| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 42.2% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 43 (0.630) | 28 (0.400) | 24/420 | NT | 38.7% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 42 (0.620) | 34 (0.490) | 30/418 | NT | 44.0% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
CGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCT > NC_000913/609114‑609588 | ccacAAAACCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAg < 2:711878/237‑1 (MQ=11) caataaaTCCCACCATCCCTGGATGTCCCCCCACAAAGGGCCGGTATCGAAAAGAAGAACTAACGCTTTGTGGATAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGTTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGt < 2:43856/234‑1 (MQ=11) aaccAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATccc < 1:419436/237‑1 (MQ=18) ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGGTAATCCCCGCaa > 1:268872/1‑237 (MQ=21) ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCat > 1:877211/1‑238 (MQ=34) ggATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGGGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGGGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:883782/239‑1 (MQ=255) gcttCCGAAAAGAAAACATAACTTGTTGTTGGAAAAAAAAAAAATGGTCACCTGGATCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGATTCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCATCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:446406/236‑1 (MQ=17) ccaactCTGTGGGGAGAAAAACAAAAATGGT‑ACGTGGGGATCTACCGGGGGCCATTGGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAGCGC‑AATTGAAGAACTCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCTCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGc < 2:242500/237‑1 (MQ=18) actCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCg > 1:668734/1‑239 (MQ=255) ttGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGGTAATCCCCGCAAATCCGGTTTTCAGGCCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGGGGTc > 1:431997/1‑239 (MQ=255) gaATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGCCAGGTTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATg > 1:49806/1‑239 (MQ=255) tAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATg > 1:253284/1‑236 (MQ=255) aTGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑Ga > 1:148618/1‑239 (MQ=255) aTGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑Ga > 1:38472/1‑239 (MQ=255) gTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTAAACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATc > 1:428955/1‑239 (MQ=255) cAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGa > 1:586729/1‑232 (MQ=255) cAGGTGGCCATTCGTGGGACAGGATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGa < 2:586729/232‑1 (MQ=255) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCTTGGTCAGTGCTGGCTGCGGCC‑GAATCGACCCAAATGTTGTCatt > 1:635133/1‑237 (MQ=255) gCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACCCTTCCGCCCGTGGTCCGGGTTGGC‑GCGGGCGGAAAGGTACCAGAGGTTGTCAATTaa > 2:54273/1‑239 (MQ=18) ctttCGTGGGGCAGTATCCCTGACACCCTAAAAAACGA‑AATTGAAGAACGCGAGCCATCGCCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAAt < 2:428955/236‑1 (MQ=255) ctttCGTGGGACATTATCCCTG‑CAGGCATAAAAATGCGAATTGGAGAACGCGAGGCATCGTTTTAACGAGGCACCGGGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAAt < 2:49806/236‑1 (MQ=25) gACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAAt < 1:449194/206‑1 (MQ=255) acattttCCCGGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGca < 2:668734/232‑1 (MQ=255) gTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGACCAGc > 1:21076/1‑239 (MQ=255) gTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCAACTCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTACCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAGGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTGAGTGAGGGCTGCGGGC‑GAACCGTCCCAGATGTTGGAAATTAAACGGGTTGGCACAGc > 2:346360/1‑239 (MQ=25) tATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGAGGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCg > 1:83845/1‑239 (MQ=255) aTCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcac < 1:96337/234‑1 (MQ=255) aTCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGt < 2:253284/239‑1 (MQ=255) aTCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGt > 1:565018/1‑239 (MQ=255) tCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGGGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGtt > 1:423405/1‑239 (MQ=255) aGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGAtgttg < 2:531034/205‑1 (MQ=255) aGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGAtgttg > 1:531034/1‑205 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(MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCt < 2:38472/239‑1 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑Gaa < 1:105308/115‑1 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑Gaa > 2:105308/1‑115 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCATGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGcac < 1:681899/145‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGAACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCCGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGACGAATAATGACCTGGTGTTTATTCCAGATAATTAACTg > 2:640579/1‑239 (MQ=255) aGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCACTTAATCGTGTTGGGACAGCGTTATGGCTATCTTTTCTTTTAACTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTACCTgcaag > 1:418587/1‑234 (MQ=255) aGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAg > 2:160080/1‑238 (MQ=255) aGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGGTGGCACAGCGTTATGCCTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGTTGATTGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTaataattcgttag > 1:891084/1‑231 (MQ=255) gcgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttctt > 2:689704/1‑157 (MQ=255) gcgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttctt < 1:689704/157‑1 (MQ=255) ggAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑ca < 1:526279/163‑1 (MQ=255) gAGTCATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTTAGGATGGTAAGGGCCCTGCGTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAAcc < 1:346360/238‑1 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGCCTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCCAATTCTCACGATGAATGATGCCTTGCTGTTTTTTCCAGTCAATTATCTGCTAGTCCAGAAAACCt > 1:872037/1‑238 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGCCCTGCTGTTTATTCACACTAATTATCTAATATTCCAGAAAAACt > 2:312434/1‑238 (MQ=255) | CGACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCT‑TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGC‑AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGC‑GAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTG‑CACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAAACCT > NC_000913/609114‑609588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |