| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3845531 = | 142 (0.850) | 132 (0.820) | 80/490 | NT | 46.0% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| ? | NC_000913 | = 3992760 | 173 (1.080) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
ACAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGT‑ACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGGCGGATT > NC_000913/3845243‑3845818 | aCAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGT‑ACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg < 1:938830/289‑1 (MQ=255) atctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGa < 2:1063455‑M1/7‑1 (MQ=255) aaTGGTTTTGATCGCGATGATGGGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGT‑ACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGaca < 1:429369/289‑1 (MQ=255) aatctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTc < 1:210685‑M1/19‑1 (MQ=255) ctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGc > 2:1194063‑M1/265‑289 (MQ=255) cctttatttacgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGa > 2:276952‑M1/261‑288 (MQ=255) tATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGCGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTTCGTAACGGCCAGGT‑ACAAAGTCCTCTGCCGTTAACCATTTCCGGGCTGATGGGCACCGACACGGCTGAGGCGCTGGCGGAACAAATTGaa > 2:607612/1‑288 (MQ=255) 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ACAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGT‑ACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGGCGGATT > NC_000913/3845243‑3845818 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |