Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,826,738 | A→G | 12.4% | E510G (GAG→GGG) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,826,738 | 0 | A | G | 12.4% | 232.3 / 2.8 | 100 | E510G (GAG→GGG) | recG | ATP‑dependent DNA helicase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/43); new base G (7/9); total (48/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTCCTGAT‑ACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGAT‑GAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGA‑GCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGTCGGCGTTGATGTGCCTAACGCCAGTCTGATGATTATCGAAAACCCGGAGCGTCTGGGTCTGGCGCAGTTACACCAGCTGCGCGGGCGCGTAGGTCGTGGCGC > NC_000913/3826508‑3826975 | cACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTCCTGAT‑ACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCCGGGAAGGGTTGAAAc > 1:555926/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |