| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 100% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 53 (1.090) | 42/402 | NT | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 74 (1.530) | 53/400 | NT | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGA > NC_000913/458565‑459017 | atgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGa > 1:692062‑M1/227‑228 (MQ=255) tCGATCCCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGGCGTCGAAAAAGTGGTTAGCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTTATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAAACAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGaaa < 1:364770/227‑1 (MQ=255) 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aTACCATGTGCCATCTGCCGGTCATGGAAGAACTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACa < 1:116797/226‑1 (MQ=255) tACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGCCAAAGCAAACCGTTAATGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCGCGTGAATAATTAACAATTCCCATCCAATAACTTACCCAAAAAGGGTGGATGTT‑TCTCCCCCTTTAATTATTCCTCTCTTCTCTGCGTTGAATATGTGGGaacctttc > 2:86450/1‑222 (MQ=255) aTGTACGATCTGACGGACATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGACAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCGCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccat < 1:42598‑M1/227‑7 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACGATTCCCTTCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGTATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCTTCTATTTTCGGCGTGGAATTTGGGGTAAACTTcccctt > 1:683181/1‑225 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCTTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATcccctaa > 1:60977/1‑225 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataa > 1:226815‑M1/1‑220 (MQ=255) ttACGATCTGGCGTCTATGGAAAACGGCGAAAAAGTGGTTATCTACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAATCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCT‑CCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCata < 2:683181/226‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |