| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,088,068 | A→G | I597T (ATC→ACC) | pgaB ← | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,088,068 | 0 | A | G | 98.9% | 301.9 / NA | 93 | I597T (ATC→ACC) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (47/45); minor base T (0/1); total (47/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
ATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCTGTGCAAACCAG > NC_000913/1087932‑1088205 | aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGtttt > 1:735771/1‑143 (MQ=255)aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGtttt > 1:486850/1‑143 (MQ=255)aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGtttt > 2:510807/1‑143 (MQ=255)aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCGCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTGATTCGAAAATGGG‑TTTGGCTTTAGCCTGAGGGGGGtttg > 1:892239/1‑142 (MQ=255) ttttCACTCCGTTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAAtt < 2:1133788/143‑1 (MQ=255) tttCACTCCATTCACTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAAttt < 2:220982/143‑1 (MQ=255) tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGATTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGa < 1:294078/143‑1 (MQ=255) tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGa < 2:469039/143‑1 (MQ=255) tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGa < 1:385619/143‑1 (MQ=255) tCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTGTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGa < 2:1156941/143‑1 (MQ=255) tCACTCCATTCAGTGGTAATAGGCTCATCCAGTGCGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGa < 2:162708/143‑1 (MQ=255) aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGACATAGCCTGATGCTGACCCTTTTTCTGCCAGTCTTGTGCCTGTAATTCTAACATAGC‑TTTATCTTGCGGCTGCGGGGTGTGTTGAATTTGttt > 2:923486/1‑143 (MQ=255) aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGAtt < 2:231459/143‑1 (MQ=255) aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGAtt < 1:471937/143‑1 (MQ=255) aCTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTGTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGAtt < 2:890424/143‑1 (MQ=255) ttcATTTAGTTATAATAGGCTCATGCAGTGGGCGAGTTGTTGCGAAGAAAGGGCGTGATGCTGAGCTGTTTTGGGCGGGTTTTGTGGCGGGAATTCTAAAATAGA‑TTTGTGTGTATGCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTgg < 2:555293/141‑1 (MQ=255) tCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGAtttg > 2:273024/1‑141 (MQ=255) tCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTgg > 2:272627/1‑143 (MQ=255) cATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGCAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTGAAATAGA‑TTTGGCTTTAGCCTGAGGGGGGTTTCTAATTTGATCGGTc > 2:1127338/1‑143 (MQ=255) aTTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCa > 2:180579/1‑143 (MQ=255) aTTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCa < 1:1201713/143‑1 (MQ=255) ttCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTAGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGCTTTGTGCCTGTAATTCTAGAATCGA‑TTTGTCTTTAGCCTGACGGGTGTTTTTCATTTGATTCGTccc > 2:1250507/1‑141 (MQ=255) tCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAAt < 1:172405/143‑1 (MQ=255) cAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAAtt < 1:213524/143‑1 (MQ=255) cAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAAtt < 1:126963/143‑1 (MQ=255) aGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTg > 2:524209/1‑143 (MQ=255) aGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTg > 1:562498/1‑143 (MQ=255) gTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGt > 2:872663/1‑143 (MQ=255) ttGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCACTTGTa > 2:373907/1‑143 (MQ=255) gTAATCGGCTCATCCAGTGAGCGAGTCGTTGCGAAGAACTAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTCAGTCTCTGTTATTTTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTAtt < 1:1120418/143‑1 (MQ=255) aTAGGCTCACGCTGTGAGCGAGTTGTTGCGGAGAAATAGTTTTATGCTTACCATTTTTCTGGCAGTTTTGTGCCTGTTATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGTGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAc < 2:1157848/143‑1 (MQ=255) ggCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCAt < 1:1102783/143‑1 (MQ=255) aTCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTc < 1:258635/143‑1 (MQ=255) aGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGcc > 2:15425/1‑143 (MQ=255) gttgttGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCt < 2:434744/143‑1 (MQ=255) ttgttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAAGCATTGGTCAGCCGATTTTTCTg > 2:897308/1‑143 (MQ=255) tgttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGc < 1:221813/143‑1 (MQ=255) ttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGa > 1:767774/1‑143 (MQ=255) ttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGa < 1:510807/143‑1 (MQ=255) ttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGa < 1:540385/143‑1 (MQ=255) ttgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGa > 1:508760/1‑143 (MQ=255) tgCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGCTCCACTGTCTTAACCATTGGTCAGCAGATTTTTCTGCgtc > 1:227456/1‑141 (MQ=255) cGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCGCTGGTCAGCTGTTTTTTCTTCTacac > 1:396921/1‑143 (MQ=255) cGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGGTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACAATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGacac > 2:62947/1‑143 (MQ=255) gaagaaATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGTTCAGCCGATTCTTCTGCGACAcc > 2:774584/1‑143 (MQ=255) gaagaaATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACAcc > 1:697766/1‑143 (MQ=255) gaagaaATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAAGAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACAcc > 1:68226/1‑143 (MQ=255) gaagaaATAGCCTGATGCTGACCATATGACGGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTCTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGACTCTTCTGCGACAcc > 2:1095953/1‑143 (MQ=255) agaaATAGCCTTATTCTGACCATTTTTCTGTCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCtt < 2:293410/143‑1 (MQ=255) agaaATAGCCTGATGCTGAGCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCGGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGactgctt > 2:915020/1‑138 (MQ=255) agaaATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCtt > 2:59512/1‑143 (MQ=255) aaaTAGTCTGTTGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTcc < 1:301701/143‑1 (MQ=255) aaTAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCa < 2:631113/143‑1 (MQ=255) gCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGGGTTTTTAATTTGATTGGTCAATAGTATTCAACGGGGAGCGGCGGATTTGTCTGCGACACCTTCCacaaa > 2:257753/1‑139 (MQ=255) ccTGATGCTGACCATGTGTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATaa < 1:131257/143‑1 (MQ=255) cttaTGCTGACCATTTTTCTGCCACTTTTGTCCCTGTAATTCTAAAATAGATTTTGTCTTTAGACTGCGTGTTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTTGTCAGCCGATTTCTCTGCGACACCTTCCAGATaa < 2:1016152/140‑1 (MQ=255) tGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCAt > 1:380566/1‑143 (MQ=255) gCTGACCGTTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATa < 2:582223/143‑1 (MQ=255) cTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAg < 1:119067/143‑1 (MQ=255) aTTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCAAGATAAGGCATAGCCataa > 2:288763/1‑143 (MQ=255) aTTTTTCTGCCAGATTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TGTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCACTGGTCAGCCGATTCTTATCCGACACCTTCCAGCTCAGGCATAGcactaa > 2:1184757/1‑138 (MQ=255) ttttCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCATCTCAGGCATAGCCataata > 2:930429/1‑143 (MQ=255) ttttCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCataata < 1:331532/143‑1 (MQ=255) ttttCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCataata < 1:831042/143‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCGCTCATAGCGGt > 1:324679/1‑143 (MQ=255) tGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGt > 1:371691/1‑143 (MQ=255) gCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTc > 2:994540/1‑143 (MQ=255) ccAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATCGA‑GTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAAATTGATTGGTCAATGGTATTAACCATTGGGCAGACGATTTTTCTGAGACACATTACAGATACCGCCAAGCCATAAGGGCGGTcc > 2:581557/1‑143 (MQ=255) ccAGTGTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGGGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTcc > 1:158254/1‑143 (MQ=255) cAGTTTTTTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCa < 2:740124/143‑1 (MQ=255) cAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCa < 1:843532/143‑1 (MQ=255) cAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCa < 1:524209/143‑1 (MQ=255) aGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCAGAGCCGTACTATCGGTCCAg > 2:591517/1‑143 (MQ=255) ttGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCACTTGTCTCAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCAt < 2:1014323/143‑1 (MQ=255) tgtgCCTGTAATGCTAAAAGAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATa < 1:487286/143‑1 (MQ=255) tgggCCTGTAAGTCGAAAAGAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTGTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAGCCATTGGTCAGCCCCTTCTTATGCTTCGCCTTCCATATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATa < 1:237671/140‑1 (MQ=255) ccTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATCATCGCGGTCCAGTCATAGCtt > 1:1057388/1‑143 (MQ=255) cTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCttt > 1:197972/1‑143 (MQ=255) tGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCtttt > 1:1211913/1‑143 (MQ=255) tAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTa < 1:872663/143‑1 (MQ=255) aaTTCTAAATTAAG‑TTCGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAg < 1:165937/143‑1 (MQ=255) aTTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAACTTGATTGGTCAATTGTATTAACAATTGGTCCGCCGATTTTTCTGCGACACCTCCCACATAAGGCATCTCCATAATAGCGGTCCAGTCACACCTATTTatg > 2:949601/1‑141 (MQ=255) ttCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTTCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGa < 1:177724/143‑1 (MQ=255) ttCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGa > 2:8616/1‑143 (MQ=255) tAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAAt > 1:606242/1‑143 (MQ=255) gaGA‑TTTGCCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTACCCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCa < 1:1127338/142‑1 (MQ=255) aGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCAGTGGTCAGCCGATTTTTGTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGGCCAGTCATAGCTTGATAGGAAATCAGAAt > 2:732810/1‑143 (MQ=255) gttttgaGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCt < 1:101190/137‑1 (MQ=255) tgaagatccTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGGCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCtg > 1:827295/8‑143 (MQ=255) cTTTAGCCCTAGGAGTGTTTTTACTTTGATTGGTCAATTGTACTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCtgt < 1:1223045/143‑1 (MQ=255) tttAGCCTGAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCtgtg < 1:272627/143‑1 (MQ=255) tgtggCCTGAGGGGTGTTTTTACTTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCtgtg < 1:273024/139‑1 (MQ=255) gAGGGGTGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTCTCGGAAATCAGCATAATTCTGTGCAAACCAg > 1:887333/1‑143 (MQ=255) | ATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGA‑TTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCTGTGCAAACCAG > NC_000913/1087932‑1088205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |