| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,430,345 | 0 | A | G | 13.9% | 174.5 / 2.5 | 76 | E161G (GAG→GGG) | cycA | D‑alanine/D‑serine/glycine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/38); new base G (10/2); total (35/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.46e-03 | |||||||||||
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ATCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCT‑CAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATG‑ATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCG‑ATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAG‑CGTCATTCGCGCA‑TTTGTGGAATGAC‑GGC‑GGCT‑GGTTCCCGAAAGGTTTAAGTGGCTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCGTGGGGATTGAGCTGGTAGGTACAACAGCTGCGGAAACCAA > NC_000913/4430118‑4430579 | aTCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTTCTGACGCT‑CCATCTCGCCCCCCGGAAAATGTTCGGGGAGATGGAGTTCTGGtttt > 1:909911/1‑238 (MQ=255) tttttgtttcTTTGCTTCCGTTTTTCTTGGGCTGTGGGGATGTTATTTCCCCGGCTGGATTTCATGGTTGTGGTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGGGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGGCTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCT‑CAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCga < 2:390545/230‑1 (MQ=255) ttttGTGGCTTCGGTTTCTGTTTTCTTGGGCCGGTGGTAGGATTTTTCACCGGTGGGTCTTTCTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCT‑CAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgat < 2:216166/239‑1 (MQ=255) gACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCGTCGCTGGCGGTGTTAGGGCGTCTGCCGCCGCTCCAATTCCGCCCCGGGGAAAAT‑TGCGGTGGGGGGGAGGTTTGGTTTGGCATG‑AACaa > 2:535596/1‑239 (MQ=255) 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ATCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCT‑CAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATG‑ATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCG‑ATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAG‑CGTCATTCGCGCA‑TTTGTGGAATGAC‑GGC‑GGCT‑GGTTCCCGAAAGGTTTAAGTGGCTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCGTGGGGATTGAGCTGGTAGGTACAACAGCTGCGGAAACCAA > NC_000913/4430118‑4430579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |