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| ? | NC_000913 | 700597 = | 69 (0.770) | coding (998/1221 nt) | nagC | N‑acetylglucosamine‑inducible nag divergent operon transcriptional repressor | |||||
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ttGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagt < 1:65294‑M2/288‑286 (MQ=255) tGATAGCAATGGCGATGGTTTTACCCAGATGACGACCGATATACTCAATTATTTCCGACGCCAGACTATCGCCTTTGTTCGCGGCTTTGCAGATAGTTTCGATGTTGCTGTAGTCCAGCGGCACGCGGCTCTGGTAGCACTACTTTAACAGATTCAACACCCGTTGTTCAACGGCAGCGTTGGCAGCGCTAGTTTACAGGCAGCCACAGTTGCCGCAGTGGACGCGTTCACCCAGCGGTTCGACCTGAATATGGCCAATTTCACGGACGTTGCCGTGCCGGACCATaaa > 2:437773/1‑289 (MQ=255) | GTCATGGACTACCCAGAATATTGACAACAATAAGCGCCACTATAAAAGCACATTAATTTTCCAGCAAATGCTGGAGCAAAATACCGTTGAGCATGGCGCGTTTTACCAGCGCAAAAGCGCCGATTGCCGAGCGGTGATCCAGCTCAGAACGTACCACCGGCAGATTAGTGCGAAACGCCTTCAGCGCCTGGGTATTAATGCAGCTTTCAATAGCAGGGAGCAGCACTTTATCGGCTTCGGTGATTTCACCGGCAATAACAATTTTTTGCGGATTAAATAAGTTGATAGCAATGGCGATGGTTTTACCCAGATGACGACCGACATACTCAATTACTTCCGACGCCAGACTATCGCCTTTGTTCGCGGCTTTGCAGATAGTTTTGATGGTGCAGTCGTCCAGCGGCACGCGGCTCTGGTAGCCCTGCTTTAACAGATTCAACACCCGTTGTTCAATGGCAGCGTTGGCAGCGATAGTTTCCAGGCAGCCAAAGTTGCCGCAGTGGCAGCGTTCACCCAGCGGTTCGACCTGAATATGGCCAATTTCACCGACGTTGCCGTTGCGGCCAATAAA > NC_000913/700322‑700892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |