New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_000913	= 2066832	25 (0.310)	5 (0.070)	4/266	11.3	17.6%	noncoding (522/1195 nt)	IS5	repeat region
	?	NC_000913	= 2102447	NA (NA)					noncoding (497/1195 nt)	IS5	repeat region
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

CCGCGGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAG  >  NC_000913/2066694‑2066866                                                                                                                                           |                                   ccGCGGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGCTCGCGTTGCTGCCGTTTGTTATTGGTCGAGCTg                                >  1:81866/1‑143 (MQ=255) ccGCGGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGCCTGATGCATCTCCGGATCCCGTTGCTGCTCTCTGTCCTCGGTCGAGCTg                                >  2:599087/1‑143 (MQ=11)  cgcgGTGGTGACTGGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCCATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTgg                               <  2:415732/143‑1 (MQ=21)  cgcgGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCGATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGTTgg                               <  2:1420964/143‑1 (MQ=21)  cgcgGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTgg                               <  1:937592/143‑1 (MQ=35)  cgccgcggtgACTACGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTgg                               <  1:1247328/137‑1 (MQ=255)         gtgACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCtg                        >  1:1248446/1‑142 (MQ=25)           gACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCaa                      <  1:996959/143‑1 (MQ=35)            accaGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCACGGCATGGTGCCCAGTGTGGGCCTGCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTGCTTGTCCTGATGCATCTCCTGATCCCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAat                     <  2:1180931/140‑1 (MQ=1)             ccaGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAatg                    <  1:808369/141‑1 (MQ=11)                ggCTGTTGTTCAGGCCGCTCTGGGCATCGACGCCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCGTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAatgatg                 <  2:152039/143‑1 (MQ=11)                ggCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAatgatg                 <  1:1346974/143‑1 (MQ=32)                ggCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGACTCCatgatg                 >  2:904087/1‑143 (MQ=17)                 gCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGTCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGAtgg                <  2:1244885/143‑1 (MQ=17)                  cTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGCtggt               >  2:1387602/1‑143 (MQ=17)                  cTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGAtggt               <  1:928693/143‑1 (MQ=32)                  cTGGGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGCGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGAGTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCGCCGGATCGCGTTGCTGCTTTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGAtggt               <  1:934840/143‑1 (MQ=11)                    gtgGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCACTGTGGGAAATAATCCCAAACTGCCACTGATTGCCTTTCTCGGTCTGATGCATCTCCGCATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGCTCGAGCTGGTTGCCTCAGTGTtagtgg             >  2:310645/1‑143 (MQ=11)                      gagTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACAGCAATGTGGGGCTTAATGCCAAAGTGCCACTGAGTGCCTTTATGGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGGTGCTGCTATGTGGTGTGGGTCGAACTGGGTGCATCAATGATGCTAGCa           >  2:212819/3‑143 (MQ=11)                       gctCAGGCCGCTGTTGCCATCGACGCCTATGTGCGCCTCTATGCCAAAGTGCCACTGATCGCCTTTCTTGGTCTGATGCTTCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCAt          <  2:714112/141‑1 (MQ=11)                        gTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTGTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCGCAATGATGCTGGCATc         >  1:999991/1‑143 (MQ=12)                          cAGGCCGCTCTTGGCATCGACCCCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGa       <  2:1080272/143‑1 (MQ=17)                          cAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGa       <  1:1275485/143‑1 (MQ=32)                             gCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTGGCTGCGCGTTGTCCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGCTGGCATCGCCCa    >  2:303762/1‑143 (MQ=11)                               cGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAg  <  1:1341848/143‑1 (MQ=31)                                                                                                                                           |                                   CCGCGGTGGTGACTAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAG  >  NC_000913/2066694‑2066866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.