| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,992,312 | T→C | 10.7% | L387P (CTC→CCC) | cyaA → | adenylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,992,312 | 0 | T | C | 10.7% | 334.3 / 3.0 | 138 | L387P (CTC→CCC) | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/47); new base C (6/13); total (75/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TGTTACTGAATACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTG > NC_000913/3992076‑3992550 | tgtTACTGAATACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCCGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCg > 1:732770/1‑239 (MQ=255)tgtTACTGAATACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGTTAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGGGCGGGAGGCGCCCAACGAGTTGCCCg > 2:952526/1‑239 (MQ=255)tgtTACTGAATACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTc > 1:169947/1‑238 (MQ=255) ttcTGAATTCCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCGGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTAGTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCAAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcg < 1:147181/237‑1 (MQ=255) atGAATCCCTGACGGCATTTTAAGATTTGCCCCGTCTGGATTGAGGACGGCGCGGCTTCTATTTAAAGGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGAGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGAcgcg < 2:697579/238‑1 (MQ=255) tGAATCCCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:700111/239‑1 (MQ=255) tGAATACCTGGCGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:783399/239‑1 (MQ=255) tGAATACCGGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCga < 1:399572/239‑1 (MQ=255) aaTACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACCCgatg > 1:1039802/1‑239 (MQ=255) tACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGCGAGGCGCACAACGAGAGGCTCGAACCgatgag > 2:231106/1‑238 (MQ=255) cTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGGGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACAGCGCTACCTGGACGATTGATCAGGTGCGTGGGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCa > 1:106627/1‑239 (MQ=255) gACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCaga > 1:312963/1‑239 (MQ=255) aCGGGGTTTGAAGTTTTTTCCCGTTTGGATTTAGTTCGTCGCTGCTTTTATTTAAAAGGGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag < 2:451944/239‑1 (MQ=255) cGGTGATTTAAGATTTTACCCGGCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCTTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTTTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag < 1:239746/238‑1 (MQ=255) cGGGGATTGAAGTTTTTACCCGTCTGGATTTAGGTCGGCCGTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag < 2:580258/238‑1 (MQ=255) cGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCGGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGGGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagag < 1:901770/238‑1 (MQ=255) gATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTTCGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGGGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAcc < 1:985490/239‑1 (MQ=255) tttGAAGATTTTACCCGTTTTGGTTTAGTACGGCGCTGCTTTTATTTAAAAGTGGGCGAAAAGCTCAGG‑CGTGAACGCGCCTGGGTAGGCTGGCGGCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTAcc < 2:957565/237‑1 (MQ=255) caggATTTTTCCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTTCTTCTTTTTAAAAGGGGGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGGGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTa < 2:67183/235‑1 (MQ=255) tACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGCCGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGCTACCCGCGCTAACTGGAAGATTGTTCAGGTGCGTGAGGCGCGCAACGAGTTGCCCGACGCGCTGATCCAAGGCCACCGTAACCtaaac > 2:583330/1‑234 (MQ=255) tCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATGGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGGGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCg > 1:67183/1‑234 (MQ=255) aTTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg < 1:952526/238‑1 (MQ=255) aGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGTGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAAt > 1:133709/1‑217 (MQ=255) gTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGAGGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa > 1:635284/1‑238 (MQ=255) tCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGCGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATaa > 1:328052/1‑237 (MQ=255) cGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGAGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGCCGCCATAACCt > 1:368484/1‑239 (MQ=255) tgctTCTATTTAAAAGGGGGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGATCGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGGGCCGGTTAGTGAGCGAATGGGGTTGGGACGGAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTa < 1:473910/238‑1 (MQ=255) cagaTTTAAAAGGGTGCGAAAGGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCGGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGt < 1:208215/235‑1 (MQ=255) aTTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATTTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGtttc > 1:1013270/1‑238 (MQ=255) aaaaGTGGGCGAAAGGC‑CGGCGCGGGAACGCGCCGGGGTGGGGCGGGGGCGCGCAGGGTTGAGCCAGGTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGGGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGGGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCa < 2:143178/239‑1 (MQ=255) ttggaaaaaGCTCCGC‑CGTGAACGCGCCTGCGGGGGCTGGCGTCGCGCAGGGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCg < 2:331405/233‑1 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGGGTTGCTCGACGCGATGATGCCGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGcc > 1:322011/1‑238 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGGTGTTGCAGGGCTACCGGAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCCCAATAACCTTAGCGTCTCCCCCAGTCCCCa > 2:986779/1‑239 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATTCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGGGTCGCAGAAACCTTAGCGTCTCTCCCAGTCCCCa > 1:881702/1‑239 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGGTACCGCAATCCGACCCGCTTTGCGCGTCCCAATAACCTTAGCGTACCCGCCAATCCgac > 2:175736/1‑237 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTTGCAATAACCTTACGGGCTCCGCCAGTCCGCa > 1:305680/1‑239 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCa > 1:964916/1‑239 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACAAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCCCTTTGCGCGCCCAAATAACATAAGCGTCCCGCCCAGTCCGCa > 2:458219/1‑239 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGAACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTGGCAAAAACCTAAAGTTCCCCGCCAGccccag > 2:9661/1‑236 (MQ=255) tgCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGGGAGGCGCACAACGAGTTGCTCCAACCGACGATCAAGAGCTACCCTAAACTGACCCGCTTTGCCGCCCGCCAAAACCCTAGCGCCCCCCCCAGcccccg > 2:946509/1‑236 (MQ=255) gCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAg > 1:26501/1‑239 (MQ=255) tGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGc > 1:956810/1‑213 (MQ=255) aGGCTGGCGTCGCGCCGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTaaagcggat < 1:818898/238‑8 (MQ=255) gCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCGGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGca > 1:574576/1‑238 (MQ=255) gCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAGCTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTCCTGAGCCGTAACCTTGTTGCCGCGt > 1:539623/1‑239 (MQ=255) cgcAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGGATGCCGCGTTTGaa > 1:47124/1‑238 (MQ=255) gCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGTTATCGGCGTGCTTCCGCGTAACCTGTATGCCGCCTTTGAAGCATTCCCCGGt > 1:989472/1‑239 (MQ=255) gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATACCCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCCCAGGCTATCGGCGTGCTGCCCCCGAAGCCGTATGCCGCGTTTTAAGAATTCCCAGGaaaaa > 2:92676/1‑238 (MQ=255) gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGGATTCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAg > 1:575101/1‑239 (MQ=255) aGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACCCGTAAGCTGTATGCCCCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGGGAc > 2:212377/1‑236 (MQ=255) cGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGTTGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGCCTCCGCCAGTCCGCCGGGTATCGGGGTGCTGCGGCGTAAGCTGTGTGCCCGCTTTTAAGACTTACCGGGAAAATGGACGCggg > 2:37728/1‑239 (MQ=255) cGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCCGGATATCGGCGTGCTGACCGGTAAGCTGTATGCCCCCTTTGAACCCTAACCAGGCAAAGGGAccgcgg > 1:472855/1‑234 (MQ=255) aGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCCATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCCGGATCTCGGCGTGCTGACGCGTCAGCTGTATCCCCCGTTTAGAGCATTACCAGGGAAAGGGACGCTGGTa > 2:741178/1‑239 (MQ=255) aGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCCCCGGATATCGGCGTGCTAACCACTAAGGTGTATGCCGCGGTTTAAGCATTACCCGGAAAAgggcgccaggga > 2:49649/1‑228 (MQ=255) gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTCCTGACCCGTAACCTGTATGCCCCGGTTGAAGCATTACCAGGGAAAGGAAAGCTGGGAAAcccc > 2:758220/1‑238 (MQ=255) gTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAAATGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTCCTGACGCGTAAGCCGTATGCCCGGTTTGCAGCCTTACCAGGGAAAGGGACCCTGGTAAAccc > 1:199325/1‑238 (MQ=255) ttGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCg < 1:231106/238‑1 (MQ=255) ggACCAAGCTCGGTGGGCAATGCTCGATAACCGGGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGa < 1:17843/239‑1 (MQ=255) aGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCCCGTTTGAAGCATTACCAGGACAAGTGAGCCGGGAAAACCCCCCAATTTCa > 2:17843/1‑238 (MQ=255) gTCTGGCAATGCTCGATAACGCGGCTAACTGGAAGATTGAGCAGGTGCGTGAGGCGCAAAACGAGTTGCGCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGa < 1:670546/238‑1 (MQ=255) cAATGCGCGAAAACCGGGCTAACTGGAAGATTGTGCGGGGTGGTGAGGCGCACAACGGGGTGCCCGACGCGAGTATGCAGGGCGACCGGAATCTGTGCCGCTTTGCGCGTCGCAATACCCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGAtctctc < 2:114354/238‑1 (MQ=255) cAATCCTCAATACCCCTGTTAACTGGAAGCTTGATCAGGTGCGGGGGCCGCCCAACGGTTTGCTCGACGCGAGGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGAtctctc < 2:374268/238‑1 (MQ=255) cTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCCCAGATTTTCCCCGATCTCTCGGAAcc > 1:631993/1‑239 (MQ=255) aCCGTGCTAACTGGAGGATTGATGAGGTGCGTGGGGCGCACAACGGTTTGCCGGGCGCAATGTTGCAGAGCTACCGTATTCTGTCCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTg < 2:98499/239‑1 (MQ=255) cTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg < 1:250231/91‑1 (MQ=255) cTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg > 2:250231/1‑91 (MQ=255) tGATCGGGTGCGTGAGGCCCACAACGGGTTGCGCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATAGCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTgccgc < 1:816036/239‑1 (MQ=255) tGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACCCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGCAGCATTACCCGGTAAATGGACGCTGGGAAACCCGCAGATTTTACCCGTTCCCTCGGACACCAATATACCCTTTTTTTAAGTcccgc > 2:687294/1‑239 (MQ=255) aTCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGGTGCAGAGCTACCGTCATCTGATCCGCTCTGCGCGCCGCAATACCCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGTTCACGCCTAACCTGTATGCCCGGCTTAAAGCATTACAAGGGAAATCGCCGCGTGTACACCCCCCGGTTTTCCCCCCTCGCCCGGAACACAACCTCACCTTTCTTTAtgagagcccg > 2:14562/1‑231 (MQ=255) cAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGGTACGCTGGTAAACCCGCCGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCcc‑cgg > 1:393770/1‑238 (MQ=255) ggggtcGTGGGGCCCACAAGGTGTTGCCCGACGGGATGATGCAGAGCTACCCTAACCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgc‑cgggc < 2:312963/234‑1 (MQ=255) aGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCCCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCCCGGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCgc‑cgggc > 2:916836/1‑239 (MQ=255) gCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGCCGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAACCTTACCTTTTTTTTTTTGCGCc‑cggcccggg > 2:624024/1‑239 (MQ=255) gCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGGAAACCCGCCGCTTTCACCCGATCTCCCGGAACCGAACCTGACCTTTATTTTTGGTCCgc‑cgggccgg > 2:1012207/1‑238 (MQ=255) cGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCCTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGAACTCTCGGAACCGAATCTGCCCTTTATTTATTTGCTGc‑cgggccgggg > 2:278092/1‑238 (MQ=255) tGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCagac > 2:575390/1‑38 (MQ=255) tGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGATGCATCCCGCGTTTGCAGCATTTACCGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTATCGGACCCGAAAATGAACTTCATTTATATGCCCCAcggaccgggca > 2:35535/1‑238 (MQ=255) ggggCCCACACCGGGTGGCCCGGCCCGGTGAGGCGGGGCTACTGTAATCGGGTCCGTTTTGGGGGTCGCAATACCCTTAGGGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGGATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTaa < 2:1039802/237‑1 (MQ=255) aGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg > 1:264143/1‑64 (MQ=255) aGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGcgcg < 2:264143/64‑1 (MQ=255) cgcACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGGGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGCGACCGAATTCGCCCCTTTTTTTTTTGCCGC‑CGGGGCGGGGTaa > 2:713411/1‑235 (MQ=255) gcccaccgggTTGCCCGGCGGGATGATGCCGAGCTCCCGTAATCCGATCGGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGtt < 2:369545/230‑1 (MQ=255) gcaaaaggggTTGCGCGGCGCGAGGAGGCAGGGGTACCATAATCTGGTCCGCTTTGGGTGTCGAAATAACCTTGGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGtt < 2:989472/230‑1 (MQ=255) cgcaccGAGTTGCTCGTCGCAGTGATGCAGAGCTACCGTAATCTGACCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTGGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAGCCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTc < 1:940502/234‑1 (MQ=255) cacaACGGGTGGACCGACGCGAGGATGCAGAGCTACCGGAATTTGACCCGTTTTGCGCGGCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTc < 1:986779/239‑1 (MQ=255) acaACGGGTTGCTCGACGGGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTc < 1:758220/238‑1 (MQ=255) acaACGGGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTTGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTc < 1:43481/238‑1 (MQ=255) acaACGATTTGCCCGACGCGATGATGCAGGGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCGCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTc < 1:713411/238‑1 (MQ=255) aaCGGGTTGCTCGACGGGATTGTGCAGAGCTACCGTAATCTGACCCGGTTTGCGCGTCGAAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAgg < 1:601275/239‑1 (MQ=255) aCGGGTTGCCCGACGGGGTGATGCAGGGTGTCCGTAATTTGACCCGCTTTGCGGGTCGCAATAACCTTAGGGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGt < 2:393770/239‑1 (MQ=255) tttGCTCCACGAGTGGATTGAGATCTCCCGGAATTTGATCCGCTTTGCGCGTCGAAATAACCTTGGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGAAATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCGGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 2:199325/238‑1 (MQ=255) ttGCTCGAGGGGATGATGCCGGGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGGGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:221445/238‑1 (MQ=255) ttGCTCGAGGCGATGATGCAGAGCTAACGTAATCTGATCCGGTTTGCGCGTCCCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:705759/238‑1 (MQ=255) ttGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:583330/238‑1 (MQ=255) ttGCTCGACCCGATGATGCAGAGCTACCGTAATTTGATCCGTTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCCCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:105117/238‑1 (MQ=255) ttGCCCGACGCGATGATGCAGAGCTCCCCTAAGCTGACCCGTTTTGCTGGTCGCAATAACCGTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:458219/238‑1 (MQ=255) ttGCCCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATACCCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:624024/238‑1 (MQ=255) tGCTCGACGGGATGAGGCAAGGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTAACAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:946509/237‑1 (MQ=255) gCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGAATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCAATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTAATTTATGTGCCGC‑CGGGCGGGGCTAACCGGTCCGGTTGGTa > 1:760914/1‑237 (MQ=255) tCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGGAAAGTGACGCTGGGAAACCCGCAGATTTCCACCGATCTCCCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTTTGTGCCCC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCCGGTTGGTacatg > 2:830211/1‑235 (MQ=255) | TGTTACTGAATACCTGACGGCGATTGAAGATTTTACCCGTCTGGATTTAGTACGTCGCTGCTTCTATTTAAAAGTGTGCGAAAAGCTCAGC‑CGTGAACGCGCCTGCGTAGGCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGC‑CGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTG > NC_000913/3992076‑3992550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |