Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,625,085 | T→G | 13.6% | V64G (GTG→GGG) | serB → | 3‑phosphoserine phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,625,085 | 0 | T | G | 13.6% | 254.1 / 4.0 | 113 | V64G (GTG→GGG) | serB | 3‑phosphoserine phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/43); new base G (19/2); total (68/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TGCGTTATTTTCCCTGCTTCGAACGATTTTACAGGAGCCTTAATGCCTAACATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGATGGTGATTGTTGCCGCCTGGTGCGTGGAAGATTATCAGGTGATTCGTCTGGCAGGTTCACTCACCGCA‑CGGGCTACACGCCTGGCCCACGAAGCGCAG‑CTGGATGTCGCCCCGCTGGGGAAAATCCCGCACCTGCGCACGCCGGGTTTGCTGGTGATGGATATGGACTCCACCGCCATCCAGATTGAATGTATTGATGAAATTGCCAAACTGGCCGGAACGGGCGAGATGGTGGCGGAA > NC_000913/4624853‑4625320 | tGCGTTATTTTCCCTGCTTCGAACGATTTTACAGGAGCCTTAATGCCTAACATTACCTGGTGCGACCTGCCTGAAGATGTCTCTTTATGGCCGGGTCTGCCTCTTTCATTAAGTGGTGATGAAGTGATGCCACTGGATTACCACGCAGGTCGTAGCGGCTGGCTGCTGTATGGTCGTGGGCTGGATAAACAACGTCTGACCCAATACCAGAGCAAACTGGGTGCGGCGCTGGTGAttgt > 1:555488/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |