| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 348,458 | IS5 (+) +4 bp | 12.2% | intergenic (‑15/‑221) | prpR ← / → prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 348458 = | 104 (1.050) | intergenic (‑15/‑224) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 9 (0.090) | 9/514 | NT | 7.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 348461 | 104 (1.060) | intergenic (‑18/‑221) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase | |||||
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CGTAGCCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCA > NC_000913/348170‑348738 | cGTAGCCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGt > 1:613831/1‑289 (MQ=255)cGTAGCCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGt > 2:775049/1‑289 (MQ=255)cGTAGCCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGt > 1:77062/1‑289 (MQ=255) atcatcaagcgacagttcggcttcgtgaaagccagatacaaggggttgctgaaaaacgataaccaactggcgatgttattcacgctggccaacctgtttcgggcggaccaaatgatacgtcagtgggagagatctcactaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttcctt > 2:922108‑M2/288‑289 (MQ=255) 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aCTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTc < 1:271501/289‑1 (MQ=255) aCTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGttt < 1:85136/289‑1 (MQ=255) ttttCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCa < 1:74358/289‑1 (MQ=255) 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tccTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTa < 1:319313‑M2/225‑1 (MQ=255) | CGTAGCCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCA > NC_000913/348170‑348738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |