| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,536,312 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | 18.7% | coding (479‑484/510 nt) | crr → | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 18 (0.220) | 18/418 | NT | 16.7% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2536317 | 87 (1.120) | coding (484/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 22 (0.270) | 21/420 | NT | 19.7% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2536312 = | 87 (1.110) | coding (479/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
CCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTG > NC_000913/2514039‑2514505 | ccACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTAAGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATTGCAGCACCGGTACTTGAAGCCCATACCTAAAAAAGCCGGGGGAAATTCCCa > 2:784893/1‑239 (MQ=255) cctgCTCTCTCCTGCTGCTTAAGGCATCATCGTTTTGTTCCGGGTGTCCTTCGTTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCCCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGTTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAt < 1:652841/236‑1 (MQ=255) ttctcCGGGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcgc < 1:789798/238‑1 (MQ=255) ttctcCGCGTTCTTAATGCATTTTCTTTGTGTTCCTGTGTTCCGTCGGCAACTTCTGTGCAAGCGGGATTTTCTCGGGTGCAGGTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTGACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcgc < 2:555529/238‑1 (MQ=255) ccctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcgc < 1:1071708/237‑1 (MQ=255) tctcCGCGTTCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:1100208/239‑1 (MQ=255) tctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:270634/239‑1 (MQ=255) tttcTGAATGCTTCATCTCTTTTTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:532961/236‑1 (MQ=255) tGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg > 1:493865/1‑239 (MQ=255) tGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg > 1:1073532/1‑239 (MQ=255) tGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGAAAATTCCCATAAGCGCTAACTaaaa > 2:474406/1‑238 (MQ=255) tttaaGGCATTATTTCTTGGTTCCGGGTTTCCTTCGCTAACTTTGCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAACCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 2:400876/236‑1 (MQ=255) gtGAAGGCATCCTTTTTTTGTTCCTGGTTTCCTTCGTTAACTTCTCTTCAATCGGGATTAGCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 2:731743/238‑1 (MQ=255) cTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGCAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGAACTGTTGCTTTAAGACCATACCTAAAAAAGCCGTGGAAAATTCCCCTAAACGCTAACTTAAggt > 2:637538/1‑238 (MQ=255) gAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGACGCTGGTTTACGGATCTACCCTGGGGAGTGTCCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTCCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCCAACTTAAAGGtt > 2:10383/1‑239 (MQ=255) aagCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTGCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtg < 1:687752/236‑1 (MQ=255) 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tcatcTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGAAt > 1:294069/1‑239 (MQ=255) tcatcTCTGTGTTCATGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 1:577344/239‑1 (MQ=255) cttttttttttCCTGTTTTCCTTCGCTAACTTTGTTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa < 2:294069/230‑1 (MQ=255) 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1:129342/238‑1 (MQ=255) gtTCCTGGTTTCCGTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat < 1:155266/239‑1 (MQ=255) ttCCTGGTTTCCTACGCTATCGTCCCTACAAGGGGGATTATCGCTGGGGCAGTTAAAGGGCTGAA‑TTAAGGGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTAACCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata < 2:57757/239‑1 (MQ=255) cTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAA‑TGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTACCTTAAGGGTGTTGGCATTACGCCTgtatggt > 1:380648/1‑233 (MQ=255) 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> NC_000913/2514039‑2514505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |