Missing coverage evidence...
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* * ÷ NC_000913 2099847 2101275 1429 30 [28] [28] 29 gnd gnd

GTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTC  >  NC_000913/2099704‑2099894
                                                                                                                                                |                                                
gtaaacgcaacgAAAAGCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAtt                                                  <  2:1154134/140‑1 (MQ=255)
gccaacggaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTACAAGAATAGCTGATATTTAATAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑ACATTTAGTCTATAATATATTTGGCAAAAAAAAGCCCTGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAtt                                                  <  1:416609/141‑1 (MQ=255)
 tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttg                                                 >  2:567911/1‑143 (MQ=255)
  caacgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttgt                                                >  1:282684/1‑143 (MQ=255)
    acgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttgttg                                              >  1:390063/1‑143 (MQ=255)
    acgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTATAttgttg                                              >  2:214924/1‑143 (MQ=255)
        aacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAACACCTGCTATTTATTAAGTTAATATTACGCAGTG‑‑ACACTCAGTCTATAAGATATCCGGCAAAAAAAAGCCCGGCGCAATATACCCCGCGACTCACTCCTATTGTCGGttc                                          >  2:428669/1‑142 (MQ=255)
         acgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTaa                                         <  1:131410/143‑1 (MQ=255)
          cgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTaaa                                        <  2:222422/143‑1 (MQ=255)
           gAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAGAt                                       >  1:454865/1‑143 (MQ=255)
            aaaaaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATc                                      >  2:785786/1‑143 (MQ=255)
             aaaaCAATCCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGACAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCa                                     <  2:478583/143‑1 (MQ=255)
              aaaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAg                                    <  1:327575/143‑1 (MQ=255)
                 cAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGAtt                                 >  2:712444/1‑143 (MQ=255)
                 cAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTGATTGTTGGTTAAATCAGAtt                                 >  2:155928/1‑143 (MQ=255)
                    ttCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAAt                              <  1:563021/143‑1 (MQ=255)
                    ttCAGATTTCATTTATAAGAATGGCTGATATTTATTAAGACATTGACGTTGTGGTAAATTTATTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAAt                              <  1:1102168/143‑1 (MQ=255)
                     tCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATc                             <  1:180208/143‑1 (MQ=255)
                        gATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAg                          <  1:77205/143‑1 (MQ=255)
                              cTTTATAATAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTc                    <  1:855649/143‑1 (MQ=255)
                                 tataAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGt                 <  1:652040/143‑1 (MQ=255)
                                   taAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTAt               <  1:772096/143‑1 (MQ=255)
                                    aaGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATg              >  1:1140666/1‑143 (MQ=255)
                                      gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa            >  1:884155/1‑143 (MQ=255)
                                       aaTAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGaa           >  1:398035/1‑143 (MQ=255)
                                         tAGCTGATAGTTATTAAGTTAAGATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAaca         <  2:387921/143‑1 (MQ=255)
                                               atatTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgta   <  1:819621/143‑6 (MQ=255)
                                               atatTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgta   <  1:738695/143‑6 (MQ=255)
                                               atatTCATTATGCTGATATTAAGCAGGG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgta   <  1:427340/143‑6 (MQ=255)
                                                tatttattAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAACATATTTGGAAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtag  <  2:1054866/143‑7 (MQ=255)
                                                                                                                                                |                                                
GTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTG‑‑AAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTC  >  NC_000913/2099704‑2099894

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: