Missing coverage evidence...
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* * ÷ NC_000913 2099836 2101302 1467 29 [28] [28] 30 gnd gnd

GTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCT  >  NC_000913/2099693‑2099895
                                                                                                                                              |                                                            
gttgttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGcc                                                              <  1:775469/143‑1 (MQ=255)
      cGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCAGGTGCAATATACGCCGGGCCGCAAtt                                                        >  2:1042595/1‑143 (MQ=255)
         tGGTCAACACAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGAAATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTa                                                     <  2:60080/143‑1 (MQ=255)
            tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttg                                                  <  1:968858/143‑1 (MQ=255)
            tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCCGTGCACTATACGCCGGGCCTCAATTCTAttg                                                  >  1:342340/1‑143 (MQ=255)
              aacgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCATTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTTGCTAAAAAAAGCCCGGTGTAATATACGCCGGGCCTCTATTTTAttgtt                                                >  1:666299/1‑143 (MQ=255)
               acgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAgtgttg                                               <  2:975737/143‑1 (MQ=255)
                     cgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATGTTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATAGACGCCGGGCCTGAATTTTAGTGTTGGTTaag                                         >  1:941971/1‑142 (MQ=255)
                     cgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGCTGGTTaaa                                         >  2:204483/1‑143 (MQ=255)
                      gAAAAGCTATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt                                        <  1:885387/143‑1 (MQ=255)
                      gAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCAGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAACAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt                                        <  1:1125304/143‑1 (MQ=255)
                          aaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGGTATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCAGTCCTCAAATTAATTGTAGGTTAAATCAGa                                    >  2:960750/1‑143 (MQ=255)
                          aaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCACAGTGCAATATACGCCAGGCCTCAATCATATTGATGGTTCACTCAgc                                    >  2:759043/1‑142 (MQ=255)
                           aCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATATGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATATTATTGTTGGTTACATcggca                                   >  2:1176373/1‑139 (MQ=255)
                           aCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGAt                                   >  2:315820/1‑143 (MQ=255)
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                                    aTTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAGTATACGCCGGGCCTAAGTTTTATTGTCGGTTAAATCAGATTAATCCAGc                          >  1:311664/1‑143 (MQ=255)
                                     ttttCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGACGGGCGTCGGATGTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGcc                         >  2:242562/1‑143 (MQ=255)
                                     ttttCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGATGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGcc                         >  1:1050591/1‑143 (MQ=255)
                                         cTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTc                     <  1:1012242/143‑1 (MQ=255)
                                          tttATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCg                    <  1:995118/143‑1 (MQ=255)
                                          tttATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCg                    >  1:827330/1‑143 (MQ=255)
                                               aaGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCCGCCATTCGGTATg               >  1:751236/1‑143 (MQ=255)
                                                 gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa             >  1:818762/1‑143 (MQ=255)
                                                 gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa             >  1:239474/1‑143 (MQ=255)
                                                  aaTAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGaa            >  2:193034/1‑143 (MQ=255)
                                                       cagagatttattAAGTCAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgt       <  2:752753/138‑3 (MQ=255)
                                                         gATATTTAGTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgt     <  1:400079/143‑5 (MQ=255)
                                                            attaattaGTTTAATATTAAGCACTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtagg  <  1:93179/143‑8 (MQ=255)
                                                                                                                                              |                                                            
GTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCT  >  NC_000913/2099693‑2099895

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: