| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,158,048 | A→C | 25.9% | P60P (CCA→CCC) | ptsG → | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,158,048 | 0 | A | C | 25.9% | 70.7 / 3.0 | 60 | P60P (CCA→CCC) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/25); new base C (13/4); total (30/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCCACGCGTGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAA > NC_000913/1157816‑1158284 | tGCCACGCGTGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGGAAACATG‑C‑CCCTGGtt > 1:628599/1‑239 (MQ=255) ccACGCGTGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGCCTTTGTAAACATG‑G‑CACTGAtttt > 1:237197/1‑239 (MQ=255) cgTGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTTCGCCGTTGCAAACATG‑C‑CCCTGtttttttgga > 2:890663/1‑235 (MQ=255) aCGTAAAAAAACCCCCAATACCAAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGATTGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGgtgt < 1:933759/239‑1 (MQ=255) cccATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTTCGATCCGGGTTGCCCTCGGC‑ttt > 1:727630/1‑238 (MQ=255) gAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTTCGCCTTTTCAAACAAG‑CTCACGGTTTTTTGCGCCGGGTGTCCCCCCGGGC‑TTTGCAAAAAAcat > 2:613376/1‑237 (MQ=255) gAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGGCTTTTCAAACATG‑C‑CACCGATTTTTTCGATCGGTGTCGCCCCCGGC‑TTTTCCACTAACAAt > 1:808518/1‑239 (MQ=255) cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAACTCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTGTGATCGGGTTCCGCCCCGGC‑GTTACCAATaaagcgtgg > 1:855484/1‑232 (MQ=255) cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAAAATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCACTAACCATGGc > 1:297269/1‑239 (MQ=255) cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGCCCTTTCAAACATGCC‑CCCTGTTTTTTGAGCTGGGTGT‑GCCCCCTGC‑CTTTCCAAAAACCAAGGc > 2:699957/1‑239 (MQ=255) cACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCCTCTTTGCTACCATT‑C‑CACTCATTTTTTAGATTGGGGTCGCCCCCGCC‑TTTTCCAAAAAACATgg > 1:40964/1‑238 (MQ=255) ctctCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGCTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGGTCCGCCCTTTCGACCATC‑G‑CCCTGCTTTTTGCCATCGGGGGCTCCCCCCGC‑CTTTCCCAAAAAGATGGCgg > 2:908427/1‑238 (MQ=255) tctcAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGCGGGTTCGGCTTTTTCAAAAAGG‑C‑C‑CTGATTTTTTCGGACGGGGTGGCCCTCGGC‑TTTTCCAaaaaaagaggggga > 2:1054994/1‑229 (MQ=255) aTGTTTAAGAATGCATTGGCTACCCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGGTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCATACCGAAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCt < 1:66245/239‑1 (MQ=255) ttAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGGCCTTGCAAACAGGCC‑CATTCTTTTTTGC‑TCCGGGGTCGCCCTCGCG‑TTTACCAATAACAAATGCGTAAccccccgggg > 2:1060390/1‑230 (MQ=255) ttAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCCGCTTTTCAAACATG‑C‑CCATGATTTTTTCGAATGGGGGTGCCCCCGGC‑TTTTCCCAAAACCATGGGGTAACCGCGCGGGcc > 2:624157/1‑239 (MQ=255) ttAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCCGCCTTTCAAACCAG‑C‑CACTGATTTTTTCGGCCGGTGTGTCCCCCCGCTTTTACCAA‑AACCAAGGGGGATCCGCGCTGGcc > 2:951915/1‑239 (MQ=255) ttAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGGTCCGTCTTTGGCAACATG‑G‑CACTAATTTTTGTCATCGGGGGCGCCCTCGGC‑TTTACCCATAACAATGGGGGATCCGCGCGGGcc > 2:668476/1‑239 (MQ=255) tAAGATTGCATTTGCTACCCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGAGTCTGCGGGTATCCGTACTGCCTATCGAAGTTATTCTGGTGGGAGTCGGTTCCGGGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCg < 1:890663/239‑1 (MQ=255) aaaTGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGAAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTGCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAg < 1:804726/238‑1 (MQ=255) cATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGGCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGAGTTTTGCGATCGGTGGTCCCCTCGGC‑TTTACCAAAAAACATGGGGTTTTCGCCCCGGCCGCCgttgtt > 1:670235/1‑239 (MQ=255) cATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCCGCTTTGCCAAAATG‑C‑CCCTGTATTTTGCGGTCGGGGTTGCCCTCGGC‑GTTTCCAATAACGATGGCGTACCCGCCCTGGCCCCCgctgtt > 1:492844/1‑239 (MQ=255) gttAACCTGAAAAGGTTCGGTAAAGCGCTGATGCGCCCGGTACCCGTCCTGCCTATCGGAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTa < 1:624157/237‑1 (MQ=255) cTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACAAG‑C‑CCCTGATTTTTGCGATCGGGGTCGCCCTCGGG‑TTTACCAATAACGATGGCCGATCCCCCCTGGCCGCAGTTGTTTcc > 1:523356/1‑236 (MQ=255) tgaaaagGGTCGGTAAATGGGTGAGTCTGCCGGTGCCCGTTCTGCCTGTGGCAGGTTTTCTGGGGGGCGTCGGTTCCGGGAATTTCAGCTGGCGTCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGcatc < 1:951915/236‑1 (MQ=255) gccaaggtggtggTAAATCGCGGGTGCGCGCGGTATCTGTACTCCCTATCGGTGGTATTGTGGTGGGTTTCGGTGCGGGGAATTCCGGTTGGCTGCCCGACGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGcatc < 2:310699/228‑1 (MQ=255) ggTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTTCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTTCGATCGGTGTCGCCCCCGGC‑TTTTCCAATAACGCAGGCGTATCCCCGCGTGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAAc > 1:367679/1‑239 (MQ=255) tccttgtgtctgcCGGTTTCCGTTCTGCCTTCCGCGGGTTTTTTGGGGGGGGTCGTTCCCGGGATTTTCAGCTGGCGCCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGc < 2:911480/230‑1 (MQ=255) gttGATGGTGCCGTTACCCGTCCTGCCTATCGAAGGTTTTCTGCTGGGCGTTGGTTCCGCAAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGc < 1:946220/235‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCTACCGCGGGTTTTGTGCTGGGGGTCGGTACCGCGAATTTCAGCTGGTTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTa < 1:758121/239‑1 (MQ=255) tATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTTCCAAAACG‑C‑CACCTATTTTTGCGACCGGTGGCGCCCTCGGC‑TTTTCCAATAAAGATTGCGCATCCCCCCTTGCCCCCCGTGTTTCCCATTGCACCCTGGTTAAAACCCTGGCCGCGGGT‑GCCGCCCCCGTATTGCAtttt > 2:74207/1‑237 (MQ=255) tcccAGGTTGTCTGGGGGGCGTGGGTTCCGGCAATTTCATCGGGATGCCCGCCTTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACct < 1:917888/236‑1 (MQ=255) cGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGGGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAAAAACGATGGCCTATCCCCGCGTGCCGCAGTTGTTTCCTCTGGCACAACGGTTAAAACCAATGCCGGGGTT‑GCGCCCCCGGGACTCCAATTAAct > 2:837694/1‑238 (MQ=255) ttCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTTCGCCCTTCTAAACATG‑C‑CACCGCCTTTTTCGCTCGGTGTTGCCCTCGGC‑TTTTCCAATAAAGATGGCCTTTCCGCGCTGGCCCCGGTTGTTGCCCATTGCATCATGGTTAAAACCCTTGCCGGGGTTGGCGCC‑CTGGCACTCCCTTTAACCGGTg‑aaaaa > 2:969512/1‑239 (MQ=255) gctgGGCGTCGGTTCGGCGGTTTTCAGGTGGCTGCCCGCCGTTTTAACGCATGTTATGGCAGAAGCAGGG‑GGTTCCGGCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCg < 1:699957/239‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGCAGCAGGA‑GGTTCCATCCTTGCAAAACAG‑C‑AACAGGTTTTTGCGGTCGGTGACGCGCGCGGC‑TTTACCACTAACGATGGCGTCTCCGCGCTGGCCCGAGTTAGTGTCCATGAGCTCCTGGGTAAAAACATGGAAGTGGAT‑TAGACACTCGTACTGAGTTTACGCTCTG‑AAAAAAtacccgt > 2:809471/1‑233 (MQ=255) ggCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGCCCTTTCCAACAAG‑C‑CCCTGATTTTTGCGAGCCGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTCGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCCTCATGGTTAAAACCACGGCCGGGGGT‑GCGCCCCCGGTACCGCATTTACACGCTG‑aaaaaaaacacc > 2:449906/1‑232 (MQ=255) ttCCGCGCATTTCAGGTGGCTGCCCGCCTTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTTGTTGCAAAGATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAacac < 1:502478/238‑1 (MQ=255) tcccGCAAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAacac < 1:635462/236‑1 (MQ=255) gggtggctgCCCCGCGTTTTTTCGCATGTTTGGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTGCGATCGGGGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTgg < 2:523356/236‑1 (MQ=255) ggctcCCCGCCTTTTTAGCCCCTGTTTGGGCAGAAGCGGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTGCGAGCGGGGTCCGCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTa < 2:628599/239‑1 (MQ=255) gcgtcccagccgTTGTGTCGCATTTTATGGCAGAAGCTGGC‑GGTCCCTTGTTTGCAAACATG‑C‑CTGTGAATTTTGCGATCGGTTTCGGCCTCGTC‑TTTACCAATAACGAGTGCGTCTCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGACGCTAAACACCGGGCGGATACTGGCGTa < 2:6696/231‑1 (MQ=255) ccgccgTTGTATCGCATGTTAGGGCAGAAGCAGGG‑GGTTCCGTTTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGGTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGa < 1:497926/239‑1 (MQ=255) ccctcgTTGTAGCGCGTGTAATGGCAGAAGCGGGC‑GGTTCCGTCTTGGCAAACATG‑C‑CACGGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑GTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGa < 1:908427/235‑1 (MQ=255) tttttttCGCTTGTTATGGCAGAAGCGGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAACCATG‑C‑CACTGATTTTTGCGGTCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGAt < 2:959321/233‑1 (MQ=255) cGCATGTTGTGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTcc < 1:1060390/239‑1 (MQ=255) cATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTTCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTTCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCCCGCTGGCCg > 2:671172/1‑109 (MQ=255) cATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCg < 1:671172/109‑1 (MQ=255) aTGTTTGGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCGAAAATG‑C‑CACTGATTGTGGCGATCGGTTTCGCCCGCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGTAGTTGTGGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACCCCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCGCCGGt < 2:627584/239‑1 (MQ=255) tATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTTCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTTCGATCGGGGTCGCCCCCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGGGGTT‑TCGCCACCGGTACTGCATTTACCTCCTGAAAGAAAT‑GCCCCTTAACACCCGGCGGGTACTTGGGTACTCCGAGGGAGTAttttccgcgcgg > 1:542456/1‑228 (MQ=255) aTGGCAGAAGGAGGG‑TGTTCCGTTTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTGGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGAt < 2:42957/239‑1 (MQ=255) tGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAAAGATGGCGTATCCGCGCTTGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGGTAAAACCATGGCCGTGGTT‑TCGCCCCTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCCCCTCTAAAAACCTGGCGGTAACTTGGGTACTCCGAGGGATTATTTCCGGGGCGAt > 1:262212/1‑238 (MQ=255) aGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACGTG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTGGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCa < 1:74207/238‑1 (MQ=255) aaGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGATTTTTTCGATCGGGGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAAAGATTGCGGATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCCATGGCATCATGGGTTAAAACATGGCCGGGGGT‑TGGCCCCTGGGTATGCGTTTTCCTGCCG‑AAGAAAACGCCCCTTAACACCTGGGGGGTACTGGCGTGCTCGGGGGGGGTATCCTCCGTGGGATCGccggg > 2:234605/1‑235 (MQ=255) gctggggggTTCCTTTTTTGCAAACATG‑C‑CCCTGGTTTTTGCGATCGGTTTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGt < 2:262212/232‑1 (MQ=255) gggC‑GGTTCCGTCTTCTCAAACTTG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGCCGCCCTCGGC‑TTTACCAAGAACGATGGCTTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTAc < 2:237197/237‑1 (MQ=255) tCCGTCTTTGAAAAAATG‑C‑CCATGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGT‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTa < 1:670566/238‑1 (MQ=255) tttttGCAAACCTG‑C‑CACTGGTTTTTGGCTTCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTTCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGt < 1:532776/237‑1 (MQ=255) ggaaaCATG‑A‑CAGTGATTTTTGCGGTCGGTGTCGCCCTAGGC‑TTGACCAATAACGATGGCGTAGCCGCGCTGGCCGCAGTTGGTGCCTATGGCATCATGGTGAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTGACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTa < 1:868029/237‑1 (MQ=255) c‑cACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGAGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATAGCACCGTACAGGTTTAACCGGTTCTACCGTATTaa > 1:1046108/1‑239 (MQ=255) | TGCCACGCGTGAGAACGTAAAAAAAGCACCCATACTCAGGAGCACTCTCAATTATGTTTAAGAATGCATTTGCTAACCTGCAAAAGGTCGGTAAATCGCTGATGCTGCCGGTATCCGTACTGCCTATCGCAGGTATTCTGCTGGGCGTCGGTTCCGCGAATTTCAGCTGGCTGCCCGCCGTTGTATCGCATGTTATGGCAGAAGCAGGC‑GGTTCCGTCTTTGCAAACATG‑C‑CACTGATTTTTGCGATCGGTGTCGCCCTCGGC‑TTTACCAATAACGATGGCGTATCCGCGCTGGCCGCAGTTGTTGCCTATGGCATCATGGTTAAAACCATGGCCGTGGTT‑GCGCCACTGGTACTGCATTTACCTGCTG‑AAGAAATCGCCTCTAAACACCTGGCGGATACTGGCGTACTCGGAGGGATTATCTCCGGTGCGATCGCAGCGTACATGTTTAACCGTTTCTACCGTATTAA > NC_000913/1157816‑1158284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |