Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,398,650 | Δ1 bp | 5.4% | coding (1516/2727 nt) | nuoG ← | NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain G |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,398,650 | 0 | T | . | 5.4% | 265.5 / 6.0 | 74 | coding (1516/2727 nt) | nuoG | NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain G |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/34); new base . (2/2); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 |
TAATCGCTGTGCGTTGATGATCAACCACCATCACCAGCGGTGCTTTAGCCAGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAACACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCAGCCCCATGCTGTTGACGGAACGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGACCGATGTTGAGGATTGCCGCA > NC_000913/2398365‑2398921 | tagtCGCTGTGCGTTGCAGATCAACACCAATCAGCAGAGGTGCTTTGGCCGGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAGCACCACCGCCGCGTCGGCGCGTCCGGTATCCAGTTCAGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCACCCCCATGCTGTTGACGGAGCGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCCGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCGGAATCACCTCTAAGCTAcc < 2:415071/286‑1 (MQ=255) 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cAACCACCATCACCAGCGGTGCTTTAGCCAGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAACACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCAGCCCCATGCTGTTGACGGAACGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATaa > 1:348937/1‑288 (MQ=255) caTCACCAGCGGTGCTTTAGCCAGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAACACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCAGCCCCATGCTGTTGACGGAACGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCAGCGCCGCGCCCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAACTTACCGTCGTTCGTCCCGGAGATAATCAActga > 1:372265/1‑286 (MQ=255) aTCACCAGCGGTGCTTTAGCCAGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAACACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCAGCCCCATGCTGTTGACGGAACGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGC‑ACCGGCGTTCGTCCCGGCGATAATCAACGGtt > 2:61967/1‑288 (MQ=255) 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atgcggACGTATGCGCAGCGAACTTACCGGGCTTGCGCGACGTTAGCGGCCGCTGGAATAACCTCTAAGCTACCGGGGTTCGTCCCGGAGATAATCAACAGTTTCTTCGCACCGGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGt < 2:436622/284‑1 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCTCATGGGCGATGGCAACACCTAAACGCGCCTGATCTTCCACCGGTGCGCGGTAAGGCCACCCCGCGATACCATCCAGCAGGGTGTCATCAActgtg > 2:28649/1‑285 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGcc < 2:154913/223‑1 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGcc > 1:154913/1‑223 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTg < 1:56061/239‑1 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTg > 2:56061/1‑239 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCAcgccg > 2:318478/1‑257 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCAcgccg < 1:318478/257‑1 (MQ=255) aCCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTg > 2:7154/1‑289 (MQ=255) 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cTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCtt < 1:371478/289‑1 (MQ=255) ttCGCGACGTTAGCCGCCTCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATAGCGTCAACCGCTGGTTCAGAGTTATCCACCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCTGTGCCCGGGAAGTCCACGCCCTGATACCATCCAGATTGGTGTCCTAAACGTTGGTCACAAACAGCGGTGGCTTGGAACGTTGa > 2:458696/1‑288 (MQ=255) ttCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGa > 2:495709/1‑288 (MQ=255) ttCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGAc < 1:495709/289‑1 (MQ=255) cgcgACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGACCg < 1:130754/289‑1 (MQ=255) cgccTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTaaca < 1:405133/247‑1 (MQ=255) cgccTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTaaca > 2:405133/1‑247 (MQ=255) cTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGACCGATGTTGAGGATTGCCGCa < 2:184614/289‑1 (MQ=255) | TAATCGCTGTGCGTTGATGATCAACCACCATCACCAGCGGTGCTTTAGCCAGCGCAGCATTCACGCGGATAGCAGAAGCGTGACGATGCAGATCGTTTTCCAACACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCACCCATAATGCCCAGCCCCATGCTGTTGACGGAACGGGCAATCATGGTGATACCGACGTCAGCGCCGCGACCTTTCAGGGCTTTCGCGACGTTAGCCGCCGCCTGAATCACCTCTAAGCTACCGGCGTTCGTCCCGGAGATAATCAACGGTTTCTTCGCACCTGCCAGTGCCTGCACGATGACGTCGATTTTGCTTTGCAGCTCAGGTTCGATACCGTCAACCGCTGGTGCAGAGTTATCCAGCGCATGGGCGATGGCAAAACCTAAACGCGCCTGATCTTCAACCGGTGCGCGGTAAGTCCACGCCGCGATATCATCCAGACGGGTGTCATCAACGTTGGTAACAAACAGCGGATGCTTCGCACGTTGACCGATGTTGAGGATTGCCGCA > NC_000913/2398365‑2398921 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |