| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,543 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,543 | 0 | C | A | 97.7% | 275.1 / NA | 86 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (43/41); minor base G (1/1); total (44/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCA > NC_000913/4184404‑4184681 | cTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACACGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCt > 2:1250602/1‑143 (MQ=255) ggCTGTTAACCGCCGGATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCCCTCG‑AATATATGCCTTACGCTGAAAACGGTACGCCGGTAGACGTCGTACTGAACCAGCTgg < 1:443099/143‑1 (MQ=255) ggCGGTTAAACGCCGGATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGGCATTTGTAAGACCAACCCGATCG‑AAGATATGCCGTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgg < 2:516324/143‑1 (MQ=255) ggCGGTGAACCGCCGTATCCAGCCTGGTGACATGCTGGCAGCTCGTCACGGTAACAAGGGTCTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGACGAGCACCATATGGCTGTAGACATCCTACTGAACCAGCTgg < 2:609694/143‑1 (MQ=255) gCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTggg > 1:1350617/1‑143 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTGTCCAGCCTGGTGACCAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCg < 2:1254024/143‑1 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGGCATCGTGCTGAAGCGGCTGGGCg > 1:1263385/1‑143 (MQ=255) gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGt > 2:256068/1‑143 (MQ=255) tAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 1:1296263/143‑1 (MQ=255) taaCGCCGTTTCGTGCCTGTTGCCAACTTTGTAGGTCGTCACGGTAACTAGGGTGTAATTTCTAAGATTAACCCGATCG‑TAGTTATGCCTTACGATGACATCGGCACGCCGCTAGTCTTCGTATTGAACCAGCTGGGTGTAcc < 2:50461/142‑1 (MQ=255) aaaCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑ACGATATGCCTTGCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAcc > 1:686656/1‑143 (MQ=255) ccGCCGTATCCAGCCGGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTCACGCGGGTGTAATTTCTAAGATGAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt < 1:568693/142‑1 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTCGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCgc > 1:784332/1‑142 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt > 2:202790/1‑143 (MQ=255) gCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCTTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGCGGACATCGCACTGAGCGAGCGGGGCGTACCGtct > 1:1354119/1‑143 (MQ=255) gCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTCCTGAACCAGCTGGGCGTACCGtct > 1:608642/1‑143 (MQ=255) gTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGt < 2:632541/143‑1 (MQ=255) gTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGt < 1:452033/143‑1 (MQ=255) gTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGt < 1:54039/143‑1 (MQ=255) tATCCAGCCTGGTGACCAGCTCGCAGTTCCTCACGGTAACAAGGGTGTACTTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 2:767349/143‑1 (MQ=255) tATCCAGCCGGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 1:335930/143‑1 (MQ=255) gtgcAGTCTGGCGACAAGATGGGAGGTCGTCACGGTAACACGGGTGTAATTTCTAAGGTCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 2:1124787/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATg > 2:832056/1‑143 (MQ=255) tCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGCAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCCCGTATg > 2:231819/1‑143 (MQ=255) cAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGaa < 2:458749/143‑1 (MQ=255) tGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg > 2:1004331/1‑143 (MQ=255) tGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 1:1251946/143‑1 (MQ=255) tGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCAAAG‑TCCATGTGATTGCTATATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 1:623983/143‑1 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt > 1:961727/1‑143 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt > 2:1262354/1‑143 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTACTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt > 2:819204/1‑143 (MQ=255) cAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGa < 2:1220728/143‑1 (MQ=255) gATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATcg > 2:545372/1‑142 (MQ=255) tcccAGGTCCTCACTGTAACAAGCGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 1:29346/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTGCTATGATCAACCGGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGTTACGCTGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGa < 2:467554/143‑1 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:1285224/143‑1 (MQ=255) aGGGCGGCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATACGCCTAACGTCGCAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:1014558/143‑1 (MQ=255) cACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGCTCCTCGCAACCCAcca > 2:1048670/1‑142 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 1:588262/102‑1 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc > 2:588262/1‑102 (MQ=255) cGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTgg < 1:528241/143‑1 (MQ=255) aaCAAGGGTGTAAGGTCTGAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTCACGATGAGAGCGGTACGCCGCTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGAGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 2:1292865/143‑1 (MQ=255) aaCAAGGGGGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 2:778374/143‑1 (MQ=255) acagctgtgtAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGATCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 2:141967/137‑1 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGc > 1:93177/1‑143 (MQ=255) tAATTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 1:256068/143‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGCGTATGGCTGCGAAAg < 2:1140379/143‑1 (MQ=255) ttAAGAACAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCTAAAGGTATc < 1:949672/142‑1 (MQ=255) cTAAGATCAACCCCAGCG‑AAGCTATGCCCTACGATGAAAACGGTACCCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTACAATAGAGGAAATGGACCAGGGTATGGCTGCCAAAGGTATc < 2:969067/143‑1 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg > 2:997938/1‑143 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCG‑AAGATATACCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTCAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGGCAGAGCGTCGAACCCCACCCGGGGATGGATGCGCAAAGTagct > 2:710245/1‑140 (MQ=255) aaGATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCgg < 1:997938/143‑1 (MQ=255) gATCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCg > 1:649494/1‑143 (MQ=255) aTCAACCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGa < 2:93177/143‑1 (MQ=255) gaCCCGGTCG‑AAGCTATGCCTGAGGATGGAAACGGTACGTTGGTAGACTGCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCTCCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACaa < 2:401750/142‑1 (MQ=255) aaCCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGACACCCACCTGGGTATGGCTGCGAACGGCATCGGCGAcca > 2:1250922/1‑141 (MQ=255) aCCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGGCAAg > 2:564056/1‑143 (MQ=255) aCCCGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg < 1:1090522/143‑1 (MQ=255) ccGATCG‑AGGAGATGTCTTGCGATGAACACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAACCCCAACTGCGTATGCCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 2:482940/143‑1 (MQ=255) ccGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt > 2:862048/1‑143 (MQ=255) cGATCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAGCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGGCAAGATc > 1:464287/1‑143 (MQ=255) aTCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCaa < 2:1350617/143‑1 (MQ=255) aTCG‑AAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGAACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCGCGAAACCCACCTGGGTATGGCGGCGAAAGGAATAGGGGACAAGATcca > 1:1113520/1‑141 (MQ=255) atatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATg < 1:662770/143‑1 (MQ=255) atatGCCTTACGACGGAAGCGGTGCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGAGCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATg < 2:1268006/143‑1 (MQ=255) tatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGc < 1:867654/143‑1 (MQ=255) tatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGc < 1:1250602/143‑1 (MQ=255) cTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACCAGATCAACGCCATGCTGaaa > 1:650285/1‑143 (MQ=255) cTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAACTGGGCGAACCGTCTCGTATAAACATCAGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGCGAACGAAACCGGCGACGAGAAACACGCCATGCTGaaa > 2:502731/1‑143 (MQ=255) gATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAccgca > 1:94353/1‑143 (MQ=255) gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAGCAGCGCCATGCTGAAACAgcagca > 2:214747/1‑143 (MQ=255) aaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTAAGATCCTCGAGACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGACCACACCCAGGCGGATGCAGCAGCaaga > 2:212317/1‑143 (MQ=255) cGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGACAGGTCTCGGCGACAAGATCAACGCCATGGTGAAACAGCAGCaagaag > 1:899759/1‑143 (MQ=255) gTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACCGCAGCCAGAAGTc > 2:400907/1‑143 (MQ=255) tACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGACAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAACCAGCGGCAAGAAGTcg > 1:544809/1‑143 (MQ=255) tACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcg < 1:1221285/143‑1 (MQ=255) cGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCACCGCCATGCTGCAACAGCAGCAAGAAGTcgcg > 1:277150/1‑143 (MQ=255) gCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGCAAGCTATCGGCGACCACATCCACGCCACGCGGAAACAACCGCCAGAAGTcgaca > 2:935741/1‑140 (MQ=255) cGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGaaa > 1:781552/1‑143 (MQ=255) aCATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgcgc > 2:1032820/1‑143 (MQ=255) aTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGGAGTAGCGAAACTGCGCGa > 1:771180/1‑143 (MQ=255) tACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGCTCAACGTCTTACGAAAACAGCAGCAAGACGTCGCGAAACTGCGCGAATTc > 2:280337/1‑143 (MQ=255) cTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGGGAATTCAt > 1:72455/1‑143 (MQ=255) gAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGACAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGACACTGCGCGCATTCAGcc > 2:563348/1‑143 (MQ=255) aaCCGGCTTGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTGAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCa < 1:1022220/143‑1 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGCTAACCTCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCa > 1:1339852/1‑143 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |