| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | 274663 = | NA (NA) | noncoding (487/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274770‑274620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgaccaagGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATA > NC_000913/274663‑274804 cacCATGAATTGCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAAGCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCT < 1:315711/140‑1CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGTCCCGCAAATTGTTCAATACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCT < 1:550388/143‑1CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCT > 1:1252814/1‑143CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCAAGATAACTCAAGACAGCGTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCT > 2:1404856/1‑143CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAACAGCAACAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCAGCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGGTGACGCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTCCGGCCCCCAGCT > 2:880128/1‑143 gTCATGGATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCTAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCGGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTC < 2:646687/142‑1 ATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGTCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTC < 1:747629/143‑1 ATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCCCACTCGTTGAGGCACCCAGCTC > 1:22379/1‑143 ATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTC < 1:10917/143‑1 ATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTC > 1:1316850/1‑143 TCATGCATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCACCTGGCCCGCCAATTGTTCAAGTCCAGCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCCTCATTGAGGCACCCAGCTCG < 2:1372948/143‑1 TCATGCATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCG < 1:341667/143‑1 TCATGAGTTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCG < 1:1124226/143‑1 TCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCCGCTCG > 2:754411/1‑143 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CATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGA > 2:136689/1‑143 CATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGA < 1:1079172/143‑1 CATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGA < 2:703408/143‑1 CATGAATTTCCGCCACCTGCGGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGA < 1:285619/143‑1 cgtcatgTCCCCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGGCATGATGACTCAAGGCACCTTGGCCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGAC < 1:654596/136‑1 acGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAATCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGAC < 2:897644/141‑1 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TGAATTTCCGCCACCTGCTGGACCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACC < 1:948611/143‑1 GAATTTCCTCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGTCCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCA < 2:247615/143‑1 GAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGGAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCCCGACCA > 1:761632/1‑143 GAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCA > 1:457116/1‑143 GAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCCCGACCA > 1:1397561/1‑143 cATTTACGCCACCTGCCGGGGCCGCATCAACTGGCCCGCCAATGGTTCAAGAGCGTCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAATGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAA < 2:291509/142‑1 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cgcAGGTGCCCTCAGTCATCAGGACGCCTGGTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGGCTTGAACAAGTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAAGTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 2:185687/140‑1 CCAAGGTGCCTTGCGTCATCATGACGCCTGCTGCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 2:985824/143‑1 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGCCGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:1051139/143‑1 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTCTCCAGG > 1:1018390/1‑143 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:931533/143‑1 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:500403/143‑1 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG > 1:1324612/1‑143 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:1127320/143‑1 CCAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGACAGCGTCAAATTATGGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG > 1:614148/1‑143 CCAAGGTGCCTGGAGTCATCATGGCGCCGGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACGATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 2:108956/143‑1 CCAAGGTGCCTGGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:595479/143‑1 CCAAGGTGCCTGGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGG < 1:1155038/143‑1 CAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTGCCAG‑ACGGGGCTTAGAGTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGG > 1:665827/1‑143 CAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTAGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGG > 2:1184113/1‑143 CAAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCG‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTAGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTCTGCAGGG > 1:708290/1‑143 gAGGTGCCGTGGGTCATGATGACGCCTGCTTCGGCCAGGCAGCGATGGATGGTCTTGAACAGTTGGCGGGCCAGTTGATGGTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATGCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGA < 2:1002702/142‑1 AAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGTGAGTTGATGCTGCT‑CCAGCCGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGA > 1:203790/1‑143 AAGGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGc > 1:1305822/1‑142 cGGTGCCTGGAGTCAGCCTTACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTTGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGAT < 1:914177/142‑1 GGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGCGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATc > 1:1449284/1‑142 CATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAGCATCAACTGGCCCGCCAATTGTTCAAGACCATCAATCGCTGGCTGGCCGAAGCAGGCGTCATGATGACTCAAGGCACCTTGGTCGATGCCACCATCATTGAGGCACCCAGCTCGACCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274770‑274620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcgaccaagGTGCCTTGAGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCT‑CCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGTCCGGCAAGGCGCTATCCAGGGATA > NC_000913/274663‑274804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |