| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,543 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,543 | 0 | C | A | 96.0% | 221.8 / NA | 76 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base A (49/23); total (51/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCAT > NC_000913/4184407‑4184678 | gCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTggg > 1:112367/1‑143 (MQ=255) gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGCTCGCCAGTTCGAGGTACACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGt > 1:1081572/1‑143 (MQ=255) ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACACACTACTGAAC‑CAGCAGGGCgga > 2:1073354/1‑141 (MQ=255) ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGAGCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGGAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTa > 2:962352/1‑143 (MQ=255) aaCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATAGGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACAGAAC‑CAGCTAGGCGTACCg > 2:560941/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGt > 1:121762/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCAAAGATCAACGCGATCGAAGATATGGATTAAGATGAAGATGGTACTCCGCTAGCGATGGTACTGAAC‑CAGCTGGGAGTAGCGt > 2:70741/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGATGTAATTTCTAAGATCAACACGATCTAAGATATGCCTTACGATAAAAAAAGTACGACGGTAAACATCGTACTGAAA‑CAACTGAGCGAACCGt > 2:529513/1‑143 (MQ=255) tATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGGACGCCGGTAGACATCGTACGGCAC‑CAGCTGGGCGTACAGTCTCGTa > 2:97031/1‑143 (MQ=255) aTCCAGCGTGGTGACACGATGGCAGGTCGTCCCGGTAACAAGCGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAGAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 2:661502/143‑1 (MQ=255) aTCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGCGCGTCCCGTCGCGTAt > 2:776356/1‑143 (MQ=255) ccAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACCATGAAAACGGTACGCCGCTAGACCTCGTACCGACC‑CCGCTGGGCGTACCCTCTCGtctca > 1:1015229/1‑139 (MQ=255) cAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTTCCGTCTCGTATGaa > 1:734428/1‑143 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACTGTCTAGTATGAAAATCGGt > 1:279262/1‑143 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACGGAAC‑CAGCTGGGCGTCCCGAGTCGTATGAACATCGGt > 1:225110/1‑143 (MQ=255) aaGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGAt > 1:150501/1‑143 (MQ=255) gATGGCAGGTCGCCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATcc > 2:960620/1‑143 (MQ=255) tggTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGAGCATCCCGATCGAAGATATGCCGTACGATGACACGCGTACGCCGGCAGACATCGCACTGAAC‑CACCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:733037/142‑1 (MQ=255) aagtcgtcACGGTAACAACGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAATCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:66938/141‑1 (MQ=255) tcgtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGCAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACCTCGGTCGGATCCTCGACAccc > 2:597902/1‑143 (MQ=255) gtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACGCAc > 2:498941/1‑143 (MQ=255) gtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCCAAAccccc > 1:561024/1‑141 (MQ=255) gtcACGCTAACAGATGTTTAATTTCTAAGATCAACCCGATCTAAGATATGCTTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACGGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGGCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAc < 1:397727/143‑1 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTACGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGCTGAGAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACGGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGACCATCGGTCAGATCGTCGAAACCCGcc > 1:694770/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACTGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAcc > 1:852395/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAaaccaacc > 2:517439/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAcc > 1:53214/1‑143 (MQ=255) cACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCt > 1:568184/1‑131 (MQ=255) cACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCt < 2:568184/131‑1 (MQ=255) aCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CCGATGGGAGTACCGGCGCGTATGACCATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTg > 2:940339/1‑143 (MQ=255) cAAGTGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATCTGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATgg < 1:32712/143‑1 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCGTCGAAACCCACCGGGGTATGGc > 2:140765/1‑143 (MQ=255) ggTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGc > 1:480706/1‑143 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTGCTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 1:1073745/143‑1 (MQ=255) aTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGt > 1:140002/1‑93 (MQ=255) aTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGt < 2:140002/93‑1 (MQ=255) aTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGt > 1:139998/1‑93 (MQ=255) aTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGt < 2:139998/93‑1 (MQ=255) cTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGACTGGCTGCGAAAGGTATc > 2:263208/1‑143 (MQ=255) acgaccAACCCGCTCGAGGGTGGGGCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCgg < 1:400646/138‑1 (MQ=255) aGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGGAACCACCCCGGGTATGGCTGCGGAAGGTAGCGGc > 2:1075822/1‑143 (MQ=255) aTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACCTCGGGCATATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGa > 1:744244/1‑143 (MQ=255) tCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCGCGAAACCCACCTGGGTACGGCTGCGAAAGGTACCGGCGaa > 2:378962/1‑142 (MQ=255) cAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACa < 2:121762/143‑1 (MQ=255) aaCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACaa > 1:587992/1‑143 (MQ=255) aCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg > 2:1088138/1‑143 (MQ=255) cccGATCGAAGATATGCCTTACGAAGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGa < 1:559763/143‑1 (MQ=255) ccGATCGAAGATATTCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTTTCGTATGAACATCGGTCCGATCCGCGAAACCGACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGac > 2:36914/1‑142 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAACCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCAGAGTATGGCTGCGAAAGGCAGCGGCGACAAGAt > 2:902294/1‑143 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 1:909051/143‑1 (MQ=255) aTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCaa > 2:58269/1‑143 (MQ=255) atatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATg < 1:960620/143‑1 (MQ=255) tatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGc > 2:311582/1‑143 (MQ=255) gacgCCTTCCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACCTCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGc < 2:862295/140‑1 (MQ=255) atGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGcg > 1:492539/1‑142 (MQ=255) atGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCt > 1:191874/1‑143 (MQ=255) gCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCCTGCTGa > 1:1049829/1‑143 (MQ=255) ttACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAGCCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAc > 2:276988/1‑143 (MQ=255) ttACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAc < 1:703159/143‑1 (MQ=255) aggATGGAAGCGGTACGCCTGTAGGCGTCGTACTGAGC‑CAGCTGGGCGTACCTTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCGCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAGGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcag < 2:306364/141‑1 (MQ=255) aTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGT‑CGCAACGCATCTGCGCGTACCGTCTCGTATGACCATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGGGAAAGGTATCGGCGACAAGAACAACGCCACGCTGAAAcagcac > 2:602959/1‑142 (MQ=255) gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAgcagca > 2:133724/1‑143 (MQ=255) gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCCCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTACAGCTGCGAAAGGAATCGGCGACAAGAGCAACACCATGCGGAAACAgcaaca > 2:118280/1‑143 (MQ=255) aaaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGACCAACGCCATGCGCAAACAGCAGCaa > 2:1011062/1‑143 (MQ=255) aaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGGACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAACGGTATCGGCGACACGATCAACGCCATGCTGAACCAGCAGCgag > 2:380735/1‑143 (MQ=255) aaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCGCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCaag < 2:418499/143‑1 (MQ=255) acacctgTAGCCTTCCTATTGAAC‑CAGCCGCGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCTAAACCCACCTGGGTATGTCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 2:808278/137‑1 (MQ=255) aCGCTGGTATAAATCGAACTGTAC‑CAGCTGGGCGCACCGTCTCGTATGAAAATCGGTTAGACCCTCGAACCCCACCTAGGTAGGGCTGCTAAAGGTATCGGCGACTAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 2:513129/143‑1 (MQ=255) gCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGa > 1:220926/1‑143 (MQ=255) ccggaGACGTCGTGCTGGGC‑CGGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGaaa < 2:1074152/139‑1 (MQ=255) ttataCATCGTACTGAAC‑CCGCTGGGCGTACCGTCTCTTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACt < 2:112367/139‑1 (MQ=255) aGACATCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgc < 1:635016/143‑1 (MQ=255) aTCGTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACCAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGa > 2:856127/1‑143 (MQ=255) tagTACTGAAC‑CAGCTGGCCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGaa < 2:276406/141‑1 (MQ=255) gTACTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCCGATCCTCGAAACCCACCTGGGTGTGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGGAACAGCAGCAAGCAGTCGCGACACTGCTCGAAtt > 1:76776/1‑143 (MQ=255) cTGAAC‑CAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCAt < 1:940339/143‑1 (MQ=255) | GCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAAC‑CCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCAT > NC_000913/4184407‑4184678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |