Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 541,102 | A→T | 15.4% | M180L (ATG→TTG) | ybbY → | putative uracil/xanthine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 541,102 | 0 | A | T | 15.4% | 106.1 / 4.2 | 49 | M180L (ATG→TTG) | ybbY | putative uracil/xanthine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/9); new base T (4/4); total (36/13) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.11e-01 |
TCTCCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTA > NC_000913/540890‑541334 | tctcCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGAGGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGAt < 1:158171/214‑1 (MQ=255) cGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGAACTGGGGTTGTTTATCTTCCTg > 1:1072995/1‑238 (MQ=255) tGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCa > 1:17854/1‑238 (MQ=255) aCGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCTGCCTCT‑CGGGGGCGGGGTGGTGCCTGGGTCTGGGCATGATTATCTTCCTCCCGCAACg > 2:551813/1‑239 (MQ=255) ttAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGGGATTTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCCACCTTTTTCCCGtttgggc > 2:198878/1‑234 (MQ=255) aTTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGGGATGTGCCTGGTACTTGCGGTGATTATCTTCCTGCCGCCACGTTTTGCCCGTTATGGCCGGCTgg > 2:868530/1‑239 (MQ=255) ttAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGTACTGGCGATGGTTATCTTCCTGCCCCCACGTTTTGCCCGTTAAGGCCCGCTGGt > 2:840131/1‑239 (MQ=255) cGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGTCGCTGCTTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCCGCTGGTCGGCTCCAt > 1:397360/1‑239 (MQ=255) ttATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCCCCCTAACCggttggtt > 1:1084296/1‑239 (MQ=255) gCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGttgttggtgg > 1:127180/1‑235 (MQ=255) gCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTgg > 1:896022/1‑238 (MQ=255) gCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGGGGCGGCGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGGTATGGCCGGCTGGTCGGCCCCCTAACCGGCTGGTGGTTGTGGt > 2:346809/1‑239 (MQ=255) gCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGGGCCGGTGATGTGCCTGGTACTGGGGCTGAATATCTTCCTTGCGCAACGGTTTGCCCGTTATTGCCTCCTGGTCGGGACCCAAAACGCCGGGttgttggtgg > 2:1018450/1‑235 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCATTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGAGCCTTGTACTGGCGCTGATTAGCTTCCTGCGGCAACGTTTTGCCCGTTATGTCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGCTTGTTGTGGt > 1:1029973/1‑237 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGGCTGCTGGTAGGGACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGt > 1:275299/1‑237 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTACTTGGTAATGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACCTTTTGCCCGTTATGGCCCGCTGGCCGGCACCCTAACCGGGTGgttgtttgggt > 2:83946/1‑232 (MQ=255) cGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGCGTTGTGCCTGGTACTGGCCATGATTACCTTCCTGCCGCCACGGTTTGCCCGTTATGTCCTGCTGGTCGGCACCATAACCCGCTGGTTGTTTTggg > 2:808499/1‑236 (MQ=255) tCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGGGGTACtt > 1:301946/1‑239 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCggca > 1:351448/1‑235 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc > 1:791179/1‑238 (MQ=255) gTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCC‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCAc > 1:784595/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:59975/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:112741/1‑238 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGGGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGc > 1:1000667/1‑238 (MQ=255) tgtggggCGCGCAGTTGACCATTATCTTTTTCAAG‑GGTATGCTGGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGCCCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGct < 1:868530/234‑1 (MQ=255) tGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTCCTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACCCGct > 1:636138/1‑238 (MQ=255) gggCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCg > 1:101651/1‑239 (MQ=255) ggCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCCACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTGCCACTCGCTCTCCgg > 1:11696/1‑239 (MQ=255) gcgcgcAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGACGATTATCTTCCTCCTGCAACGTTTTGCCCGGTTGGGGCTGCGGGTTGGCACCCTAACCGGGTGGTTGTTGTGGGGCTTTGGTTTTCCTTC‑TCTCACTCGcgccgccggg > 2:272589/1‑230 (MQ=255) cgcAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAAGGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAg > 1:361713/1‑239 (MQ=255) tgcccattattttttCAAAGGGTATGGTCGGGCTGCGGTTTGGCATGGCCGACCAGATTTTTAAATTTCGGTTCCCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCa < 1:840131/228‑1 (MQ=255) tATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTTTGGGACTTTTGCTTTCCTTCTTGGCACCCCCCCTCCGGGGGGTTGAACgggaggg > 2:401240/1‑235 (MQ=255) tttCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCCATCGCTCTCCGGTGAGTTGCCCTGGCAGTGGTTc > 1:680580/1‑238 (MQ=255) aaa‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTTTGGCCTGCTGGTCGGCACCATACCCGGCCGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTTCTTCTTCCCACTCGCTCTCCGGTGAGTGGCACTGGCAGGGGGTCCCGcc > 2:513455/1‑238 (MQ=255) tGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGCACTTTTGCTTTCCTTTTTCGCCCTCGCCCTCCGGTGGGTTGCACTGGCAGGGGTTCCCGCCCGGCAgg > 2:570180/1‑238 (MQ=255) gCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCCGTGGCgggg > 1:176633/1‑237 (MQ=255) gCATAGCCGACCTAATTTTTAAAATGTGGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGGGGGGATGGGCCTGGTACTGGGGGTGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGcc < 1:957167/238‑1 (MQ=255) aCCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGcc > 1:976385/1‑57 (MQ=255) aCCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGcc < 2:976385/57‑1 (MQ=255) cccGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTg > 1:787365/1‑132 (MQ=255) ccGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCCTAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCACTCCGGTGGGTTGCCCTGGCAGGGGTTCCCGCTCGGCGCGGGCGGGGGTTTTTTGCCgggggttttttt > 2:887316/1‑230 (MQ=255) taaaaaTTCGGTTCCCGCCGTTTCCGCTTT‑CGGTGGCGGGGTTGTGCCTGGTACGGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGAcggcg < 1:1013575/237‑1 (MQ=255) aaaaTTTGGTTCCCGCCGGTCCCG‑TCTCCGGTGGCGGTGTTGTGCCTGGTTCTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGt < 1:401240/239‑1 (MQ=255) tcccggcgTTCGCTCTCG‑CGGGGGCGGTGTTGTGGCGGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGt < 1:272589/237‑1 (MQ=255) gcgcTTT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACGGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAatat < 1:778443/239‑1 (MQ=255) gcgcTCT‑GGGTGGCGGTGATGGTCCTGGTCTTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAatat < 1:942646/239‑1 (MQ=255) cggcTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAatat < 1:586784/237‑1 (MQ=255) ccGGTGGGGGGAATGGTCCTGGTACTGGCGTTGATTACCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCaa < 1:808499/238‑1 (MQ=255) cGGTGATGGTCCTGGTGCGGGCGGTGATTCTCTTCCTGCCGCAGCGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGGTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTa < 1:488804/238‑1 (MQ=255) | TCTCCGGCGTGCTGACGATGTTGATTGGTTTTAGCGGATTAGGCCATCGCCTGGCACGGTTATTTACGCCGTCGGTGATGGTCTTGTTTATGTTGATGCTGGGCGCGCAGCTGACCACTATCTTTTTCAAA‑GGTATGCTCGGGCTGCCGTTTGGCATAGCCGACCCGAATTTTAAAATTCAGTTACCGCCGTTCGCGCTCT‑CGGTGGCGGTGATGTGCCTGGTACTGGCGATGATTATCTTCCTGCCGCAACGTTTTGCCCGTTATGGCCTGCTGGTCGGCACCATAACCGGCTGGTTGTTGTGGTACTTTTGCTTTCCTTCTTCGCACTCGCTCTCCGGTGAGTTGCACTGGCAGTGGTTCCCGCTCGGCAGTGGCGGTGCTTTGTCGCCGGGAATTATTCTGACGGCGGTGATTACAGGTCTGGTAAATATCAGCAATACCTA > NC_000913/540890‑541334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |