| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,498,623 | Δ1 bp | 6.6% | intergenic (+112/‑28) | opgD → / → ydcH | OPG biosynthetic periplasmic protein/DUF465 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,498,623 | 0 | C | . | 6.6% | 210.5 / 7.9 | 61 | intergenic (+112/‑28) | opgD/ydcH | OPG biosynthetic periplasmic protein/DUF465 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/27); new base . (2/2); total (32/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
TATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCGCCAGCCAGGCGGCTTTTTTAAC > NC_000913/1498344‑1498911 | tATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGc < 2:533925/289‑1 (MQ=255) cGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCAc < 1:234155/289‑1 (MQ=255) tCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACa < 1:192334/289‑1 (MQ=255) cAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAg > 1:125883/1‑289 (MQ=255) aGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAgg < 2:140801/289‑1 (MQ=255) gTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCTGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTAt > 1:349384/1‑289 (MQ=255) gTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTAt > 2:312921/1‑289 (MQ=255) cGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAgg < 1:131356/268‑1 (MQ=255) cGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAgg > 2:131356/1‑268 (MQ=255) cTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCg < 2:60558/289‑1 (MQ=255) gTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATc > 2:249/1‑288 (MQ=255) tatGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCg > 1:114145/1‑271 (MQ=255) tatGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCg < 2:114145/271‑1 (MQ=255) gATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGaaaaa > 2:486647/1‑289 (MQ=255) gATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGaaaa > 1:418161/1‑288 (MQ=255) tACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATc < 2:125883/289‑1 (MQ=255) aCGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATcc < 1:486647/289‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCTGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAATGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 2:227026/289‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 1:249/289‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 2:269975/289‑1 (MQ=255) cGTTGTCAGAGGGACGCTAGTAGTGAAACATGGCTGTAGCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCGTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGGATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 2:16427/289‑1 (MQ=255) gTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTc > 1:265188/1‑289 (MQ=255) ttGTCGGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCTCCGGGTAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGCGTTAATCGTTTGTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 2:117630/287‑1 (MQ=255) tGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGGGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACA‑CTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt > 2:34999/1‑285 (MQ=255) tGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGGGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACA‑CTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 1:34999/285‑1 (MQ=255) tGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACA‑CTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 1:229519/285‑1 (MQ=255) tGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACA‑CTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt > 2:229519/1‑285 (MQ=255) gTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGATTACCGAGTTTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCttcct > 2:520911/1‑285 (MQ=255) gTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATAcc > 2:301716/1‑232 (MQ=255) gTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATAcc < 1:301716/232‑1 (MQ=255) aaaCATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATaaa < 1:520911/288‑1 (MQ=255) aCATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAacac > 1:421954/1‑289 (MQ=255) cccGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAAt > 2:28706/1‑289 (MQ=255) ccAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCCCCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGATTAATCTGATGGTGTATATTTCATATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGTAGTGCGTATGTTTCCATAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGACAATCCTCGCTTTATGTCCTTCTTCGATAAACACAATAAACTTTATCATGCAATTTcc > 1:455556/1‑289 (MQ=255) cAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCAGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCa > 2:273523/1‑289 (MQ=255) cGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAaagg < 1:242637/289‑1 (MQ=255) gcactgggTGATGGGTTAAACGTTTTTTTTCAGGAACCTTATTCAGGAGGGGCCGTCTGGTTAGACACGGTCCCGATCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATGTGATGGTTTGTATTTCATATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTa < 2:455556/282‑1 (MQ=255) cgcgTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCgag < 1:514533/173‑1 (MQ=255) cgcgTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCgag > 2:514533/1‑173 (MQ=255) cgcgTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAAt > 1:376885/1‑289 (MQ=255) tttttCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATCCGGAAGTGGTCCGCATGa > 1:203062/1‑289 (MQ=255) ttttCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGaa > 2:174654/1‑289 (MQ=255) tcttcGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACa > 1:280308/1‑289 (MQ=255) gTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAagat > 1:486527/1‑289 (MQ=255) gCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAgg > 1:331294/1‑99 (MQ=255) gCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAgg < 2:331294/99‑1 (MQ=255) cGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAagatgag < 1:28706/288‑1 (MQ=255) cacGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATcc < 2:486527/289‑1 (MQ=255) aTCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTgca > 2:414526/1‑289 (MQ=255) aTCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCAGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTa > 1:518477/1‑257 (MQ=255) aTCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCAGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTa < 2:518477/257‑1 (MQ=255) cTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGt > 1:168110/1‑206 (MQ=255) cTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGt < 2:168110/206‑1 (MQ=255) tCCCTAAGTTAAATTAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCCAATACACCGTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCaaa < 1:483666/289‑1 (MQ=255) tgtATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTg > 2:403830/1‑40 (MQ=255) tgtATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTg < 1:403830/40‑1 (MQ=255) tgtATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCgccagcca > 1:188671/1‑289 (MQ=255) tgtATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCgccagcca > 2:217218/1‑289 (MQ=255) tATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt < 2:429943/92‑1 (MQ=255) tATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCt > 1:429943/1‑92 (MQ=255) ttCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCGCCAGCCAggcg > 1:169/1‑288 (MQ=255) ccTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCGCCAGCCAGGCGGCTTTTTTaac < 2:421954/289‑1 (MQ=255) | TATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGGAGGTGCCGTCTGGTTAAACACGATCCCGCTCGCATTTTTCCCTAAGTTAAATGAGTAATCTGATGGTGTGTATTTCAGATACACCTTGTCAGCCACTAACAGGGAGTGCGTATGTTTCCAGAATACCGAGATTTAATATCCCGTCTGAAAAACGAAAATCCTCGCTTTATGTCCTTGTTCGATAAACACAATAAACTTGATCATGAAATTGCCAGAAAGGAAGGTTCCGACGGTCGAGGGTACAATGCGGAAGTGGTCCGCATGAAAAAACAAAAGCTACAGTTAAAAGATGAGATGCTCAAAATCCTGCAGCAGGAGAGCGTCAAAGAGGTGTAAACTTTCCTAAGCCGCCAGCCAGGCGGCTTTTTTAAC > NC_000913/1498344‑1498911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |