Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,836,839 | IS5 (–) +4 bp | 47.7% | intergenic (+283/‑111) | yicT → / → setC | pseudogene/putative arabinose efflux transporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 9 (0.190) | 9/438 | NT | 34.2% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3836842 | 17 (0.360) | intergenic (+286/‑111) | yicT/setC | pseudogene/putative arabinose efflux transporter | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 22 (0.460) | 20/438 | NT | 56.0% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 3836839 = | 17 (0.360) | intergenic (+283/‑114) | yicT/setC | pseudogene/putative arabinose efflux transporter |
TTATACGACTATTCTATTTCTTTAACCGCTGGCGAAAAAAACTGACTATAAACTTCACCAATAATCAGACTGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGC > NC_000913/3836606‑3837077 | ataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccctaaga > 1:27152‑M2/234‑236 (MQ=255) ataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCa > 1:162448‑M2/234‑239 (MQ=255) aaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccctaagaga < 2:331343‑M2/8‑6 (MQ=255) tcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccctaagagaga < 1:54537‑M2/10‑8 (MQ=255) aCCAATAATCAGACTGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttc < 2:429032‑M2/239‑59 (MQ=255) ttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTgg > 2:124441‑M2/174‑239 (MQ=255) gccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGt > 1:484710‑M2/172‑238 (MQ=255) catggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTAc < 2:484710‑M2/69‑1 (MQ=255) ctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttcttgtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACt < 2:506051‑M2/81‑1 (MQ=255) ctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAg > 1:316734‑M2/156‑239 (MQ=255) tAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACt > 2:246430/1‑232 (MQ=255) tAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACt < 1:246430/232‑1 (MQ=255) ttCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatg < 1:120652‑M2/237‑90 (MQ=255) ttAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaa > 1:429032‑M2/1‑143 (MQ=255) ttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCg > 1:163045‑M2/130‑226 (MQ=255) ttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCg < 2:163045‑M2/97‑1 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGAc > 2:199552‑M2/126‑188 (MQ=255) ggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGAc < 1:199552‑M2/63‑1 (MQ=255) tATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCaaaaaa < 2:286912/239‑1 (MQ=255) aattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTaata < 2:360442‑M2/48‑1 (MQ=255) aattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTaata > 1:360442‑M2/104‑151 (MQ=255) cggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaaaa < 1:388370‑M2/145‑1 (MQ=255) cggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAAt > 2:478237‑M2/94‑239 (MQ=255) attaatATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaa < 1:380059/220‑1 (MQ=255) attaatATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaa > 2:380059/1‑220 (MQ=255) taatATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctct > 2:120652‑M2/1‑79 (MQ=255) tcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGc < 2:162448‑M2/167‑1 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaa > 1:180174‑M2/53‑195 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaa < 2:180174‑M2/143‑1 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCtt > 2:227867‑M2/53‑237 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCtt > 1:90084‑M2/53‑237 (MQ=255) tCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTc > 1:82556/1‑231 (MQ=255) tCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTc < 2:82556/231‑1 (MQ=255) ttAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgc < 2:266065‑M2/238‑186 (MQ=255) ttAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAACATTGCTTTCTGGTTGTATCATCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGa < 1:96348/239‑1 (MQ=255) gCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTaatacaata > 2:27942/1‑95 (MQ=255) gCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTaatacaata < 1:27942/95‑1 (MQ=255) gCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCt > 2:131593/1‑230 (MQ=255) gCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCt < 1:131593/230‑1 (MQ=255) gCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTAt > 2:79289/1‑239 (MQ=255) cTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgccgtatcatttggtccgcccgaaacag < 1:495602‑M2/239‑195 (MQ=255) cTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACTACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTAtt > 1:481860/1‑239 (MQ=255) ataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttag < 1:500328‑M2/186‑151 (MQ=255) ataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttag > 2:500328‑M2/1‑36 (MQ=255) ataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGCCGGGTATTGCCGgcgc > 2:280364/1‑238 (MQ=255) aaTTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATGGCGGGCGCTCTTCAg > 1:290801/1‑237 (MQ=255) gggacttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCt > 2:258779‑M2/21‑239 (MQ=255) ggCCCTATAATATTGCGCTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcg < 2:474864‑M2/238‑218 (MQ=255) cttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTAc > 2:479982‑M2/17‑237 (MQ=255) ttgttcgcaccttccCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTAGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCt < 1:479982‑M2/224‑1 (MQ=255) ataataTTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGt > 2:416855/1‑239 (MQ=255) tGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAACTACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATAtt > 1:356741/1‑237 (MQ=255) tGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTAc > 2:235910/1‑225 (MQ=255) tGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTAc < 1:235910/225‑1 (MQ=255) gcgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATAtt > 2:10247/1‑236 (MQ=255) gcgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATAtt < 1:10247/236‑1 (MQ=255) cgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGgc > 2:119967/1‑206 (MQ=255) cgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGgc < 1:119967/206‑1 (MQ=255) cgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGa > 2:142345/1‑216 (MQ=255) cgcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGa < 1:142345/216‑1 (MQ=255) gcTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTACTACAATACTCATTCGACTGCTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCATAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGCCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGAATCCTACCCTCAGCATATTCCTc > 1:3342/1‑238 (MQ=255) cTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGc > 2:346906/1‑239 (MQ=255) cTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGc > 1:305194/1‑239 (MQ=255) cTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGc > 1:151315/1‑239 (MQ=255) | TTATACGACTATTCTATTTCTTTAACCGCTGGCGAAAAAAACTGACTATAAACTTCACCAATAATCAGACTGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGC > NC_000913/3836606‑3837077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |