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tttttATTCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTTTTGCTTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTGCGTCCCGGCCATTTAGTC‑TGGACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGTA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTggg < 2:406778/228‑1 (MQ=255) gccattaatgtaacaacTTTTGTTGTTTACGGCAGTTTGATTTTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACgctg < 2:300748/217‑1 (MQ=255) ccAGACAAGGAACAAACTTTGGCGTTAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACgctgc < 1:197763/228‑1 (MQ=255) aCAAGGAACAAACTTTGTCTTTACCGGTAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGTTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCCGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGAt < 1:129858/228‑1 (MQ=255) aCAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGAt < 1:48841/228‑1 (MQ=255) caacttttGGCGTTAATGGGTGTTTTGTTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGTTACTTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCAt < 2:277439/223‑1 (MQ=255) tGTCGTTAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCa > 1:279854/1‑130 (MQ=255) gTCGTTAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAg < 2:279854/130‑1 (MQ=255) tAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTTCCGGACTGTCTGGGGACGCTGCTGGTTCTGTCATCGGggattttgt > 1:506286/1‑226 (MQ=255) aaCGGCAGTTTTATTCTGGCGTTTTTTGA‑TTTGGTGGTCATTGGTTCGTCCCTGACATTTAGTC‑GGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCGTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGtgattttgat < 1:256558/227‑1 (MQ=255) tttGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑GCCAAAAGCCAGCCTTTTTAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAAGCCGCTACCCTCTTTGCTGTTGCTGGGGG‑TAACGTTACCATTACCGGACTGGCTGGGTAAGCCGCGGGTTTTTTCAACGGGGGTTTTGTTTTAAATGGa > 2:249348/1‑228 (MQ=255) | ACACACGGTAATCCGACGTCATTATCGATCTCTCCTGCCGCGTTGTTCTGGGGCATTGCCTCGGCATTTGCTGCTGCATTCTATACCACCTATCCCTCAACGCTAATTGCCCGCTATGGCACGTTACCAGTCGTCGGCTGGAGTATGCTGATTGGCGGTCTGATTCTGTTGCCTTTTTATGCCAGACAAGGAACAAACTTTGTCGTTAACGGCAGTTTGATTCTGGCGTTTTTTTA‑TTTGGTGGTCATTGGTACGTCCCTGACATTTAGTC‑TGTACCTGAAAGGAGCACAATT‑AATTGGC‑GG‑TCCAAAAGCCAGCATTTTGAGCTGTGCAGAACCATTAAGTAGCGCGCTACTCTCTTTGCTGTTGCTGGGGA‑TCACGTTCACATTACCGGACTGGCTGGGAACGCTGCTGATTCTGTCATCGGTGATTTTGATTTCAATGGA > NC_000913/3838680‑3839122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |