Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | 100% | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 80 (0.990) | 51/424 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 77 (0.950) | 53/424 | NT | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293268‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCC < NC_000913/1979270‑1979036 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGG > 2:676580/1‑239 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGG > 1:641182/1‑239 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGG > 1:370637/1‑239 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGG > 1:679181/1‑239 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGGGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGG > 2:732097/1‑239 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCCTCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGTCGGCCCAAGGTGtt > 1:815510/1‑236 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGACAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGTAATTTATTGGCGGCACAAGGTGATG > 1:80258/1‑239 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGAT > 1:692443/1‑238 TGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTTTGAAAAAATATTTATTGGCGGCCCAAGGGGATGC > 2:537420/1‑239 TGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGAT > 1:730766/1‑237 TATTGCGAATTGTCTACTTTTCATCATTCGTTTAATAGGGAATTCTCGGAAACCCAACTAATACAGAAGACTGAAAATTCGGCAGCCTAAGATAATCTCCCCAGAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTAGATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAA < 2:791204/239‑1 tCGACTTTTCTGCTTTTCATCATTCGGTTAATAGGGAATTCTCGTAAACAAAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTGCGATAATCGCTCCATCAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTAA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGGTAGATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATGGGGGGCTCAAGGTGATGCTGCTAACTTA < 2:925965/238‑1 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ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGGGATGCTGCCAACTT > 1:533340/1‑235 ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGCCTTTTTTGGCTAATTTTTGGAAAAGATATTTATTGGCGGACCAAGGTGATGCGGCCACCTTAagg > 2:874855/1‑236 TGTTCCTCTTTTCCTCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:122774/238‑1 GTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:909097/239‑1 GTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:709803/239‑1 GTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCCCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:809038/239‑1 GTTCTACTTGTCATCCTTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:979075/239‑1 TTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGTTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGCCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAAATATTTATTGGCGGCCCCAGGTAAGGCTGCAAACTacataatta > 2:328967/1‑230 TCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCCCGTAAACCCAACTAATACAGAAGGCTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGA < 2:692443/239‑1 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑A > 1:731392/1‑230 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATAAAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑A < 2:731392/230‑1 TCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGG < 1:457243/239‑1 TCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGAAATTTATTGGCGGACAAAGCTGATCGTCCCAACTCACTGTATT‑AGTGTATGAAGGTGTT > 2:347119/1‑239 AATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:377390/239‑1 AGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:679181/239‑1 tcgCGTAAACACAACTAATTCAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 1:935046/236‑1 TCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTACTTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCGCCAGGTGATGCGGGCAACTTTCTGATTT‑ATGGAAAGAGGGGGTTTTTGGGGGGCTCCcaggg > 2:473538/1‑234 ACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:347119/239‑1 ACAGAAGACTGAAATGTCGTCATCTTAAGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:533340/239‑1 GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGAATGATGGGGGTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTTTTTTTCTTTCA > 1:432495/1‑234 GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AATGTATGATGGGGTTTTTGAGGGGCTCCAAGGGCTTTCGGTTTTATAAGCTG > 2:546135/1‑238 AGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCACGGTGATGCTGCCAACTTACAGCTTT‑ATGGTATGATGGGGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTTGATCAGCTGTC > 1:1086908/1‑238 AGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:676580/237‑1 ACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGATGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATACGCTGTCCC > 1:601268/1‑238 ACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGGGTGGCTGCCAACTTACTGATTT‑AATGTATGATGGGGGTTTTGAGGTGCTTCAGAGGATTCTGTTTCTATTAGCTGTCCC > 1:150682/1‑238 TGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:914523/173‑1 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CCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCACCTGACGGGGTGGTGGGTA > 1:732192/1‑239 CCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTA > 1:816948/1‑238 GACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:929340/132‑1 GACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:929340/1‑132 ACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGGGGTGCGTAACGGCAAAAGCA > 1:943268/1‑238 AATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 1:54638/170‑1 AATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:54638/1‑170 AGGAATTTTTATCCTCT‑ATTGTTGCTAAATCATCGGTGTAAATAGGGGTATATGCCGCGTCTTTTCTGGTTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCTCAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACA < 2:126592/239‑1 atGTTTTAA‑CTCACCGTGCGGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 2:1069549/236‑1 aatTTTTAACCTAA‑CTTTCTGCGAAATCATCGGGTTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 2:783242/234‑1 AAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 1:337549/238‑1 ggggaaagttTCGGTGTAAGTGGGGCTATAGGCGGCTCTTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCAAAAGGGTATGCTGCCAACTTACTGATTTCGGTGT‑TGATGGTGTTTTTTAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAGCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGTGGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 2:816948/229‑1 CGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 1:776503/1‑216 CGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 2:776503/216‑1 AATCATCGGTTAAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCCCCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCG < 1:328967/239‑1 TCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG > 1:580584/1‑173 TCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 2:580584/173‑1 CGGTGTAAATGGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTGAAGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAAC < 1:558026/239‑1 AATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAA < 1:537420/239‑1 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTA > 1:592354/1‑222 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGAACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAATGCCGTAAAACATGGCAACTCCAt > 1:472678/1‑238 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAACACCCCCGGACATAAGCGCTATTCCTGCTCTCACTGCCGTAAAAAAAGGAAACcagag > 2:291782/1‑234 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCACCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAA > 1:57870/1‑225 aTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 1:546135/237‑1 CTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTAGGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 1:890699/238‑1 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTC > 1:854644/1‑238 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTCCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTC > 1:151244/1‑238 CGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTTACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTTCTCTCCCTGCCCGAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTAa > 1:994611/1‑238 TCTTTTCCGGTTATTTTTATGAAAAGTATTTTATTGGGAGCAAAAGGTGATCCTGCCATCTTACTGTTTT‑AGTGGATGATGGTGTTTTGGAGGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTACCAGCTGTCCCTCCCGTTCAGCTCCTGACGGGGGGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCCTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCG < 2:642735/239‑1 ttTGGCTATTTTTTTGAAAAATTTTTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTTCTGTTTT‑AGTGTTTGGTGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCCCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGAAAAAGCACCGTCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCT < 2:432495/237‑1 TGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTCCCGTTCACTTCAACCGCTTCTCAACCCGGTACGACCCAGAAAAACATTGt > 1:419787/1‑238 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCCCCAGCAAATCATTGATA > 1:2024/1‑239 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 2:906313/1‑85 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:906313/85‑1 GGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGAAATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGCAAAACATGGCCACTGCAGGTCACTTTCCCCCCTTCCCAACCCGGCACGCACCCAAAAAACActtaatt > 2:361639/1‑231 CAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑GGGGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCC < 1:473538/238‑1 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCA‑CGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293268‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT‑AGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCC < NC_000913/1979270‑1979036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |