Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,414,920 | 0 | T | G | 11.5% | 284.7 / 3.1 | 121 | F216V (TTT→GTT) | aidB | DNA alkylation damage repair protein; flavin‑containing DNA binding protein, weak isovaleryl CoA dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/54); new base G (16/3); total (64/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAAT‑GGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAA > NC_000913/4414684‑4415154 | tGACCTTTGCCGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGTTGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGACGAGGGCGCTTATCGGATGGGGGGGCCTAAAT‑GGgtt > 1:668513/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |