New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2449191 = | 58 (0.590) | 3 (0.030) | 3/412 | NT | 5.5% | intergenic (+34/+37) | smrB/yfcO | putative DNA endonuclease/DUF2544 family putative outer membrane protein |
? | NC_000913 | 2449213 = | 48 (0.510) | intergenic (+56/+15) | smrB/yfcO | putative DNA endonuclease/DUF2544 family putative outer membrane protein |
CCTGCCGCCGTGAACATGTGTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTGTT > NC_000913/2448958‑2449429 | gtacgcagctgaatgcaacaggtggttactgccgctgggttgcacagatgataacttttaccgcgtcgggatgtgacaaggcggaagtctcggtcacgccaaatcgacaccctataacggacaaacagttacccgatatggtcgtgcgtgttgataccagcagtatgcagccaatcgattctacttgccggttccagtacatactgaatgagttgtagcccttagctacaccacgcacg < 2:524802‑M1/6‑3 (MQ=255) acgcagatgaatgaaacaggtggttactgccgctgggttgcacagatgataacttttaccgcgtcgggatgtgacaaggcggaagtctcggtcacgccaaatcgacaccctataacggacaaacagttacacgatatggtcgtgcgtgttgataccagcagtatgcagccaatcgattctacttgccggttccagtacatactgaatgagttgtagcccttagatacaccaGGCAggg > 2:898914‑M1/232‑238 (MQ=255) cgcagatgaatgaaacaggtggttactgccgctgggttgcacagatgataacttttaccgcgtcgggatgtgacaaggcggaagtctcggtcacgccaaatcgacaccctataacggacaaacagttacacgatatggtcgtgcgtgttgataccagcagtatgcagccaatcgattctacttgccggttccagtacatactgaatgagttgtagcccttagatacaccaGGCAGGGGc < 1:841679‑M1/9‑1 (MQ=255) cgccgTGAACATGTGTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGa < 1:801368/239‑1 (MQ=255) gAACATGTGTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGcc < 1:3842/238‑1 (MQ=255) gAACATGTGTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGAGGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGcc < 2:1105127/238‑1 (MQ=255) gAACATGTGTGTTGCGCCTGCGGGATGCATGGGCGCGGGAAGTATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCGTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGcc < 2:352135/238‑1 (MQ=255) tgtgTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCcctgcc < 1:225047/239‑1 (MQ=255) tgtgTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCcctgcc < 1:616065/239‑1 (MQ=255) gtTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTgg < 1:354510/239‑1 (MQ=255) 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atatTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTa < 1:1107380/237‑1 (MQ=255) gCTGTGGCTGGCACAACATCTGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGAt < 1:74786/239‑1 (MQ=255) gcACAACATCCGCATTGGATGGCGTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGGGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCGGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTCCGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGATGCATa < 2:680333/239‑1 (MQ=255) 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gAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGcc < 1:255736/239‑1 (MQ=255) tGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTc > 1:724920/1‑238 (MQ=255) gccgGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGa < 1:4895/239‑1 (MQ=255) tGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTGTGGGTAAGGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTAGATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAAGCGATTGGCGGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGCCCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCAGACGCGGTaa < 2:724920/239‑1 (MQ=255) tGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGt < 1:77598/237‑1 (MQ=255) aggagTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTa > 1:742749/1‑238 (MQ=255) gTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTatcat < 1:7089/238‑1 (MQ=255) ttGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCACCACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGACTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCt > 1:318487/1‑239 (MQ=255) ttGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTatcatcg > 1:1152244/1‑238 (MQ=255) cgTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGGGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCaa > 1:1029835/1‑238 (MQ=255) aTGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCCCATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAacca > 1:524802/1‑235 (MQ=255) aTGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTg < 1:999039/239‑1 (MQ=255) tGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGGGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTGt > 2:841679/1‑239 (MQ=255) GGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTGtt > 1:847201‑M1/1‑239 (MQ=255) | CCTGCCGCCGTGAACATGTGTTTTGCGCCTGCGTGATGCATGGGCACGGGAAGCATATTTTGAAGCAACAAACACCGCTGTGGCTGGCACAACATCCGCATGTGATGGCCTTTCATCAGGCACCAAAAGAGTATGGCGGTGATGCGGCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTGTT > NC_000913/2448958‑2449429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |