| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,533,401 | Δ10 bp | intergenic (+21/‑354) | cysK → / → ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2533400 | 2 (0.030) | 58 (0.920) | 48/280 | 0.3 | 95.9% | intergenic (+20/‑364) | cysK/ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
| ? | NC_000913 | 2533411 = | 3 (0.050) | intergenic (+31/‑353) | cysK/ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) | |||||
GCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCG > NC_000913/2533274‑2533553 | gaagatgaaagctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaaatgcACCttt > 2:1113864‑M2/138‑143 (MQ=255) atgaaagctttaccaacaagaatatttaggttatgctaccaccatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaacaatgcACCTTTTTAg > 1:733088‑M2/134‑143 (MQ=255) atgaaagctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttccctgagaaagaattgcaacagtactgccagcttgttaaaaatgcACCTTCTTAg > 2:790666‑M2/134‑143 (MQ=255) atgaaagctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaaatgcACCTTTTTAg < 1:1090167‑M2/10‑1 (MQ=255) atgaaagctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaaatgcACCTTTTTAg < 2:25523‑M2/10‑1 (MQ=255) atgaaagcgttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaaatgcACCTTTTTAg < 1:111615‑M2/10‑1 (MQ=255) gaaagctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagcaagaattgcaacagtaatgccagcttgttcaatatgcACCCTTTTACGt > 1:95021‑M2/132‑143 (MQ=255) ctttaccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaactgcACCTTTTCAGGTGCttt > 2:222600‑M2/127‑143 (MQ=255) taccaacaagaatattgtggttattctaccatcatcgggtgagcgttatttaagcaccgcattgtttgccgatctcttcactgagaaagaattgcaacagtaatgccagcttgttaaaaatgcACCTTTTTAGGTGCtttttt < 1:304725‑M2/20‑1 (MQ=255) 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gcttgttaaaaatgcACCGTGTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGaaaa < 1:369154‑M2/128‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACCTAAAAAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAAGCGTTACAGGAGAAGCCAAAg > 1:137245/1‑143 (MQ=255) aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGCCGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGCATCg > 1:212974/1‑143 (MQ=255) aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGCAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCg > 1:230523/1‑143 (MQ=255) aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTCAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCg < 1:440671/143‑1 (MQ=255) | GCTTTACCAACAAGAATATTGTGGTTATTCTACCATCATCGGGTGAGCGTTATTTAAGCACCGCATTGTTTGCCGATCTCTTCACTGAGAAAGAATTGCAACAGTAATGCCAGCTTGTTAAAAATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAG‑CCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCG > NC_000913/2533274‑2533553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |