Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 361,728 | 0 | C | T | 14.1% | 245.6 / 5.2 | 92 | E45K (GAA→AAA) | lacA | thiogalactoside acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/56); new base T (12/2); total (34/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.81e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACC‑GTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACA‑GGCGGTTCTACCC‑AGGCG‑TTTTCCCCTACCGTGGC‑AAAC‑ATTTCTTTAATCAGGCT‑TTCTC‑TTTTTTCAACTTCTGATGG‑A‑TGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGTTTTCCCACGAAGTCTTTTTTCCGGTAAGCCTTCGCACATATCGGTAAATAGCTTGCCTGCTCTTATTCTTTCGGTCATTGGCATGTTCAATGCGATCACTCCGTTATGATATGTTGGTCGGATAAGGCGCTCGCG‑CCGCATCCGACATTGATTGCTTAAGCGACTTCATTCACCTGACGACGCAGC > NC_000913/361491‑361956 | ttttttTCAATTTATGGTGGAGAGGGTGTCCCATTACGGAAAGGGTAACGTTGGGTTCAATTAGTACGTTATCACCGATTGTTTCC‑TTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACA‑GGCGGTTCTACCC‑AGGCG‑TTTTCCCCTACCGTGGC‑AAAC‑ATTTCTTTAATCAGGCT‑TTCTC‑TTTTTTc < 2:478247/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |