| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
ATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCG > NC_000913/3252063‑3252347 | ggATGCGGCATGACCGCCCTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaa < 1:463769‑M1/143‑6 (MQ=255) gATGTGGCATGAAGGCCTTAGCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaat < 2:713044‑M1/143‑7 (MQ=255) gATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCAATggtaat > 1:375067‑M1/1‑137 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaacatcataccctaaatcagtaagacggcagcagcaccCACGGCACATTAGTAAt < 1:501178‑M1/17‑1 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cgcgcCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgccagcgacttccgtcccagccgtgccagctgctgcctccg > 2:1205358‑M1/1‑17 (MQ=255) gcgcCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctacctcaga < 2:178353‑M1/143‑128 (MQ=255) cTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcccggtgctgcctcagattca > 1:911037‑M1/1‑12 (MQ=255) cTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca < 1:568039‑M1/143‑132 (MQ=255) accCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTAt > 2:994486‑M1/4‑143 (MQ=255) 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cTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccggatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttctgccg > 2:1313052‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCG > NC_000913/3252063‑3252347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |