Missing coverage evidence...
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GTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACAC  >  NC_000913/2099704‑2099890                                                                                                                                               |                                             gTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTACGTTAATCTTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAtt                                              >  1:287577/1‑143 (MQ=255)     acgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttgttg                                          <  1:304361/143‑1 (MQ=255)      cccaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTgg                                         <  1:159854/141‑1 (MQ=255)        caacgAAAAAAAATTCAGATGTTCTTTATAAGAATCGATGTTCAGGTTTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGtt                                       <  1:409304/143‑1 (MQ=255)            gAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt                                   >  1:604353/1‑143 (MQ=255)              aaaaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGATGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCa                                 <  2:25675/143‑1 (MQ=255)                aaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGa                               >  1:484144/1‑143 (MQ=255)                aaCAATTCAGAGTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGGTAATAGTAAGCAGTGAAATTTAGTCTAAAAGATATTTGGAAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGa                               <  2:446853/143‑1 (MQ=255)                 aCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCACAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGAt                              >  1:67721/1‑143 (MQ=255)                     ttCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAAt                          >  1:379685/1‑143 (MQ=255)                      tCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTCAATCAGATTACTc                         >  2:720161/1‑143 (MQ=255)                                    taAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATGGTTGGTTAAATCAGATTACGCCAGCCATTCGGTAt           >  2:333718/1‑143 (MQ=255)                                       gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa        >  1:90450/1‑143 (MQ=255)                                           aGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATATTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCACTCGGAATGGAacac    >  2:600248/1‑143 (MQ=255)                                             atGATATTTATTAAATTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgt  <  2:119142/142‑3 (MQ=255)                                                                                                                                               |                                             GTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACAC  >  NC_000913/2099704‑2099890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑