGCCTGCGTAAAGGCATGAGCCCATTCTCTCCTGACCGTCAGCATATTCACCATTTGATCATGCGTGCCGGGTTTACTTCCCGTCAGGCGTTTGTGCT > NC_000913/3968243‑3968805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |