New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 2760086 | 30 (0.420) | coding (1102/1410 nt) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TACACCGTATTCGCCATCTTCCACGCGGTTGAGGATGTAAGCCGTCGCTACGCGGGTATCCGGCGTGACGAGGAACACAATGGCGCTGACGGTGGTAATGGCGCGCACAAAGCTGTAAATCAGCGCCGAGAGGATCGCCGGGCGCAGCAGCGGCAGCAGGATGTGCGTAATGGTACGCAGGGAACCGGCGCGCAGGCTGAGTGAGGCTTCATCGAGCGATTTATCGATTTGGCCCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT‑GCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > NC_000913/278928‑279389 | tacctggttttCGCCATCTTCCACGCGGTTGAGGATGTAAGCCGTCGGTACGCGGGTAGCCGGCGTGACGAGGAACACAATGGCGCTGACGGTGGTAATGGCGCGGACAAAGCTGTAAATCAGCGCCGAGAGGATCGCCGGGCGCAGCAGCGGCAGCAGGATGTGCGTAATGGTACGCAGGGAACCGGCGCGCAGGCTGAGTGAGGCTTCATCGAGCGATTTATCGATTTGGCCCGGTa < 2:323878/230‑1 (MQ=255) cacCGTATTCGCCATCTTCCACGCGGTTGAGGATGTAAGCCGTCGCTACGCGGGTATCCGGCGTGACGAGGAACACAATGGCGCTGACGGTGGTAATGGCGCGCACAAAGCTGTAAATCAGCGCCGAGAGGATCGCCGGGCGCAGCAGCGGCAGCAGGATGTGCGTAATGGTACGCAGGGAACCGGCGCGCAGGCTGAGTGAGGGTTCATCGAGCGATTTATCGATTTGGCCCGGTAAt > 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ttatttattctttcaggggtgatggaggcgatttatcggttaccgGGTAATGACTCCATCTTATTGATAGGGTTTTATTTTCAGATAAT‑GCCCGATGGCTTTGTCATGCGGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGGCTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGc > 2:206621‑M1/46‑239 (MQ=255) tacttcattacttcagcggtgatggatgcgatagatctgttacctGGTAATGACTCCAACTTATTTATAGTTTTTTATGTTCAGATAAT‑GCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGc > 1:123689‑M1/46‑239 (MQ=255) tacttcattacttcagcggtgatggaggcgatatatctgttaccgGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT‑GCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGc > 1:675705‑M1/46‑239 (MQ=255) 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tatatctgttaccgGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT‑GCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCAt > 1:525080‑M1/15‑239 (MQ=255) | TACACCGTATTCGCCATCTTCCACGCGGTTGAGGATGTAAGCCGTCGCTACGCGGGTATCCGGCGTGACGAGGAACACAATGGCGCTGACGGTGGTAATGGCGCGCACAAAGCTGTAAATCAGCGCCGAGAGGATCGCCGGGCGCAGCAGCGGCAGCAGGATGTGCGTAATGGTACGCAGGGAACCGGCGCGCAGGCTGAGTGAGGCTTCATCGAGCGATTTATCGATTTGGCCCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT‑GCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCA‑CCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > NC_000913/278928‑279389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |