Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,049,991 | Δ12 bp | noncoding (93‑104/109 nt) | spf → | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4049991 | 4050002 | 12 | 60 [0] | [0] 60 | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4049990 | 0 (0.000) | 58 (0.850) | 45/282 | 0.5 | 100% | noncoding (92/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
? | NC_000913 | 4050003 = | NA (NA) | noncoding (105/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
TTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4049850‑4049990 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC > NC_000913/4050003‑4050144 TTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTT > 2:325467/1‑143 TACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTTGCTGAATATTTTAGCCTCCCCAGTCCATAATTTT > 1:433991/1‑143 CAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTATTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTA > 1:1242654/1‑143 AAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCCGTCAGTAATTTTTAT > 2:397078/1‑143 AAAAAGTACTTGCTCAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCATAGAGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGTCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTAT < 2:33708/143‑1 AAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATT < 1:826152/143‑1 AAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTAACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCACCAGTGAGTAATTTgtcat > 2:995939/1‑138 AAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGG < 1:837794/143‑1 TCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGGAATTTTTATTGGGCGAAAGg > 1:323614/1‑142 GAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGTTGGTCTATCTTTCGGATGTGTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAA < 1:464569/143‑1 GAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAA < 1:313627/143‑1 GAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCAGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAA < 1:49984/143‑1 GAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAAAGTTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAA < 1:1183384/143‑1 TGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGCAAAGATC > 1:84505/1‑143 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TCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTCTTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGct > 2:28985/1‑141 TCGCGTAGGGGACAGAGGTAAGATGTTCTATCTATCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTT < 1:993731/143‑1 CGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAACGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAT > 1:150904/1‑143 CGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAT < 2:693858/143‑1 CGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTCTAT > 2:916513/1‑143 TAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGGGAAAGATAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCA < 1:530683/143‑1 GGTACAGAGGTAAGATGTTGTATCTTTCAGACCTTCTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGCAAAGTTTCGCAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGC < 2:92162/143‑1 GAGGTAAGAGGTTCTATCTTTCAGACCTTTCACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGG < 2:693868/143‑1 GTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAACGAAAAGATCCGTAATACCTGATACGCTATGTTGATCAGTCCAACGGTAc > 2:255475/1‑142 TATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCT > 2:1947/1‑143 CTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATT < 1:644199/143‑1 TTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAGTATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGA > 1:1048926/1‑143 ACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGCTGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAACTGTAATCTATTGAATTTc > 2:911392/1‑142 ACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCAAACGGTAAAATTGTAATCTCTTGAATTTA > 2:669048/1‑143 TTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATTCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATGGAATTTCCGG > 2:681524/1‑143 CTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGG < 1:834102/143‑1 TTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGA > 1:663993/1‑143 TTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGA > 1:439078/1‑143 TAAGCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCC < 1:660328/143‑1 tATTTGGCTGTATATTTTAGACGCCCCAGTCAGTAATTTATAGTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCC < 1:1048994/142‑1 GATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAGCAGGCCAACGGTAGAATTGTAGTCTAGTGAATTTACGTGCCGGATACGCGACATtc > 1:1222345/1‑141 TTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGC < 2:972858/143‑1 tTGAATATTTTAGCCGCTCCAGTCAGGAATTTATATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAA < 1:270057/142‑1 aTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAA > 2:217895/2‑143 CTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAA < 1:325467/143‑1 CTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAA > 1:434692/1‑143 TGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAG > 2:1045121/1‑143 TGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATAAGGTCATCCTCATTATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCAAAAG > 1:284647/1‑143 TGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAAATCCATAGTGCCTGCTGCGCTCCGCTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGACTTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACccg > 1:409065/1‑140 GAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACCAGC > 2:173179/1‑143 AATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCA > 2:214643/1‑143 ATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCAT < 2:900126/143‑1 TTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAA < 1:418608/143‑1 TTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAA < 1:770536/143‑1 ggCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTAT < 1:198729/141‑1 TCAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTCCGGGCCGCATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATT > 2:936292/1‑143 CAGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTC < 2:1048926/143‑1 AGTAATTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGTTCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATAATTCG > 2:747629/1‑143 TTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCGCCATCCGGCACATGCAGTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC > 2:163047/1‑143 TTTTTAGTGGGCGAAAGAAAAGATCCTTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAAGTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC < 1:397078/143‑1 TTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4049850‑4049990 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC > NC_000913/4050003‑4050144 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |