Missing coverage evidence... | ||||||||||
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TTACTAAATGTAACTAACAAGCTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCCTCTGTCTTGTAAGTGTGTATATTATATGGGGTATATGCTTTTTTAATAGGATAGTGAAACAATTCGTTATCCACATCTATTCCGTCAGAGTGAACTTCAAATGCACCAGGCGAAAGAATTGCCAGGC > NC_000913/1544230‑1544667 | ttACTAAATGTAACTAACAAGCTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGGGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGtta > 2:582675/1‑239 (MQ=255) aTGTAACTAACAAGCTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt < 1:582675/239‑1 (MQ=255) ggTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATg > 1:228267/1‑239 (MQ=255) tGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGATATTACAGTAAATATTGTTTATTTAATCTAAGGTCATGTTTTTAAAtt > 2:829235/1‑239 (MQ=255) cATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAAATATATTAACAACAAGGCCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATc < 1:829235/239‑1 (MQ=255) tCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCAACTGGttt > 2:398923/1‑239 (MQ=255) cccTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACaa < 1:398923/239‑1 (MQ=255) aaaGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCCTCTGTCTTGTAAgt < 1:506603/239‑1 (MQ=255) acaaTTATATAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCCTCTGTCTTGTAAgtg < 1:828899/202‑1 (MQ=255) aaTTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATTAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGAAAGTATTGTTTATTTCATTTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTAAATTCATCTGGTTTAACACTTCCTCTGTCTTGTAAGTGGGaaaattaa > 2:828899/1‑201 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTaataat > 2:361746/1‑96 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTaataat < 1:361746/96‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCctc > 2:161859/1‑175 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCctc < 1:161859/175‑1 (MQ=255) cTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt > 1:106105/1‑48 (MQ=255) cTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt < 2:106105/48‑1 (MQ=255) ttttggTTCCTTTTTTTTTTCCTTATTGTAATAATCTTTAATAAAGTAAGTATTTTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCCTCTGTCTTGTAAGTGTGTATATTATATGGGGTATATGCTTTTTTAATAGGATAGTGAAACAATTCGTTATCCACATCTATTCCGTCAGAGTGAACTTCAAATGCACCAGGCGAAAGAATTgccaggc < 2:228267/235‑1 (MQ=255) | TTACTAAATGTAACTAACAAGCTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTTTTTAACTTTTATATTCATCTGGTTTACAACTTCCTCTGTCTTGTAAGTGTGTATATTATATGGGGTATATGCTTTTTTAATAGGATAGTGAAACAATTCGTTATCCACATCTATTCCGTCAGAGTGAACTTCAAATGCACCAGGCGAAAGAATTGCCAGGC > NC_000913/1544230‑1544667 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |