| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,697,740 | T→G | 15.7% | V428G (GTG→GGG) | bcsE → | cellulose production protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,697,740 | 0 | T | G | 15.7% | 333.9 / 6.5 | 130 | V428G (GTG→GGG) | bcsE | cellulose production protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (24/78); new base G (25/2); total (50/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697507‑3697977 | tatCACTTCCTTGCTGGCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGt < 1:885217/239‑1 (MQ=255)tatCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTGATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTCCGTCCGGTACCGGGTATCCGCTTTGACCAACCCCTGACCCTGTGTCCCCCTAACCTTACCGGCGATAACCTGCCCATGTGCGGGAATAGG‑CG‑GGTg > 2:513496/1‑235 (MQ=255)tatCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTGCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTCCCGGCGATACCATGGCCATTGGCGGGAATCGGTCT‑Ggtggtg > 1:262820/1‑239 (MQ=255) ccttccTTGGTGTAAAGGCCCCAGCCCCTCAAAGGTCGGGGTTTCCAGAAGGGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGGCAAAAACATTATGAATAACCCGCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTtct < 2:363593/235‑1 (MQ=255) cctcccTTGTGGTCAATGACCCCGCCGCCTAAACGGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTACTGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCGGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCAGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTtct < 2:1192676/235‑1 (MQ=255) cTGTCAATTCCCCAGTCGTCCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCGGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCGATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGGTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTg < 2:103541/239‑1 (MQ=255) tCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGCACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTCACCGTACCGGCGGTATCCTGACCATTGGCTGCATTCGG‑CT‑GGAACGTTTTCTCTCCGTCTCTCg > 1:1138624/1‑239 (MQ=255) aaTGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTTTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CC‑GGTGCTGTGTCTCTCATTCTTTCCGa > 1:423010/1‑239 (MQ=255) cccAGGCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTTTTCTGTAATGCCGTCAACAACTTGATGAATAACCCTCTTGTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:628685/239‑1 (MQ=255) cccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:35684/239‑1 (MQ=255) cccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 1:22286/237‑1 (MQ=255) cccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:384082/239‑1 (MQ=255) aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATAGG‑CC‑GGGGCGGGTTTCCCCATTTCTTCGGATTAAAGa > 2:384082/1‑238 (MQ=255) tGCGTTGTTGCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACcgc‑g < 1:790551/239‑1 (MQ=255) tGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGGAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCCGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACcgc‑g < 1:166458/239‑1 (MQ=255) gtcGTGGTTTCCAGAATTGGGTATGT‑TTGTTTAAGTCCGTCAACAACATGATGAATAACCCGCTATTCCCTGCCCTCGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGCACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACcgc‑g < 2:750455/237‑1 (MQ=255) tttCCAGAATTGGG‑ATGTGGTCTGTAATGGCGTCAACAGCATGGTGAATAACCCTCTAGTCCCGGCCCACGGTAAGGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAt < 1:651450/238‑1 (MQ=255) tCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGGCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACAGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCt < 1:479243/190‑1 (MQ=255) gAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATAttt < 1:591932/239‑1 (MQ=255) gg‑ATGTGGTCTGGAATGCCGTCAACAACATGAGGAATAACCCCCTATGTCCGGCCCACGGTAAAGGCGTTCGGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGGCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCa < 1:324898/238‑1 (MQ=255) tgtTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:192654/200‑1 (MQ=255) ttCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTTTCGGGTTAACGATCTGGTTACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCCTTGccca > 1:60811/1‑236 (MQ=255) tGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAAACGG‑CTGGGGGGTGTTTCT‑TCCTTTTTTCGGGTTTACGATCTGGATAACCC‑GTTGTAT‑CATATTTTTCCCTTGCCTAcctg > 2:1325723/1‑236 (MQ=255) tGCCGTCAACAACATGATTAATAACCCTGTATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACa < 2:211392/239‑1 (MQ=255) tGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTTTCTCATTCTTTCGGATTTACGCTTTGGGTACCGC‑GTTTGAT‑CCTATTTTCCCCTTGccctatggggcca > 1:994743/1‑228 (MQ=255) ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGTTTTTTTTCTCATTCTGTTCGGTTAACGCTCTGGATACACC‑GTTGAATACAT‑TTTTTCCATTTCCCACCG‑GCGaactt > 1:840896/1‑235 (MQ=255) tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTTTCTCCTTCTTTCGGGTTAACGATCTGGATAACCC‑GTTGAAT‑ATTCTTTTCCCCTTGCCTCTTG‑GCGCCCttttt > 1:211392/1‑238 (MQ=255) tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATATGGGTAACGC‑GTTGAAT‑TCTATTTTTCCCTTGCTCACTT‑GGGACAtttt > 1:451313/1‑238 (MQ=255) tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTCTCCTATTCTTTCGGGTTAACGATCTTGATACCGC‑CGTGAAA‑CAAATTTTTCCCTTTCCTACTG‑GGGACAttt > 1:1095030/1‑237 (MQ=255) gatgaATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAAATGG‑GC‑GGGGCTGTTTTCCCCATACTGTCGGATTTACGCTCTTGGTACCCC‑GGTTTAT‑CCTTTTTTCCCATTTCCTAATG‑GCGGCAATTTTTCCAACCCTa > 2:299145/1‑239 (MQ=255) tgaATACCCCTCTATTCCCTTCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTTTCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTTCTG‑GCGACa < 1:426072/222‑1 (MQ=255) aaTAACCCTCTTTTACCTGCCCCCGGTAAAGGCGTTCTTGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTTTCCGCGTTGAACAAGCCCTGGCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGt < 1:1326618/239‑1 (MQ=255) tttccccTTTTTTTCCTGCCCCCGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCCTCGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTc < 2:804145/235‑1 (MQ=255) aTAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTc < 1:833693/239‑1 (MQ=255) aTAACCCCTTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGGCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTCCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGt < 1:194220/238‑1 (MQ=255) tctATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTTTCTCCTTCTCTCCGCTTAACGAACTGGGTAACCC‑GGTTAAT‑CATATTTTCTCATTTTCTTCTC‑GGCACATTTTCTCCAACAGCAT‑AGTCTGGtttt > 2:217101/1‑238 (MQ=255) tctATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 1:1326675/161‑1 (MQ=255) ctATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTa < 1:135578/202‑1 (MQ=255) ctATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTc < 1:136605/231‑1 (MQ=255) tATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTTTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCCTTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCTAACCGTAT‑AGTCTGGgtttta > 1:514804/1‑236 (MQ=255) tttcccTGCCCCCGGTAAAGGTCTTTTGGTTGCCCTTCGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGGCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAg < 2:421349/235‑1 (MQ=255) aTTTCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAg < 1:916135/239‑1 (MQ=255) aTTCCCCGCCCTCGGTAAAGGCGTTCTGGTCGCCCTCCGTCGCGCACCGTGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCAGGCCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAg < 2:1033461/239‑1 (MQ=255) aTTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTCCCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTATCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAg < 1:619062/239‑1 (MQ=255) ttACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCa < 1:715498/216‑1 (MQ=255) cTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAgatgat < 1:483724/239‑1 (MQ=255) gCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCCGTCGGATTAACGCTCTGGATAACGC‑GTTGAAT‑CATTATTTTCCACTGCCTACTG‑GCGACATATTTTCCAACCCGAT‑TGTCTGGttttactatgctca > 1:1293339/1‑228 (MQ=255) gCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTTTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTTGAT‑CATATTTTTCCATTTCCTACTG‑GCGCACTTTTTTCCAACCCTATGGGTCTGGtttatgatgttca > 1:269669/1‑229 (MQ=255) gCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CC‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTTTCGGATTAAAGGTCTGGGGACCGC‑GGTGGAT‑CCTATTTTCCCCTTTCCTACTG‑GCGCCACTTTTTCAAACCCTAT‑GGTTCTGTTTTAATATGAACa > 2:844278/1‑239 (MQ=255) cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGGTACCGC‑GTTGGAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTTTCAAACCGGAT‑GGGTTGGTTTTAAGATTATCaa > 1:33688/1‑239 (MQ=255) cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTTTCTCCTTATGTCGGATTTAAGATCTTGATGACGC‑GCTGAAT‑CATATTTTTCCCTTTCCTTCTA‑GGCACATTTTTTCCAAACGTAT‑GGTGTGGTTTTaaaaccatc > 2:136605/1‑230 (MQ=255) ccccGGTAAAGGCGTTCGGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCaaa < 1:493853/236‑1 (MQ=255) ccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTa > 1:130285/1‑191 (MQ=255) ccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑Gc > 1:309648/1‑196 (MQ=255) ggTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTCCTCCATTTTTTCGGAGTAACGGTCTGGGTACCGC‑GGTGAAT‑CATATTTTTCCATTTCCTACTG‑GCGACATTTTTTCAAACCGTAT‑AGTTTGGTTTTAAGATGATCAAAACaa > 1:1218561/1‑238 (MQ=255) aaaGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTg < 1:217101/238‑1 (MQ=255) aaaGGCGTTCTGGTGTCCCTACCTCCGGTACCGGGTTTCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGGTGTGGCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTg < 2:269669/238‑1 (MQ=255) gTTTTGGTTCCCCTACGTCCGGTTCCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTTCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGc < 2:514804/238‑1 (MQ=255) ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 2:440263/135‑1 (MQ=255) ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa > 1:440263/1‑135 (MQ=255) ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCAGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATAAGTGCCGAGCTg > 1:557031/1‑239 (MQ=255) ttcGTCCGTGACCGGGTTTCCGCGTTGAACAAGCCCGTGCGCTGTGTCGCCTTAACCGGCCCGGCTATATCATGGCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGGCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATgcgc < 2:608226/237‑1 (MQ=255) tCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAg < 1:189157/200‑1 (MQ=255) tCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGCTTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTTCCTAATG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGGTTTAAGATGATCAAAATAATGCCGGGCTTGTGCCGATGCgctt > 1:719090/1‑237 (MQ=255) cccgttccGGGTTTCCGCGTTTAACAAGCCCTGACGCGTTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 2:616740/233‑1 (MQ=255) cccggtccGGGTTTCCGTCTTTAACTACCCCTTACGCTGGTGCGCCCTAACCGTACCGGCTATTTCATGACCATTGGCAGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 2:557031/233‑1 (MQ=255) ccGGTTCCGGGTATCCGGGTTGAACAAGCCCCTGCGCTGGTTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 2:22688/239‑1 (MQ=255) ccGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGGCGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 1:289642/239‑1 (MQ=255) ccGGTACCGGGGTCCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 1:473653/239‑1 (MQ=255) cGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGGACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑TGTGCTGTTTCTCGCATGCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t < 1:1037732/238‑1 (MQ=255) cGGGTTCCCCCGTTTCACAAGCCCTGACTCGTTGTCTCCCTAACGGTACCGGGCATATGATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTCTGTCTCTCATTCTGTCGGATTAGCGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTATCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGGGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCa < 2:1138624/239‑1 (MQ=255) cGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGCCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTTTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCa < 1:514132/239‑1 (MQ=255) ggTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGGTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTTCCCCCGa > 1:829224/1‑239 (MQ=255) aTCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CC‑GGGGCTGTTTCTCTCATTCTTTCGGATTTACGATCTGGGTACCGC‑GTTGAAT‑CCTATTTTTCCATTTCCTCCTG‑GCGACATTTTTTCAAACCCTAT‑GGTTTGGGTTTAGGAGGTTAAAAACAATGCCCGGATGGGGCGAAAGCGCTTTC‑TGGCCCCCGaaaa > 2:1206692/1‑237 (MQ=255) tCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGGTGTTTTTCTCCTTTTTTCGGATTTACGAACTGGGTACCGC‑GTTGTAT‑CATATTTTCTCCTTGCCTACTG‑GCGACCTTTTCTCAAACCCTAT‑GGTTTGGTTTTTAGATGAATAAATAAGAGCCGAGCTGGGGGAGATTGACTTTC‑TTTcccccacaaaa > 2:160956/1‑232 (MQ=255) ttGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CC‑GGGGCTGTTTCTCTCCTTTTTTCGGATTAACGATTTTGGTAACGCGGTGGATT‑CTTTTTTTCCCTTTG‑CTACTGTGCG‑CATTTTTTCCAACCACAT‑GGTCTTGTTTGTAGAATTTCAAATCAAGTCCCAGGTGGGGCAGATGCGCCTTG‑TTGTCCCAGAaaaaatggga > 2:356248/1‑233 (MQ=255) tGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGGTACCGC‑GGTGAAT‑CATATTTTTCCATTTCCTACTG‑GCGACATTTTTTCAAACCGTAT‑GGTCTTGTTTGACGATGATCAAATCAGTGCCGAGACGGGGCAGATGTGCTTGC‑TTGCCCCCGAACCATTGGGcc > 1:456008/1‑238 (MQ=255) accaatcctgtaCGCTGTTGCGCCCTAACCGGGCCGGCGATATCATTGCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGTCTGTTTCTCTCATTCTTGCGGATTAACGTTCTGGATACCGC‑TGTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAg < 2:870799/214‑1 (MQ=255) gCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGGGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCCC‑GTTGAAT‑CATATTTTTCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTTTAGATGATCAAATCAGTGCCCCGCTGGTGCTAATTGCCTTGC‑TTGCCCCACAACAAATGGGCAAGcacc > 1:567306/1‑235 (MQ=255) ccTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCa < 1:515942/217‑1 (MQ=255) gACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CC‑GGGGCCGTTTTTCTCATTCTGTCGGATTAAAGATCTGGATAACGC‑GGTGGAT‑ACTTTTTTTCCATTGCCTACTT‑GCGAAATTTTTTTCAAACGGAT‑GGTCTGGGTTGTAGATGATACAATCAGTGCCGAGCTGGGGCAGAGGGCCGTGCTTTTCCCCAAAAAAAAGGGGGAGGCCGC‑GCCtt > 2:301883/1‑239 (MQ=255) tttctcccTACCCGTACCGGCGATTTCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTTTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCGCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:1095030/234‑1 (MQ=255) tgtctgccTAACCGTCCCGGCGATATCATGGCCATTGGCGGTAAGCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTAAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAGCCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:1131490/233‑1 (MQ=255) tgtCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGt < 1:757046/185‑1 (MQ=255) tgtCCCCCTAACCGTCCCGGCGATTCTATTCCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:451313/239‑1 (MQ=255) gtCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGGCCATTGGCGGTAAGCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCAGTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:1250640/238‑1 (MQ=255) gtCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATTCCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:597330/238‑1 (MQ=255) gtCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:532345/238‑1 (MQ=255) gtCCCCCTAACCCTTCCGGCGATATTATGCCCATTTGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATTCCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:456008/238‑1 (MQ=255) ggcGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:154018/236‑1 (MQ=255) ctggCCCTAACCGTCCCGGCGATATCACTCCCATTGGCGGGAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTTGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTTCTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:889291/235‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTTGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTTTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCCGAACAATGGGGCATGCCCCTGCCTTTAACGCAAAtttttta > 1:1217914/1‑234 (MQ=255) aCCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTTTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGTGGCCGATTCGCTTTC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCCTTTAGGCAAAGTTTTaacacgg > 1:461729/1‑233 (MQ=255) gATATCATGCCCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGtcatca < 1:356248/238‑1 (MQ=255) aatCAAGACCATTGGCCGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCACTTATTCTGGCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATg < 1:171644/238‑1 (MQ=255) atCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTTCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGGTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATg > 1:282950/1‑238 (MQ=255) atCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGc < 1:1116242/157‑1 (MQ=255) tGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGTCCCAGAAAAATGGGGCATGCCGCCGCCTTTAACCCAAAATTCTAAACCGGTCATCCATGCCGAGccacatg > 1:1183326/1‑233 (MQ=255) gTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCgcttgc‑t > 1:1040999/1‑149 (MQ=255) gTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGcgacg > 1:1156377/1‑239 (MQ=255) | TATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑CT‑GGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGC‑GTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACTG‑GCGACATTTTCTCAAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697507‑3697977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |