| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,193,510 | A→C | 11.1% | V220G (GTG→GGG) | mrp ← | antiporter inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,193,510 | 0 | A | C | 11.1% | 335.4 / 3.1 | 132 | V220G (GTG→GGG) | mrp | antiporter inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/55); new base C (4/15); total (62/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CACCACCGGTACCGAAAATCGGTTCATGGTGACCACAGTTACTGCAAATATGCACACTCATGTTCTCGACAATACCGAGCACCGGAACCTCGACTTTCTCGAACATCACAATGCCTTTTTTCGCATCGATCAGCGCGATGTC‑CTGCGGGGTG‑GTGACCACGACTGCACCGGTTACTGGAATGT‑TTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACACCATCGCATTGTCGTCAGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCAGGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATGGGCCGTAGATATCGGCGTCC > NC_000913/2193277‑2193743 | cccccccGGTACCGAAAATCGGGTCATGGTGACCCAAGTTACTGCAAATAGCCACACTCATGTTCGCGACAATACCGAGCCCCGGAACCTCGACTTTCTCGAACATCACAATGCCTTTTTTCGCATCGATCAGCGCGATGTC‑CTGCGGGGTG‑GTGACCACGACTGCACCGGTTACTGGAATGT‑TTTGCGCCAGCGTCAAGTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGa < 2:1375272/234‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |