| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765420 = | 99 (0.670) | 3 (0.020) | 3/410 | NT | 3.2% | intergenic (‑267/+93) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 2765411 | 99 (0.820) | intergenic (‑258/+102) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAAT > NC_000913/2765140‑2765703 | ggctactccgcctgaatcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccg > 1:1046053‑M1/289‑289 (MQ=255)ggctactccgcctgaatcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccg > 1:1065959‑M1/289‑289 (MQ=255)ggctactccgcctgaatcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtataatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccg > 1:248967‑M1/289‑289 (MQ=255) gaatcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcacta > 1:551988‑M1/276‑289 (MQ=255) aatcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactat > 1:975065‑M1/275‑289 (MQ=255) tcgttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgg > 2:182557‑M1/273‑289 (MQ=255) gttcgactccatttagacatccgtgacaattttgcgaaaattaaggagatgttatgacacagtccaatcggatcactgcatcatcaccagtgatctaaatacttcacagccattctcggtcgcaggtatcaagcttttcaggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggca > 1:987220‑M1/271‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |