New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 2553468 | 149 (0.920) | coding (244/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACCCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGCTCAACCTTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACCGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATC‑‑CGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTGCCATTTGGCGAAGACGTTTATCCCCGTTACAAAAAGTGGTGCGACGAATACTTCTACCTCAAACATCGCA > NC_000913/2553182‑2553753 | tGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACGCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGCTCAACATTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACGGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGTTCGTTGGCAGCGCGAAGCCGGCGGCGGCGGGGGTAGTCGGGTGTGGCGTAATGGTGGGGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCGACGGTGCGGCGATGCCTGCTTACGCCACAGCCCATCTCCCGGAACTTGccg < 2:450310‑M2/289‑4 (MQ=255) 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ttGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTGCCATTTGGCGAAGACGTTTATCCCCGTTACAAAAAGTGGTGCGACGAATACTTCTACCTCAAACATCGc > 1:196841/1‑289 (MQ=255) | CTGGTTCGACAACCAGAAAGCACATTCGAAAAAGCGATAAGTTATGAAACCCGACGCACACCAGGTTAAACAGTTTCTGCTCAACCTTCAGGATACGATTTGTCAGCAGCTGACCGCCGTCGATGGCGCAGAATTTGTCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATC‑‑CGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACTTAACCCCATTCTATGGTTTTGAAGAAGATGCTATTCACTGGCATCGCACCGCCCGTGACCTGTGCCTGCCATTTGGCGAAGACGTTTATCCCCGTTACAAAAAGTGGTGCGACGAATACTTCTACCTCAAACATCGCA > NC_000913/2553182‑2553753 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |